人呼吸道合胞病毒（Human respiratory syncytial virus,HRSV）是每年引起嬰幼兒和老年人下呼吸道感染的主要病毒性病原,在全球造成了高疾病負(fù)擔(dān),明確RSV流行毒株的遺傳背景是其流行病學(xué)研究和預(yù)防控制的基礎(chǔ)。為了解HRSV蘭州分離株RSV B/LZ11/12的全基因組序列、分子結(jié)構(gòu)特征及遺傳變異情況,本研究對其全基因組進(jìn)行擴(kuò)增克隆和測序后,與GenBank中相關(guān)的參考毒株序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹并進(jìn)行遺傳進(jìn)化及相似性分析。針對其主要蛋白F、G和SH的氨基酸進(jìn)行了比對和差異分析,并對F蛋白的N-糖基化位點(diǎn)進(jìn)行分析。結(jié)果表明B/LZ11/12與B亞型RSV的核苷酸同源性高達(dá)99%以上,其基因組全長15 275bp,具有RSV的所有結(jié)構(gòu)特征。遺傳進(jìn)化分析顯示,B/LZ11/12與B/GZ/13-730、B/England138/2016和SC2225同屬于一個(gè)分支,提示親緣關(guān)系最近。G基因遺傳進(jìn)化樹表明該毒株屬于RSV B亞型BA9基因型。主要氨基酸位點(diǎn)分析顯示該毒株的G基因和F基因均具有一個(gè)特有的變化,即Glu87Gly和Val243Ala的氨基酸替換。F蛋白N-糖基... 

【文章來源】：病毒學(xué)報(bào). 2019,35(04)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
材料與方法
    1毒株及菌株
    2主要試劑
    3引物的設(shè)計(jì)與合成
    4全基因擴(kuò)增克隆及測序
    5序列編輯及分析
    6 F蛋白N-糖基化位點(diǎn)分析
結(jié)果
    1全基因組RT-PCR擴(kuò)增克隆及測序
    2核苷酸序列及其同源性分析
    3全基因組系統(tǒng)發(fā)生樹分析
    4 G基因系統(tǒng)發(fā)生樹分析
    5核苷酸相似性分析
    6 F蛋白N-糖基化位點(diǎn)分析
討論



本文編號：3201476