GII.P21/GII.3型重組諾如病毒的分子特征分析
發(fā)布時(shí)間:2021-04-27 23:44
目的 對(duì)兩株GII.P21/GII.3型重組諾如病毒的主要基因片段進(jìn)行擴(kuò)增,并對(duì)其分子特征進(jìn)行初步分析。方法 利用普通RT-PCR對(duì)兩個(gè)毒株的部分聚合酶區(qū)及完整衣殼蛋白區(qū)片段進(jìn)行擴(kuò)增和序列測(cè)定。通過BioEdit及MEGA軟件進(jìn)行序列比對(duì)及進(jìn)化分析,Simplot軟件進(jìn)行重組位點(diǎn)分析。結(jié)果 序列分析顯示,2株諾如病毒在聚合酶區(qū)與衣殼蛋白區(qū)均和2009—2011年的越南株處于同一小的分支,該分支毒株間的相似性分別為97.3%~98.9%及96.8%~98.1%;可能的重組位點(diǎn)在第701位核苷酸,位于病毒的開放讀碼框架1上;各簇毒株均出現(xiàn)不同程度的氨基酸位點(diǎn)突變,3個(gè)受體結(jié)合位點(diǎn)及兩個(gè)抗原位點(diǎn)無變異,但與受體結(jié)合位點(diǎn)II相鄰的氨基酸385位點(diǎn)出現(xiàn)了變異。結(jié)論 江蘇省存在GII.P21/GII.3型諾如病毒的感染。
【文章來源】:國際病毒學(xué)雜志. 2019,(04)
【文章頁數(shù)】:4 頁
本文編號(hào):3164371
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