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中華按蚊miRNAs的全基因組鑒定和分類

發(fā)布時(shí)間:2021-09-16 20:31
  小分子RNA(miRNA)是一類小的非編碼RNA,在細(xì)胞凋亡、分化和先天性免疫等生物學(xué)過(guò)程中發(fā)揮著重要作用。中華按蚊是中國(guó)和東南亞國(guó)家分布最廣的瘧疾傳播媒介,本研究采用生物信息學(xué)方法注釋了中華按蚊基因組的小分子RNA,測(cè)序和鑒定了7個(gè)樣本的小分子RNA。這7個(gè)樣本來(lái)自實(shí)驗(yàn)室擬除蟲(chóng)菊酯感性品系、3個(gè)野外擬除蟲(chóng)菊酯抗性群體和3個(gè)野外擬除蟲(chóng)菊酯感性群體;诨蚪M序列共鑒定出272個(gè)miRNA,總長(zhǎng)為24 978 bp,占基因組的0.009%。從這7個(gè)樣本的測(cè)序和注釋中,共鑒定出62個(gè)已知的miRNA和432個(gè)新的miRNA。這些樣本間已知miRNA的數(shù)量沒(méi)有明顯的差異,說(shuō)明這些已知的miRNA非常普通的,表達(dá)量最高。在實(shí)驗(yàn)室和野外樣品之間以及除蟲(chóng)菊酯抗性和感性樣品之間,新miRNA的數(shù)量沒(méi)有明顯的差異。本研究提供了中華按蚊miRNA的信息框架,然而,還需要進(jìn)一步的研究來(lái)揭示這些樣品中miRNA種類之間的關(guān)系,以及這些miRNA在不同樣品中對(duì)擬除蟲(chóng)菊酯抗性的調(diào)控機(jī)制。 

【文章來(lái)源】:寄生蟲(chóng)與醫(yī)學(xué)昆蟲(chóng)學(xué)報(bào). 2019,26(02)

【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)

【文章目錄】:
1 Materials and Methods
    1.1 Genome sequence resource of Anopheles sinensis
    1.2 Small RNA sequencing of field pyrethriod-resistant and -susceptible populations
    1.3 Identification and classification of miRNAs
2 Results
    2.1 Small non-coding RNAs in An. sinensis genome
    2.2 Small RNA sequencing from the individual libraries in Anopheles sinensis
    2.3 Known and novel miRNAs from seven individual libraries
3 Discussion


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]中華按蚊的分子鑒定標(biāo)準(zhǔn)[J]. 楊飛龍,李旭東,閆振天,陳斌.  重慶師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(04)



本文編號(hào):3397246

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