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利用外顯子組測序篩選一個ARCA家系的致病基因

發(fā)布時間:2021-11-17 21:27
  背景:常染色體隱性遺傳小腦性共濟(jì)失調(diào)(Autosomal recessive cerebellar ataxia,ARCA)是一組比較罕見的單基因遺傳性疾病,以小腦性共濟(jì)失調(diào)為主要臨床表現(xiàn),具有顯著的臨床及遺傳異質(zhì)性,迄今為止,已發(fā)現(xiàn)有20余種亞型。全基因外顯子組測序是最近興起的尋找疾病致病基因的一種高效、經(jīng)濟(jì)的研究方法,對常見和罕見變異具有高度敏感性。目的:本研究對一例常染色體隱性遺傳性小腦性共濟(jì)失調(diào)家系進(jìn)行外顯子組測序分析結(jié)合純合子定位來篩選該疾病的候選致病基因。方法和結(jié)果:我們對家系內(nèi)兩名患者進(jìn)行了外顯子組測序,在2個樣本中檢測到單核苷酸變異位點(diǎn)的數(shù)目分別為10917個和10354個,其中有722個單核苷酸變異位點(diǎn)為兩樣本所共有,插入缺失(Insertion-deletion,Indel)的數(shù)目分別為575個和560個,72個為兩樣本共有。經(jīng)過已知公共數(shù)據(jù)庫的過濾以及純合區(qū)域的定位,最后篩選出8個新發(fā)的純合單核苷酸變異位點(diǎn):SSRP1基因(Intron8,IVS8-10c>t)、TTYH2基因c.710g>a(p.R237H).TNKS1BP1基因c.4015g>... 

【文章來源】:中南大學(xué)湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:65 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 前言
第二章 材料與方法
    2.1 研究對象
    2.2 主要儀器與試劑
    2.3 研究方法
第三章 結(jié)果
    3.1 家系臨床資料
    3.2 全基因外顯子組測序結(jié)果
    3.3 結(jié)果過濾及純合子定位
    3.4 候選基因功能分析
    3.5 Sanger測序初步篩選候選基因
第四章 討論
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
綜述
    參考文獻(xiàn)
附錄
攻讀學(xué)位期間主要的研究成果
致謝



本文編號:3501670

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