缺血性腦卒中相關(guān)miRNA和靶基因miR-424的分析研究
發(fā)布時(shí)間:2023-11-11 15:13
第一部分缺血性腦卒中相關(guān)差異miRNA和靶基因的篩選目的:本研究通過生物信息學(xué)方法對(duì)已發(fā)表缺血性腦卒中相關(guān)的mRNA和miRNA高通量數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析,運(yùn)用多種工具、算法分析和預(yù)測(cè)靶向miRNA-mRNA關(guān)系,然后用Cytoscape軟件構(gòu)建由miRNAs和mRNAs組成的生物信息調(diào)控網(wǎng)絡(luò),預(yù)測(cè)miRNA參與調(diào)控缺血性腦卒中的關(guān)鍵分子通路。方法:首先從GEO數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/)檢索并下載源自缺血性腦卒中患者、利用二代測(cè)序技術(shù)獲得的mRNA和miRNA表達(dá)數(shù)據(jù),利用R軟件進(jìn)行分析,將miRNA表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行總體歸一化處理,分析其中的差異表達(dá)miRNA,基因本體數(shù)據(jù)庫(Gene ontology,GO)分析分子功能、生物學(xué)過程和細(xì)胞組通過KEGG數(shù)據(jù)庫,分析基因組序列、功能以及通路信息。采用miRNA靶基因預(yù)測(cè)工具數(shù)據(jù)庫篩選差異表達(dá)的miRNA的靶基因。結(jié)果:通過對(duì)納入的卒中患者相關(guān)的miRNA和mRNA原始數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,篩選差異表達(dá)的miRNA及mRNA。共篩選獲得15個(gè)差異表達(dá)miRNA,其中顯著下調(diào)的有10個(gè),顯著上調(diào)的有5個(gè)。共...
【文章頁數(shù)】:111 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
引言
第一部分 缺血性腦卒中相關(guān)差異miRNA和靶基因的篩選
前言
材料與方法
結(jié)果
討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第二部分 缺血性腦卒中候選miRNA的驗(yàn)證
前言
材料與方法
結(jié)果
討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第三部分 miR-424 參與缺血性腦卒中發(fā)展的分子機(jī)制研究
前言
材料與方法
結(jié)果
討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
結(jié)論
綜述一 腦卒中發(fā)病與預(yù)后相關(guān)的miRNA研究進(jìn)展
參考文獻(xiàn)
綜述二 腦血管病臨床研究進(jìn)展
參考文獻(xiàn)
致謝
個(gè)人簡(jiǎn)歷
本文編號(hào):3862793
【文章頁數(shù)】:111 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
引言
第一部分 缺血性腦卒中相關(guān)差異miRNA和靶基因的篩選
前言
材料與方法
結(jié)果
討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第二部分 缺血性腦卒中候選miRNA的驗(yàn)證
前言
材料與方法
結(jié)果
討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
第三部分 miR-424 參與缺血性腦卒中發(fā)展的分子機(jī)制研究
前言
材料與方法
結(jié)果
討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
結(jié)論
綜述一 腦卒中發(fā)病與預(yù)后相關(guān)的miRNA研究進(jìn)展
參考文獻(xiàn)
綜述二 腦血管病臨床研究進(jìn)展
參考文獻(xiàn)
致謝
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本文編號(hào):3862793
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