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基于轉(zhuǎn)錄組測序篩選HIE差異表達基因及其作用機制研究

發(fā)布時間:2021-11-10 17:43
  新生兒缺氧缺血性腦�。℉ypoxic-ischemic encephalopathy,HIE)是指圍產(chǎn)期窒息所引起的腦損傷,是導致新生兒中樞神經(jīng)系統(tǒng)功能障礙的最常見的疾病之一。缺氧缺血性腦損傷的病理生理改變包括腦細胞能量代謝衰竭、腦血管自主調(diào)節(jié)障礙、興奮性氨基酸神經(jīng)毒性、氧自由基生成增多、炎性細胞因子釋放增加及凋亡基因激活等。這些環(huán)節(jié)緊密聯(lián)系,互為因果,彼此重疊,形成惡性循環(huán),最終導致神經(jīng)細胞死亡。目前治療以支持療法、控制驚厥和治療腦水腫為主,無特效藥物治療。故亟待深入研究HIE發(fā)病的分子機制,發(fā)現(xiàn)新的治療靶點與策略。實驗?zāi)康?本研究為明確新生大鼠HIE發(fā)生時轉(zhuǎn)錄組的差異表達,構(gòu)建差異基因表達譜。基于生物信息學方法篩選HIE調(diào)控靶點,采用分子生物學方法驗證相關(guān)靶點表達,并探討基于Nrf2調(diào)控對腦保護的作用機制。實驗方法:本研究以7日齡新生大鼠為研究對象。采用經(jīng)典造模方法,將7日齡新生大鼠麻醉后結(jié)扎左側(cè)頸總動脈,術(shù)后恢復(fù)2小時后置于8%氧濃度的缺氧箱中,缺氧2小時。采用預(yù)防給藥方式,于造模前3天給藥。術(shù)后24小時取大腦組織樣本。采用轉(zhuǎn)錄組測序構(gòu)建差異基因表達譜,基于聚類分析、GO及KEG... 

【文章來源】:吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:122 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

基于轉(zhuǎn)錄組測序篩選HIE差異表達基因及其作用機制研究


生物信息分析流程圖

箱線圖,基因表達,豐度,基因數(shù)量


、高豐度表達基因。由 FPKM 值的箱線圖,區(qū)域分組(Con 組)和模型組(HIE 組)基因表達的豐度及范圍內(nèi)包含的基因數(shù)量。由圖 1.2 可知,基因表達豐 1.3 所示,各組 FPKM>10 的基因均超過 5000 個。

基因數(shù)量,箱線圖,基因,范圍


圖 1.3 所示,各組 FPKM>10 的基因均超過 5000 個。圖 1.2 FPKM 值的箱線圖Fig.1.2 Boxplot for FKPM Values

【參考文獻】:
期刊論文
[1]Nrf2基因敲除對小鼠蛛網(wǎng)膜下腔出血后小膠質(zhì)細胞/巨噬細胞活化的影響[J]. 李桃,王漢東,丁宇,何進,丁可,陸新宇,徐建國,韋武亭.  醫(yī)學研究生學報. 2015(01)
[2]Molecular mechanism and functional consequences of lansoprazole-mediated heme oxygenase-1 induction[J]. Stephanie Schulz-Geske,Kati Erdmann,Ronald J Wong,David K Stevenson,Henning Schrder,Nina Grosser.  World Journal of Gastroenterology. 2009(35)



本文編號:3487665

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