一個新的膜聯(lián)蛋白亞家族—AnxB1的鑒定及其抗凝血功能的研究
發(fā)布時間:2021-03-23 09:15
cC1是孫樹漢教授利用免疫篩選的方法,從豬囊尾蚴(Cysticercus cellulosae)cDNA文庫中分離到的一個抗原基因。大量的研究證明,cC1不僅是一個重要的保護性抗原,而且可能參與了囊尾蚴細胞絲裂原信號傳導(dǎo)途徑,對于細胞的生長、分化具有重要的生理意義。為進一步探討cC1的生理功能,首先利用生物信息學(xué)(bioinformatics)軟件對cC1進行了序列分析、二、三級結(jié)構(gòu)預(yù)測和基本理化特性預(yù)測。通過核酸水平和氨基酸水平的相似性搜索,發(fā)現(xiàn)cC1同膜聯(lián)蛋白家族(Annexin family)成員的序列相似性達到了40~60%。一般認為,當兩個基因的序列相似性大于30%,那么這兩個基因就可能是同源基因。因此,cC1可能同Annexin基因同源;進一步利用多個蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域數(shù)據(jù)庫進行分析,發(fā)現(xiàn)cC1氨基酸序列中具有四個典型的Annexin重復(fù)區(qū)域。每個重復(fù)區(qū)域由70~100個氨基酸殘基組成,包含一個"M-K/R-G-X-G-T-(38residues)-D/E”的基序;對cC1的二級結(jié)構(gòu)進行預(yù)測,發(fā)現(xiàn)該蛋白以α-螺旋為主,占氨基酸總數(shù)的57.8%。基本沒有β-折疊出現(xiàn);利用同源建模(...
【文章來源】:中國人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)上海市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:129 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
英文摘要
縮略詞表
前言
研究內(nèi)容
第一部分 抗原基因cC1的生物信息學(xué)分析及其結(jié)構(gòu)與功能預(yù)測
一、 摘要
二、 引言
三、 方法
四、 結(jié)果
2.1 基因序列分析
2.1.1 序列相似性檢索與分析
2.1.2 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域分析
2.2 cC1的結(jié)構(gòu)和理化特性分析
2.2.1 cC1的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
2.2.2 同源建模預(yù)測cC1的三維結(jié)構(gòu)
2.2.3 基本理化特性分析
2.3 分子進化
五、 討論
第二部分 一個新的Annexin亞家族—AnxB1的鑒定及其生理功能研究
一、 摘要
二、 引言
三、 方法
四、 結(jié)果
1、 AnxB1的序列分析及結(jié)構(gòu)特征
2+依賴性磷脂結(jié)合活性"> 2、 GST-AnxB1具有Ca2+依賴性磷脂結(jié)合活性
3、 AnxB1是階段特異性表達的基因
4、 GST-AnxB1具有較強的抗凝血活性
五、 討論
第三部分 同源建模法構(gòu)建AnxB1序列缺失突變體及其抗凝血活性分析
一、 摘要
二、 引言
三、 方法
四、 結(jié)果
1、 利用同源建模法構(gòu)建Anx32序列缺失突變體
2、 突變體蛋白在大腸桿菌中的表達、純化
3、 突變體GST-M3,GST-M4保留較強的抗凝血活性
4、 GST-M3,GST-M4的免疫原性降低
五、 討論
第四部分 導(dǎo)向溶栓劑AnxB1-ScuPA的基因構(gòu)建、表達及其活性分析
一、 摘要
二、 引言
三、 方法
四、 結(jié)果
1、 原核表達質(zhì)粒pET28a-anxB1ScuPA和pET28a-ScuPAanxB1的構(gòu)建
2、 融合蛋白AnxB1-ScuPA和ScuPA-AnxB1的表達和初步純化
3、 融合蛋白AnxB1-ScuPA和ScuPA-AnxB1的溶栓活性比較
五、 討論
小結(jié)
文獻綜述—膜聯(lián)蛋白的結(jié)構(gòu)與功能
附錄: 攻讀博士期間發(fā)表的論文
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]豬囊尾蚴抗原DNA疫苗誘導(dǎo)的免疫保護效應(yīng)[J]. 吳丹,郭瀛軍,林懿,孫樹漢. 第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報. 2000(06)
本文編號:3095558
【文章來源】:中國人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)上海市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:129 頁
【學(xué)位級別】:博士
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中文摘要
英文摘要
縮略詞表
前言
研究內(nèi)容
第一部分 抗原基因cC1的生物信息學(xué)分析及其結(jié)構(gòu)與功能預(yù)測
一、 摘要
二、 引言
三、 方法
四、 結(jié)果
2.1 基因序列分析
2.1.1 序列相似性檢索與分析
2.1.2 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域分析
2.2 cC1的結(jié)構(gòu)和理化特性分析
2.2.1 cC1的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測
2.2.2 同源建模預(yù)測cC1的三維結(jié)構(gòu)
2.2.3 基本理化特性分析
2.3 分子進化
五、 討論
第二部分 一個新的Annexin亞家族—AnxB1的鑒定及其生理功能研究
一、 摘要
二、 引言
三、 方法
四、 結(jié)果
1、 AnxB1的序列分析及結(jié)構(gòu)特征
2+依賴性磷脂結(jié)合活性"> 2、 GST-AnxB1具有Ca2+依賴性磷脂結(jié)合活性
3、 AnxB1是階段特異性表達的基因
4、 GST-AnxB1具有較強的抗凝血活性
五、 討論
第三部分 同源建模法構(gòu)建AnxB1序列缺失突變體及其抗凝血活性分析
一、 摘要
二、 引言
三、 方法
四、 結(jié)果
1、 利用同源建模法構(gòu)建Anx32序列缺失突變體
2、 突變體蛋白在大腸桿菌中的表達、純化
3、 突變體GST-M3,GST-M4保留較強的抗凝血活性
4、 GST-M3,GST-M4的免疫原性降低
五、 討論
第四部分 導(dǎo)向溶栓劑AnxB1-ScuPA的基因構(gòu)建、表達及其活性分析
一、 摘要
二、 引言
三、 方法
四、 結(jié)果
1、 原核表達質(zhì)粒pET28a-anxB1ScuPA和pET28a-ScuPAanxB1的構(gòu)建
2、 融合蛋白AnxB1-ScuPA和ScuPA-AnxB1的表達和初步純化
3、 融合蛋白AnxB1-ScuPA和ScuPA-AnxB1的溶栓活性比較
五、 討論
小結(jié)
文獻綜述—膜聯(lián)蛋白的結(jié)構(gòu)與功能
附錄: 攻讀博士期間發(fā)表的論文
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]豬囊尾蚴抗原DNA疫苗誘導(dǎo)的免疫保護效應(yīng)[J]. 吳丹,郭瀛軍,林懿,孫樹漢. 第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報. 2000(06)
本文編號:3095558
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/shiyanyixue/3095558.html
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