發(fā)布時間：2021-11-20 04:52

　　背景：鼠疫耶爾森氏菌是烈性傳染病鼠疫的病原體，曾給人類帶來了巨大的災(zāi)難。本文報道了對人不致病的鼠疫耶爾森氏菌布氏田鼠疫源地菌株91001全基因組序列，并進行了比較基因組學(xué)分析和初步的蛋白質(zhì)組學(xué)研究。 方法：采用全基因組鳥槍法測定91001菌株的全基因組序列，利用比較基因組方法對91001與另兩株鼠疫耶爾森氏菌（CO92和KIM）的全基因組進行比較研究；同時針對一些有意義的基因在多株鼠疫耶爾森氏菌的中國分離株中進行了驗證；并在基因組研究的基礎(chǔ)上開展了初步的蛋白質(zhì)學(xué)研究。 結(jié)果：91001菌株的基因組包括一條染色體和四個質(zhì)粒。pPCP1質(zhì)粒長度為9，609bp，與參考菌株基本一致；pCD1質(zhì)粒是編碼Ⅲ型分泌系統(tǒng)的質(zhì)粒，長度為70，159bp，編碼情況與參考菌株基本相同，但重排導(dǎo)致了質(zhì)粒的結(jié)構(gòu)與參考菌株存在差異；pMT1質(zhì)粒長度為106，642bp，保留了較多的原始質(zhì)粒片段，毒力相關(guān)基因與參考菌株沒有差異；pCRY質(zhì)粒是本研究中新發(fā)現(xiàn)的質(zhì)粒，在國內(nèi)外研究中未曾報道，這一質(zhì)粒長度為21，742bp，具有獨立復(fù)制能力，有一群編碼Ⅳ型分泌系統(tǒng)的基因。91001菌株的染色體長度為4，59... 

【文章來源】：中國人民解放軍軍事科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：214 頁

【學(xué)位級別】：博士

【部分圖文】：

完成圖繪制階段填補contig之間缺口時，一個%孔PCR板的擴增情況，中間泳道為DNA分子量標準(補&oT141digestoNAMarker，寶生物公司出品);陽性擴增產(chǎn)物純化后以上下游引物分別測序，某些缺口擴增陰性則需要參考別的信息進行組合再擴增

株染色體DNA的I-Ceul酶切PFGE電Ladde「，l泳道為未經(jīng)酶切的染色體DNAA，長度為32kb的片段未能顯示。成91001的基因組包括一條長度017042)，以及四個質(zhì)粒，分別為p7046)，pCDI(長度為70，159bp，登42bp，登錄號為AEO17O45)和pC44)。的鼠疫耶爾森氏菌一般含有三個典;但某些菌株中還有其它非典型質(zhì)株菌的質(zhì)粒分析發(fā)現(xiàn)，20株含有MD左右[’0’];董興齊等人從云南分5.9kb的未知質(zhì)粒，并進行了序個長度為19kb的質(zhì)粒是pPcPI

質(zhì)交換還不是很頻繁，因此非典型質(zhì)粒在鼠疫耶爾森氏菌中見，但仍可觀察到逐漸增多的趨勢【’“2]。cPI質(zhì)粒pPcPI質(zhì)粒是鼠疫耶爾森氏菌中目前己知最小的毒，其編碼的Pla蛋白在鼠疫菌的致病過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用;但些菌株雖然缺失pPCPI質(zhì)粒，但對于小白鼠仍有很強的毒力[l0，述91001菌株的pPePI質(zhì)粒長度為9609bp，NCBI核酸數(shù)據(jù)AEO17046;本研究中以15100序列的第一個堿基作為pPCPI。序列G+C含量為45.26%，在pPCPI質(zhì)粒中共預(yù)測了10個因編號以“pPCP”作為前綴，第一個基因標記為“pPCPol”，遞增，詳細的基因信息見附表1;pPCPI質(zhì)粒的基因示意圖見圖株ppCpl質(zhì)粒與參考菌株CO92和KIM的相應(yīng)質(zhì)粒ALIOFo53945[62，73]同源性極高，僅有少量的單核普酸變異，三個序單比較情況見表9;表中可以看到有三個位點的突變是由于單起的，這種單堿基重復(fù)引起的突變可能是細菌適應(yīng)性進化的一[’0，]。

【參考文獻】：
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