應用iTRAQ技術(shù)篩選DNT差異表達蛋白
發(fā)布時間:2017-08-19 00:25
本文關(guān)鍵詞:應用iTRAQ技術(shù)篩選DNT差異表達蛋白
更多相關(guān)文章: 胚胎發(fā)育不良性神經(jīng)上皮腫瘤 蛋白質(zhì)組學 同位素標記相對和絕對定量技術(shù) 生物標記物
【摘要】:目的應用同位素標記相對和絕對定量蛋白質(zhì)組學技術(shù)(iTRAQ)篩選胚胎發(fā)育不良性神經(jīng)上皮腫瘤(DNT)差異表達蛋白。方法將DNT實體組織標本(2例)與正常腦組織標本(2例),各組標本混合后提取蛋白,進行定量和酶解。iTRAQ標記后進行液相串聯(lián)質(zhì)譜分析。通過Mascot軟件進行圖譜分析。結(jié)果實驗匹配到的譜圖數(shù)量是82 300張,其中特有譜圖數(shù)量為57 738張,共鑒定到2 663個蛋白,16 341個肽段,其中含14 993個特有肽段。當?shù)鞍棕S度差異倍數(shù)達到1.3倍以上,且經(jīng)統(tǒng)計檢驗其P值小于0.05時,視為差異蛋白,共鑒定差異蛋白225個,其中48個蛋白上調(diào),177個蛋白下調(diào)。結(jié)論通過iTRAQ技術(shù)分析得到的DNT差異表達蛋白可靠,iTRAQ技術(shù)為篩選出有意義的DNT生物標記物提供了一個良好的平臺。
【作者單位】: 廣州軍區(qū)廣州總醫(yī)院病理科;
【關(guān)鍵詞】: 胚胎發(fā)育不良性神經(jīng)上皮腫瘤 蛋白質(zhì)組學 同位素標記相對和絕對定量技術(shù) 生物標記物
【基金】:廣東省科技計劃基金資助項目(2012B031800177)
【分類號】:R739.4
【正文快照】: 胚胎發(fā)育不良性神經(jīng)上皮腫瘤(dysembryoplasticneuroepithelial tumor,DNT)是位于幕上的膠質(zhì)神經(jīng)元混合性腫瘤,主要發(fā)生在大腦皮質(zhì),WHO分級Ⅰ級,屬于良性腫瘤。組織學上分為單純型、復合型和非特異型3個亞型,后兩者形態(tài)學與星形細胞瘤、少突膠質(zhì)細胞瘤有相似處,有時診斷十分困,
本文編號:697645
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