1.背景膠質(zhì)瘤是世界范圍內(nèi)難治性惡性腫瘤之一,也是顱內(nèi)最常見的惡性腫瘤,嚴重威脅人類的健康。盡管針對膠質(zhì)瘤的手術、放療及化療等治療方案已獲得較大進展,但膠質(zhì)母細胞瘤患者的中位生存時間依然很低,僅到達14個月左右。為了探索更有效的治療方案,基于大樣本基因組數(shù)據(jù)分析識別在膠質(zhì)母細胞瘤中與預后相關的分子亞型。目前,膠質(zhì)母細胞瘤已被分為四個分子亞型,分別是前神經(jīng)(PN),神經(jīng)(NL),經(jīng)典(CL)和間質(zhì)(MES)。與前神經(jīng)型相比,間質(zhì)型更具有侵略性,并且與不良預后密切相關。此外,放療和化療后的膠質(zhì)瘤可發(fā)生前神經(jīng)-間質(zhì)轉變。因此,研究前神經(jīng)-間質(zhì)轉變相關機制對于改善膠質(zhì)瘤患者治療方案和預后至關重要。近期,針對于人類不同惡性腫瘤的分子靶向治療已得到迅速的發(fā)展,長鏈非編碼RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)被認為具有潛在的分子治療靶點。lncRNA是長度大于200個核苷酸的非編碼RNA。根據(jù)編碼lncRNA序列在染色體上位置與鄰近基因的關系將lncRNA分為反義、內(nèi)含子、重疊、基因間及未分類lncRNA。隨著測序技術的不斷進步,越來越多的lncRNA被發(fā)現(xiàn),并在腫瘤中異常表...

【文章頁數(shù)】：105 頁

【學位級別】：博士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
英文縮略語
第一部分 :前神經(jīng)-間質(zhì)轉化相關長鏈非編碼RNA標簽對膠質(zhì)瘤惡性表型及預后的影響
    1 前言
    2 材料和方法
        2.1 實驗材料
            2.1.1 膠質(zhì)瘤公共數(shù)據(jù)集
        2.2 實驗分析方法
            2.2.1 相關評分及免疫細胞亞群評分
            2.2.2 GO分析
            2.2.3 基因集富集分析(GSEA)分析
            2.2.4 WGCNA和模塊識別
            2.2.5 篩選核心基因
            2.2.6 PMT相關lncRNA標簽的構建
        2.3 統(tǒng)計分析方法
    3 實驗結果
        3.1 PMT評分與膠質(zhì)瘤惡性程度相關
        3.2 通過WGCNA分析識別PMT相關的lncRNAs
        3.3 建立PMT相關lncRNA的預后風險標簽
        3.4 PMT相關的lncRNA風險標簽與膠質(zhì)瘤患者的臨床和分子特點密切相關
        3.5 PMT相關的lncRNA標簽在高級別膠質(zhì)瘤不同分組隊列中的預后價值
        3.6 PMT相關的lncRNA標簽相關功能分析
        3.7 高風險評分的膠質(zhì)母細胞瘤具有更強的免疫抑制
        3.8 構建PMT相關lncRNA-miRNA-mRNA網(wǎng)絡
    4 討論
    5 結論
第二部分 :長鏈非編碼LINC01503對膠質(zhì)瘤惡性表型影響及機制研究
    1 前言
    2 材料和方法
        2.1 實驗材料
            2.1.1 膠質(zhì)瘤樣本測序數(shù)據(jù)
            2.1.3 試劑
            2.1.4 細胞系
        2.2 實驗分析方法
            2.2.1 生物信息學分析方法
            2.2.2 細胞轉染
            2.2.3 實時定量聚合酶鏈鎖反應(qRT-PCR)
            2.2.4 蛋白免疫印記
            2.2.5 細胞增殖、遷移和侵襲分析
            2.2.6 巨噬細胞遷移
        2.3 統(tǒng)計分析方法
    3 結果
        3.1 LINC01503在膠質(zhì)瘤惡性表型中高表達
        3.2 LINC01503 表達下調(diào)可抑制GBM細胞的惡性行為
        3.3 LINC01503相關的生物功能及通路
        3.4 LINC01503 參與膠質(zhì)瘤細胞PMT進程
        3.5 LINC01053 影響GBM微環(huán)境中免疫細胞分布
        3.6 LINC01053 增強GBM免疫抑制狀態(tài)
    4 討論
    5 結論
第三部分 :長鏈非編碼RNA HOTAIRM1 對膠質(zhì)瘤惡性表型影響及機制研究
    1 前言
    2 材料和方法
        2.1 實驗材料
            2.1.1 病人樣本
            2.1.2 膠質(zhì)瘤公共數(shù)據(jù)集
            2.1.3 試劑
            2.1.4 細胞系
        2.2 實驗分析方法
            2.2.1 生物信息學分析方法
            2.2.2 細胞轉染
            2.2.3 實時定量聚合酶鏈鎖反應(qRT-PCR)
            2.2.4 蛋白免疫印記
            2.2.5 細胞增殖、遷移和侵襲分析
            2.2.6 替莫唑胺敏感性試驗
            2.2.7 lncRNA–miRNA–mRNA網(wǎng)絡的構建
            2.2.8 雙熒光素酶報告基因檢測
        2.3 統(tǒng)計分析方法
    3 結果
        3.1 HOTAIRM1 表達與膠質(zhì)瘤患者臨床及分子特征的關系
        3.2 HOTAIRM1 在膠質(zhì)瘤惡性亞型富集高表達
        3.3 HOTAIRM1 高表達預示膠質(zhì)瘤患者生存預后差
        3.4 HOTAIRM1 在膠質(zhì)瘤中的功能分析
        3.5 HOTAIRM1 可促進膠質(zhì)瘤細胞增殖和侵襲
        3.6 HOTAIRM1 促進膠質(zhì)瘤細胞上皮-間質(zhì)轉化,誘導替莫唑胺耐藥
        3.7 建立HOTAIRM1–miRNA–mRNA網(wǎng)絡
        3.8 HOTAIRM1 高表達與膠質(zhì)瘤獨特的免疫和炎癥表型有關
    4 討論
    5 結論
本研究創(chuàng)新性的自我評價
參考文獻
綜述
    參考文獻
攻讀學位期間取得的研究成果
致謝
個人簡歷



本文編號：3856922