缺血性腦卒中相關miRNA和靶基因miR-424的分析研究
發(fā)布時間:2023-11-11 15:13
第一部分缺血性腦卒中相關差異miRNA和靶基因的篩選目的:本研究通過生物信息學方法對已發(fā)表缺血性腦卒中相關的mRNA和miRNA高通量數(shù)據(jù)進行整合分析,運用多種工具、算法分析和預測靶向miRNA-mRNA關系,然后用Cytoscape軟件構建由miRNAs和mRNAs組成的生物信息調控網(wǎng)絡,預測miRNA參與調控缺血性腦卒中的關鍵分子通路。方法:首先從GEO數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)檢索并下載源自缺血性腦卒中患者、利用二代測序技術獲得的mRNA和miRNA表達數(shù)據(jù),利用R軟件進行分析,將miRNA表達數(shù)據(jù)進行總體歸一化處理,分析其中的差異表達miRNA,基因本體數(shù)據(jù)庫(Gene ontology,GO)分析分子功能、生物學過程和細胞組通過KEGG數(shù)據(jù)庫,分析基因組序列、功能以及通路信息。采用miRNA靶基因預測工具數(shù)據(jù)庫篩選差異表達的miRNA的靶基因。結果:通過對納入的卒中患者相關的miRNA和mRNA原始數(shù)據(jù)進行分析,篩選差異表達的miRNA及mRNA。共篩選獲得15個差異表達miRNA,其中顯著下調的有10個,顯著上調的有5個。共...
【文章頁數(shù)】:111 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
引言
第一部分 缺血性腦卒中相關差異miRNA和靶基因的篩選
前言
材料與方法
結果
討論
小結
參考文獻
第二部分 缺血性腦卒中候選miRNA的驗證
前言
材料與方法
結果
討論
小結
參考文獻
第三部分 miR-424 參與缺血性腦卒中發(fā)展的分子機制研究
前言
材料與方法
結果
討論
小結
參考文獻
結論
綜述一 腦卒中發(fā)病與預后相關的miRNA研究進展
參考文獻
綜述二 腦血管病臨床研究進展
參考文獻
致謝
個人簡歷
本文編號:3862793
【文章頁數(shù)】:111 頁
【學位級別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
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引言
第一部分 缺血性腦卒中相關差異miRNA和靶基因的篩選
前言
材料與方法
結果
討論
小結
參考文獻
第二部分 缺血性腦卒中候選miRNA的驗證
前言
材料與方法
結果
討論
小結
參考文獻
第三部分 miR-424 參與缺血性腦卒中發(fā)展的分子機制研究
前言
材料與方法
結果
討論
小結
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結論
綜述一 腦卒中發(fā)病與預后相關的miRNA研究進展
參考文獻
綜述二 腦血管病臨床研究進展
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