局灶性皮質(zhì)發(fā)育不良基因表達(dá)的生物信息學(xué)及藥物分析
發(fā)布時(shí)間:2021-11-29 10:11
目的局灶性皮質(zhì)發(fā)育不良(focal cortical dysplasias,FCD)的發(fā)病分子機(jī)制尚不明確,因此本研究的目的是發(fā)現(xiàn)潛在的基因標(biāo)記及其靶向藥物,為FCD的進(jìn)一步研究奠定基礎(chǔ)。方法 (1)從基因芯片公共數(shù)據(jù)庫(Gene Expression Omnibus,GEO)中搜索下載FCD相關(guān)基因芯片數(shù)據(jù)集(GSE62019),含有5例FCD患者和3例對(duì)照組的腦組織標(biāo)本。篩選和鑒定FCD的差異表達(dá)基因,利用DAVID在線網(wǎng)站分析基因本體論以及構(gòu)建DEGs間的相互作用網(wǎng)絡(luò),選擇重要的基因模塊進(jìn)行深入分析并篩選出5個(gè)與周圍基因高度相關(guān)的基因作為核心基因。最后,篩選以這些核心基因?yàn)榘悬c(diǎn)的現(xiàn)有藥物。結(jié)果 (1)在GSE62019篩選出777個(gè)DEGs,分別包括364下調(diào)基因和413個(gè)上調(diào)基因。篩選出DEGs中的1個(gè)核心模塊以及挑選出5個(gè)核心基因(C3、SAA1、ANXA1、CXCL2和CCL25)以及這些基因相關(guān)的現(xiàn)有靶向藥物。結(jié)論通過生物信息學(xué)分析表明FCD的發(fā)病機(jī)制錯(cuò)綜復(fù)雜,本研究對(duì)進(jìn)一步探究FCD的發(fā)病機(jī)制以及確定新的候選治療靶點(diǎn)和篩選靶向藥物具有重要意義。
【文章來源】:中風(fēng)與神經(jīng)疾病雜志. 2020,37(10)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
上調(diào)DEGs的GO分析及KEGG分析
下調(diào)DEGs的GO分析及KEGG分析
前5個(gè)核心基因
本文編號(hào):3526321
【文章來源】:中風(fēng)與神經(jīng)疾病雜志. 2020,37(10)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
上調(diào)DEGs的GO分析及KEGG分析
下調(diào)DEGs的GO分析及KEGG分析
前5個(gè)核心基因
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