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液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)在蜱傳腦炎代謝組學(xué)的應(yīng)用研究

發(fā)布時間:2024-05-18 19:29
  目的探討液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)檢測蜱傳腦炎(TBE)患者外周血清代謝物,尋找特征代謝物作為TBE患者早期篩查、診斷檢測指標。了解特征代謝物的代謝通路信息。方法選取30例內(nèi)蒙古林業(yè)總醫(yī)院的TBE患者作為實驗組,30例同期健康體檢者作為正常對照組。采用超高效液相色譜與質(zhì)譜聯(lián)用(UPLC-MS)技術(shù)平臺檢測血清代謝物。將數(shù)據(jù)利用Mzmine2.0軟件進行前處理和歸一化,應(yīng)用SIMCA16.0軟件構(gòu)建正交偏最小二乘法判別分析(OPLS-DA)模型,對TBE組和正常對照組進行代謝物初篩。將代謝物的質(zhì)荷比(m/z)輸入到HMDB數(shù)據(jù)庫及統(tǒng)計學(xué)分析篩選兩組間的特征代謝物。通過繪制ROC曲線及計算特征代謝物的AUC值(以AUC>0.9作為評價指標)評價這些特征代謝物診斷TBE的效能。采用metaboanalyst線上軟件分析,了解TBE患者特征代謝物關(guān)鍵的代謝通路。結(jié)果采用UPLC-MS技術(shù),以O(shè)PLS-DA為區(qū)分模型,篩選出45種與TBE病程相關(guān)的代謝物,產(chǎn)物以脂類為主,包括26類脂類及1種脂類代謝中間產(chǎn)物,以及生物堿、脂肪酸、膽色素等。TBE組與正常對照組比較,有12種代謝物表達降低,33種代謝物表達...

【文章頁數(shù)】:44 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

圖1質(zhì)控樣本的質(zhì)控模型圖

圖1質(zhì)控樣本的質(zhì)控模型圖

液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)在蜱傳腦炎代謝組學(xué)的應(yīng)用研究8中可見,質(zhì)控品均在xSD2的范圍內(nèi)。因此,可以認為儀器在本次研究中分析結(jié)果可靠。圖1質(zhì)控樣本的質(zhì)控模型圖3.3色譜圖分析圖2是兩組樣本中選取的代表樣本總離子流圖(Totalioncurrent,TIC),以便我們更好的觀察兩組樣本間的檢測....


圖2兩組血清樣品的總離子流圖

圖2兩組血清樣品的總離子流圖

液質(zhì)聯(lián)用技術(shù)在蜱傳腦炎代謝組學(xué)的應(yīng)用研究8中可見,質(zhì)控品均在xSD2的范圍內(nèi)。因此,可以認為儀器在本次研究中分析結(jié)果可靠。圖1質(zhì)控樣本的質(zhì)控模型圖3.3色譜圖分析圖2是兩組樣本中選取的代表樣本總離子流圖(Totalioncurrent,TIC),以便我們更好的觀察兩組樣本間的檢測....


圖3-A基于兩組別的PCA模型圖

圖3-A基于兩組別的PCA模型圖

內(nèi)蒙古民族大學(xué)碩士學(xué)位論文9將所得數(shù)據(jù)進行前處理后,導(dǎo)入SIMCA16.0軟件,進行主成分分析(Principalcomponentanalysis,PCA),模型解釋力(R2X=77.8%),預(yù)測力(Q2=63.9%),見圖3-A。依據(jù)前處理后數(shù)據(jù)構(gòu)建OPLS-DA模型,見圖3....


圖3-B基于兩組別的OPLS-DA模型圖

圖3-B基于兩組別的OPLS-DA模型圖

內(nèi)蒙古民族大學(xué)碩士學(xué)位論文9將所得數(shù)據(jù)進行前處理后,導(dǎo)入SIMCA16.0軟件,進行主成分分析(Principalcomponentanalysis,PCA),模型解釋力(R2X=77.8%),預(yù)測力(Q2=63.9%),見圖3-A。依據(jù)前處理后數(shù)據(jù)構(gòu)建OPLS-DA模型,見圖3....



本文編號:3977250

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