弓形蟲乳酸脫氫酶2結(jié)構(gòu)與功能的生物信息學分析
發(fā)布時間:2021-03-30 22:07
目的預(yù)測在NCBI Protein文庫中登錄號為AAC46863的弓形蟲乳酸脫氫酶2(LDH2)蛋白序列的結(jié)構(gòu)和功能特征及其在免疫診斷和疫苗研究方面的應(yīng)用前景。方法利用NCBI和ExPaSy等生物信息學網(wǎng)站在線分析工具和MEGA7及Vector NTI等軟件包,分析弓形蟲LDH2的理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)與功能特征。結(jié)果在線軟件ProParam分析該蛋白由326個氨基酸構(gòu)成,平均親水系數(shù)(GRAVY):0.095,可能為疏水性蛋白。SignalP 4.1 Server預(yù)測無信號肽,為非分泌型蛋白。NetPhos 3.1預(yù)測該蛋白有21個磷酸化位點,其中絲氨酸磷酸化位點14個,蘇氨酸磷酸化位點6個,酪氨酸磷酸化位點1個。經(jīng)Vector NTI軟件包多序列比對,發(fā)現(xiàn)弓形蟲有一段特異于人、鼠、牛等其他物種的氨基酸序列TGMPEGKALD。分別用ABCpred Prediction Server、SYFPEITHI軟件預(yù)測該段特異序列很可能為線性B、T細胞表位。結(jié)論弓形蟲LDH2存在較多的磷酸化位點以及一段特異的氨基酸序列,且該段特異氨基酸序列很可能為線性B、T細胞表位,提示LDH2在弓形蟲病的免疫診斷...
【文章來源】:熱帶醫(yī)學雜志. 2019,19(07)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
對弓形蟲及包括人在內(nèi)的其他7個物種乳酸脫氫酶的氨圖5NetPhos3.1Server預(yù)測結(jié)果Fig.5PredictionresultofNetPhos3.1Server2.6多
圖1光鏡下大鼠視網(wǎng)膜形態(tài)結(jié)構(gòu)(HE,×400)Fig.1Morphologicalstructureofratretinaunderlightmicroscope(HE,×400)對照組模型組APS組下圖1:閆豐華,焦祿安,鄭加軍,等.黃芪多糖對糖尿病模型大鼠視網(wǎng)膜病變及血清胱抑素C的影響(正文見第813~816頁)注:A~D為NR2B;E~H為PERK;A、E為生理鹽水組;B、F為右美托咪定組;C、G為生理鹽水電休克組;D、H為右美托咪定電休克組。圖1NR2B、pERK蛋白在各組中的表達(HE,×200)Fig.1ExpressionofNR2BandpERKproteinsineachgroup(HE,×200)ABCDEFGH下圖1:夏海清,金峰,李靜,等.右美托咪定對電休克治療抑郁癥模型大鼠認知功能及NR2BERK信號通路的影響(正文見第817~821頁)
圖1光鏡下大鼠視網(wǎng)膜形態(tài)結(jié)構(gòu)(HE,×400)Fig.1Morphologicalstructureofratretinaunderlightmicroscope(HE,×400)對照組模型組APS組下圖1:閆豐華,焦祿安,鄭加軍,等.黃芪多糖對糖尿病模型大鼠視網(wǎng)膜病變及血清胱抑素C的影響(正文見第813~816頁)注:A~D為NR2B;E~H為PERK;A、E為生理鹽水組;B、F為右美托咪定組;C、G為生理鹽水電休克組;D、H為右美托咪定電休克組。圖1NR2B、pERK蛋白在各組中的表達(HE,×200)Fig.1ExpressionofNR2BandpERKproteinsineachgroup(HE,×200)ABCDEFGH下圖1:夏海清,金峰,李靜,等.右美托咪定對電休克治療抑郁癥模型大鼠認知功能及NR2BERK信號通路的影響(正文見第817~821頁)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]弓形蟲疫苗研究進展[J]. 蔣子陽,董鍇,戴紅,王夢秋,劉燦,陳建平. 熱帶醫(yī)學雜志. 2018(02)
[2]剛地弓形蟲棒狀體蛋白及其核酸疫苗研究進展[J]. 郭玲玲,張曉磊,張進順. 中國病原生物學雜志. 2015(10)
[3]弓形蟲病研究進展[J]. 劉俠,闞松鶴,林青. 動物醫(yī)學進展. 2015(01)
本文編號:3110238
【文章來源】:熱帶醫(yī)學雜志. 2019,19(07)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
對弓形蟲及包括人在內(nèi)的其他7個物種乳酸脫氫酶的氨圖5NetPhos3.1Server預(yù)測結(jié)果Fig.5PredictionresultofNetPhos3.1Server2.6多
圖1光鏡下大鼠視網(wǎng)膜形態(tài)結(jié)構(gòu)(HE,×400)Fig.1Morphologicalstructureofratretinaunderlightmicroscope(HE,×400)對照組模型組APS組下圖1:閆豐華,焦祿安,鄭加軍,等.黃芪多糖對糖尿病模型大鼠視網(wǎng)膜病變及血清胱抑素C的影響(正文見第813~816頁)注:A~D為NR2B;E~H為PERK;A、E為生理鹽水組;B、F為右美托咪定組;C、G為生理鹽水電休克組;D、H為右美托咪定電休克組。圖1NR2B、pERK蛋白在各組中的表達(HE,×200)Fig.1ExpressionofNR2BandpERKproteinsineachgroup(HE,×200)ABCDEFGH下圖1:夏海清,金峰,李靜,等.右美托咪定對電休克治療抑郁癥模型大鼠認知功能及NR2BERK信號通路的影響(正文見第817~821頁)
圖1光鏡下大鼠視網(wǎng)膜形態(tài)結(jié)構(gòu)(HE,×400)Fig.1Morphologicalstructureofratretinaunderlightmicroscope(HE,×400)對照組模型組APS組下圖1:閆豐華,焦祿安,鄭加軍,等.黃芪多糖對糖尿病模型大鼠視網(wǎng)膜病變及血清胱抑素C的影響(正文見第813~816頁)注:A~D為NR2B;E~H為PERK;A、E為生理鹽水組;B、F為右美托咪定組;C、G為生理鹽水電休克組;D、H為右美托咪定電休克組。圖1NR2B、pERK蛋白在各組中的表達(HE,×200)Fig.1ExpressionofNR2BandpERKproteinsineachgroup(HE,×200)ABCDEFGH下圖1:夏海清,金峰,李靜,等.右美托咪定對電休克治療抑郁癥模型大鼠認知功能及NR2BERK信號通路的影響(正文見第817~821頁)
【參考文獻】:
期刊論文
[1]弓形蟲疫苗研究進展[J]. 蔣子陽,董鍇,戴紅,王夢秋,劉燦,陳建平. 熱帶醫(yī)學雜志. 2018(02)
[2]剛地弓形蟲棒狀體蛋白及其核酸疫苗研究進展[J]. 郭玲玲,張曉磊,張進順. 中國病原生物學雜志. 2015(10)
[3]弓形蟲病研究進展[J]. 劉俠,闞松鶴,林青. 動物醫(yī)學進展. 2015(01)
本文編號:3110238
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