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人感染禽流感病毒A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)株HA基因序列分析

發(fā)布時間:2021-02-08 16:33
  目的測定本市首例人感染禽流感病毒A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)株HA基因序列,分析H7N9禽流感病毒HA基因特點(diǎn)。方法采用real-time PCR檢測患者H7N9禽流感病毒核酸,RT-PCR擴(kuò)增病毒HA基因后測定核苷酸序列。結(jié)果實驗室確診麗水首例人感染H7N9禽流感患者。測序得到H7N9禽流感病毒長度為1 683 bp的HA基因核苷酸全序。A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)與我國江浙滬分離株HA基因核苷酸和氨基酸序列相似性都比較高,分別為98.8%99.5%、98.9%99.5%;與浙江雞分離株A/chicken/Zhejiang/C483/2013(H7N9)序列相似性最高。A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)與我國江浙滬H7N9病毒株HA基因序列均處于同一進(jìn)化分支;與浙江外環(huán)境分離株A/environment/Hangzhou/34/2013(H7N9)進(jìn)化關(guān)系最近;與浙江雞分離株A/chicken/Zhejiang/C483/2013(H7N9)進(jìn)化關(guān)系次之;與韓國野鳥分離株A/... 

【文章來源】:中國衛(wèi)生檢驗雜志. 2015,25(10)

【文章頁數(shù)】:3 頁

【部分圖文】:

人感染禽流感病毒A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)株HA基因序列分析


人感染H7N9禽流感病毒核酸real-timePCR擴(kuò)增結(jié)果

序列,禽流感病毒


?HA基因溯源結(jié)果對H7N9禽流感病毒HA基因序列進(jìn)行溯源分析顯示:麗水H7N9禽流感病毒分離株A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)與我國江浙滬病毒株HA基因序列均處于同一進(jìn)化分支;與浙江人、外環(huán)境分離株A/Hangzhou/1/2013(H7N9)、A/environ-ment/Hangzhou/34/2013(H7N9)共聚類為一個獨(dú)立的小分支,進(jìn)化關(guān)系最近;與浙江雞分離株A/chick-en/Zhejiang/C483/2013(H7N9)位于同一個亞分支,進(jìn)化關(guān)系次之。與東北亞分離株特別是韓國野鳥分離株A/wildbird/Korea/A3/2011(H7N9)進(jìn)化關(guān)系均比較近;與北美、歐洲禽流感進(jìn)化距離最遠(yuǎn)(圖2)。圖2A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)禽流感病毒HA基因溯源分析3討論甲型流感病毒有著極強(qiáng)的變異性,變異最為頻繁,每隔十幾年就會發(fā)生一次抗原性較大的變異而產(chǎn)生新的毒株[3],其中以血凝素蛋白HA進(jìn)化最快,因為HA是中和抗體的靶子,病毒必須通過快速變異來逃避中和抗體的作用[5]。本研究獲得的A/Zhejiang/LS01/2014(H7N9)HA基因全序列,符合以往H7亞型流感病毒的基因特征,HA基因與近幾年在亞洲特別是我國流行的毒株氨基酸之間具有很高的相似性,說明這些毒株的來源不僅一致且H7N9禽流感病毒迄今為止變異較校其中位于HA0蛋白與病毒毒力相關(guān)的5個糖基化位點(diǎn):30NGT、46NAT、249NDT、421NWT、493NNT(H3位置,下同)高度保守[6]。HA裂解位點(diǎn)為333PEIPKGR↓G340[7],與低致病性禽流感病毒(LPAIV)基因特征一致。HA蛋白受體結(jié)合位點(diǎn)發(fā)生Q226L變異[7],直接導(dǎo)致病毒對α-2,6受體位點(diǎn)結(jié)合能力增強(qiáng),增加了與人類呼吸道上皮細(xì)胞的親和力,更容易感染到人。本研究人感染H7N9禽流感確診患者的流行病學(xué)調(diào)查資料顯示其發(fā)病前有購買及宰殺禽類的接觸史,感染來源明確,序列無論在相似性比?

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]浙江省衢州市禽類職業(yè)暴露人群及外環(huán)境禽流感病毒監(jiān)測分析[J]. 曹國平,占炳東,陳旭富,豐峰.  疾病監(jiān)測. 2013(11)
[2]甲型流感病毒A/Lishui/01/2009(H1N1)株HA基因序列分析[J]. 雷永良,王曉光,柳付明,闕金蓮,陳秀英.  中國衛(wèi)生檢驗雜志. 2010(06)
[3]高致病性禽流感研究進(jìn)展[J]. 郭元吉.  中華實驗和臨床病毒學(xué)雜志. 2006(02)
[4]浙江省人感染H7N9禽流感病毒的基因組序列分析[J]. 陳寅,茅海燕,李榛,徐昌平,高見,馮燕,王欣瑩,嚴(yán)菊英,張嚴(yán)峻,盧亦愚.  中華流行病學(xué)雜志. 2013 (06)



本文編號:3024217

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