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基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序篩選HIE差異表達(dá)基因及其作用機(jī)制研究

發(fā)布時(shí)間:2021-11-10 17:43
  新生兒缺氧缺血性腦。℉ypoxic-ischemic encephalopathy,HIE)是指圍產(chǎn)期窒息所引起的腦損傷,是導(dǎo)致新生兒中樞神經(jīng)系統(tǒng)功能障礙的最常見的疾病之一。缺氧缺血性腦損傷的病理生理改變包括腦細(xì)胞能量代謝衰竭、腦血管自主調(diào)節(jié)障礙、興奮性氨基酸神經(jīng)毒性、氧自由基生成增多、炎性細(xì)胞因子釋放增加及凋亡基因激活等。這些環(huán)節(jié)緊密聯(lián)系,互為因果,彼此重疊,形成惡性循環(huán),最終導(dǎo)致神經(jīng)細(xì)胞死亡。目前治療以支持療法、控制驚厥和治療腦水腫為主,無(wú)特效藥物治療。故亟待深入研究HIE發(fā)病的分子機(jī)制,發(fā)現(xiàn)新的治療靶點(diǎn)與策略。實(shí)驗(yàn)?zāi)康?本研究為明確新生大鼠HIE發(fā)生時(shí)轉(zhuǎn)錄組的差異表達(dá),構(gòu)建差異基因表達(dá)譜;谏镄畔W(xué)方法篩選HIE調(diào)控靶點(diǎn),采用分子生物學(xué)方法驗(yàn)證相關(guān)靶點(diǎn)表達(dá),并探討基于Nrf2調(diào)控對(duì)腦保護(hù)的作用機(jī)制。實(shí)驗(yàn)方法:本研究以7日齡新生大鼠為研究對(duì)象。采用經(jīng)典造模方法,將7日齡新生大鼠麻醉后結(jié)扎左側(cè)頸總動(dòng)脈,術(shù)后恢復(fù)2小時(shí)后置于8%氧濃度的缺氧箱中,缺氧2小時(shí)。采用預(yù)防給藥方式,于造模前3天給藥。術(shù)后24小時(shí)取大腦組織樣本。采用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序構(gòu)建差異基因表達(dá)譜,基于聚類分析、GO及KEG... 

【文章來(lái)源】:吉林大學(xué)吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:122 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序篩選HIE差異表達(dá)基因及其作用機(jī)制研究


生物信息分析流程圖

箱線圖,基因表達(dá),豐度,基因數(shù)量


、高豐度表達(dá)基因。由 FPKM 值的箱線圖,區(qū)域分組(Con 組)和模型組(HIE 組)基因表達(dá)的豐度及范圍內(nèi)包含的基因數(shù)量。由圖 1.2 可知,基因表達(dá)豐 1.3 所示,各組 FPKM>10 的基因均超過 5000 個(gè)。

基因數(shù)量,箱線圖,基因,范圍


圖 1.3 所示,各組 FPKM>10 的基因均超過 5000 個(gè)。圖 1.2 FPKM 值的箱線圖Fig.1.2 Boxplot for FKPM Values

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Nrf2基因敲除對(duì)小鼠蛛網(wǎng)膜下腔出血后小膠質(zhì)細(xì)胞/巨噬細(xì)胞活化的影響[J]. 李桃,王漢東,丁宇,何進(jìn),丁可,陸新宇,徐建國(guó),韋武亭.  醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào). 2015(01)
[2]Molecular mechanism and functional consequences of lansoprazole-mediated heme oxygenase-1 induction[J]. Stephanie Schulz-Geske,Kati Erdmann,Ronald J Wong,David K Stevenson,Henning Schrder,Nina Grosser.  World Journal of Gastroenterology. 2009(35)



本文編號(hào):3487665

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