顱咽管瘤差異LncRNA-mRNA表達(dá)譜初步篩查研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-10 06:54
目的:牙釉質(zhì)型顱咽管瘤(Adamantinomatous craniopharyngiomas,ACPs)是鞍區(qū)常見的良性上皮腫瘤,但臨床上具有較強(qiáng)的侵襲性。最新的研究表明CTNNB1基因的突變會引起Wnt/β-Catenin信號通路的過度激活,這種改變成為了ACPs發(fā)生的分子生物學(xué)基礎(chǔ)。目前LncRNA在ACPs中的研究較少。因此,本研究旨在利用新一代測序技術(shù)檢測牙釉質(zhì)型顱咽管瘤中LncRNA-mRNA的表達(dá)譜,并進(jìn)一步篩選及驗(yàn)證ACPs中顯著性差異LncRNA,進(jìn)而預(yù)測ACPs的靶基因,為后期揭示ACPs在發(fā)病、侵襲性生長的分子機(jī)制奠定基礎(chǔ),同時(shí)為ACPs的早期診斷、預(yù)后及治療策略提供新的研究思路。方法:收集2018年2月至2019年1月時(shí)期在南昌大學(xué)第一附屬醫(yī)院神經(jīng)外科進(jìn)行手術(shù)、確診為ACPs患者的樣本(腫瘤核心實(shí)質(zhì)性組織和腫瘤外周包膜組織)。隨機(jī)選擇3例患者的實(shí)質(zhì)及包膜組織進(jìn)行新一代測序檢測LncRNA-mRNA的表達(dá)譜。通過生物信息學(xué)對差異LncRNAs和mRNA進(jìn)行GO注釋及KEGG富集分析。利用分析結(jié)果及文獻(xiàn)研究報(bào)道,選定6個(gè)顯著性差異的LncRNAs,運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量P...
【文章來源】:南昌大學(xué)江西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
LncRNA測序?qū)嶒?yàn)流程
15B.mRNA 差異基因火山圖基因火山圖 A.LncRNAB.mRNA 橫坐標(biāo)為芯片值標(biāo)準(zhǔn)化后某條轉(zhuǎn)錄本在周包膜區(qū)域組織均值間比值倍數(shù)的以 2 為底的對數(shù),縱坐標(biāo)為某條轉(zhuǎn)錄 t 檢驗(yàn) P 值的以 10 為底的負(fù)對數(shù)。紅色點(diǎn)表示上調(diào),藍(lán)色點(diǎn)表示下調(diào),示沒有差異
差異基因聚類圖A.LncRNAB.mRNA以log10(FPKM+1)值進(jìn)行聚類,紅色表示高
本文編號:3486791
【文章來源】:南昌大學(xué)江西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
LncRNA測序?qū)嶒?yàn)流程
15B.mRNA 差異基因火山圖基因火山圖 A.LncRNAB.mRNA 橫坐標(biāo)為芯片值標(biāo)準(zhǔn)化后某條轉(zhuǎn)錄本在周包膜區(qū)域組織均值間比值倍數(shù)的以 2 為底的對數(shù),縱坐標(biāo)為某條轉(zhuǎn)錄 t 檢驗(yàn) P 值的以 10 為底的負(fù)對數(shù)。紅色點(diǎn)表示上調(diào),藍(lán)色點(diǎn)表示下調(diào),示沒有差異
差異基因聚類圖A.LncRNAB.mRNA以log10(FPKM+1)值進(jìn)行聚類,紅色表示高
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