利用外顯子組測序?qū)σ粋隱性遺傳的PME家系進(jìn)行診斷
發(fā)布時間:2023-06-01 19:24
背景:進(jìn)行性肌陣攣癲癇(Progressive myoclonic epilepsies, PME)是一種較為少見的癲癇綜合征,臨床上以頻繁的肌陣攣發(fā)作為最主要表現(xiàn),常伴有全面性強直-陣攣發(fā)作等其它形式的癇性發(fā)作。PME具有高度的臨床及遺傳異質(zhì)性,主要包括翁隆病(Unverricht-Lundborg disease)、Lafora病(Lafora disease)、神經(jīng)元蠟樣脂褐質(zhì)沉積癥(Neuronal ceroid lipofuscinoses, NCL)、肌陣攣癲癇及破碎紅纖維綜合征(Myoclonus epilepsy with ragged red fibers,MERRF)、齒狀核紅核蒼白球路易體萎縮(tentatorubralpallidoluysian atrophy, DRPLA)等癲癇疾病,對早期及不典型PME患者做出具體的癲癇疾病診斷較為困難。 目的:尋找該隱性遺傳的PME家系中的致病突變,從分子遺傳學(xué)水平對該家系做出精確的癲癇疾病診斷。 方法:選擇一個來自江蘇的近親結(jié)婚的隱性遺傳的PME家系,在前期工作中該家系中兩名患者已完善了頭部磁共振、視頻腦電圖、肌電圖等...
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
目錄
第一章 前言
第二章 研究對象、材料與方法
2.1 研究對象
2.2 主要實驗儀器、試劑、軟件、網(wǎng)站
2.2.1 主要實驗儀器
2.2.2 主要使用實驗試劑、耗材
2.2.3 非變性膠電泳及染色主要溶液配制
2.2.4 主要生物醫(yī)學(xué)軟件
2.2.5 主要生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫
2.3 研究方法
2.3.1 外周血基因組DNA的抽提
2.3.2 外周血基因組RNA的抽提
2.3.3 目標(biāo)區(qū)域(靶向基因或外顯子組)測序
第三章 結(jié)果
3.1 家系臨床資料分析
3.1.1 先證者臨床資料
3.1.2 先證者胞妹臨床資料
3.2 全基因外顯子組測序結(jié)果分析及驗證
3.2.1 全基因外顯子組測序結(jié)果數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計
3.2.2 測序數(shù)據(jù)SNP和Indel的檢測和注釋
3.2.3 經(jīng)過數(shù)據(jù)庫過濾后可導(dǎo)致氨基酸改變的變異數(shù)據(jù)分析
3.2.4 利用全基因外顯子組測序數(shù)據(jù)對家系進(jìn)行純合子定位
3.2.5 利用純合子定位區(qū)間對全基因外顯子組測序結(jié)果進(jìn)行篩選
3.2.6 候選致病基因突變在家系中的共分離驗證
3.2.7 候選致病基因突變在正常人中多態(tài)的排除及對SCARB2基因cDNA區(qū)的突變篩查
3.2.8 患者的診斷
A的蛋白功能改變初步分析"> 3.2.9 SCARB2基因c.1270 G>A的蛋白功能改變初步分析
第四章 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
致謝
本文編號:3826897
【文章頁數(shù)】:65 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
目錄
第一章 前言
第二章 研究對象、材料與方法
2.1 研究對象
2.2 主要實驗儀器、試劑、軟件、網(wǎng)站
2.2.1 主要實驗儀器
2.2.2 主要使用實驗試劑、耗材
2.2.3 非變性膠電泳及染色主要溶液配制
2.2.4 主要生物醫(yī)學(xué)軟件
2.2.5 主要生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫
2.3 研究方法
2.3.1 外周血基因組DNA的抽提
2.3.2 外周血基因組RNA的抽提
2.3.3 目標(biāo)區(qū)域(靶向基因或外顯子組)測序
第三章 結(jié)果
3.1 家系臨床資料分析
3.1.1 先證者臨床資料
3.1.2 先證者胞妹臨床資料
3.2 全基因外顯子組測序結(jié)果分析及驗證
3.2.1 全基因外顯子組測序結(jié)果數(shù)據(jù)產(chǎn)出統(tǒng)計
3.2.2 測序數(shù)據(jù)SNP和Indel的檢測和注釋
3.2.3 經(jīng)過數(shù)據(jù)庫過濾后可導(dǎo)致氨基酸改變的變異數(shù)據(jù)分析
3.2.4 利用全基因外顯子組測序數(shù)據(jù)對家系進(jìn)行純合子定位
3.2.5 利用純合子定位區(qū)間對全基因外顯子組測序結(jié)果進(jìn)行篩選
3.2.6 候選致病基因突變在家系中的共分離驗證
3.2.7 候選致病基因突變在正常人中多態(tài)的排除及對SCARB2基因cDNA區(qū)的突變篩查
3.2.8 患者的診斷
A的蛋白功能改變初步分析"> 3.2.9 SCARB2基因c.1270 G>A的蛋白功能改變初步分析
第四章 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
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本文編號:3826897
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