癲癇作為神經(jīng)內(nèi)科常見(jiàn)疾病,發(fā)病機(jī)制尚不清楚,目前觀點(diǎn)認(rèn)為除遺傳、環(huán)境外,突觸重塑、離子通道異常、神經(jīng)元細(xì)胞凋亡以及外傷、炎癥等都可能是癲癇的病因。其中,以苔蘚纖維出芽為基本病理改變的突觸可塑性則是癲癇諸多病理生理過(guò)程共同的基礎(chǔ)。癲癇的反復(fù)發(fā)作導(dǎo)致突觸重塑,形成異常網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu),這種異常的網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)又會(huì)促使癲癇反復(fù)發(fā)作,并最終發(fā)展為難治性癲癇。miRNAs能夠在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控癲癇發(fā)生發(fā)展的多個(gè)環(huán)節(jié),且在癲癇中也存在多種miRNAs的表達(dá)異常。本研究通過(guò)高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)癲癇患者海馬組織中miRNAs表達(dá)譜變化進(jìn)行研究,篩選差異表達(dá)的miRNAs,利用生物信息學(xué)技術(shù)對(duì)這些差異表達(dá)的miRNAs進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),并通過(guò)雙熒光素酶報(bào)告基因驗(yàn)證靶標(biāo)關(guān)系,最后在構(gòu)建的體內(nèi)外模型中研究miRNA-134影響癲癇發(fā)生發(fā)展的具體作用機(jī)制,為癲癇的病因?qū)W研究和抗癲癇藥物開(kāi)發(fā)提供理論基礎(chǔ)。目的:1.研究癲癇患者海馬組織中miRNAs表達(dá)譜的變化,篩選在癲癇中差異表達(dá)的miRNAs并進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè);2.體外培養(yǎng)大鼠原代海馬神經(jīng)元并神經(jīng)元鑒定;構(gòu)建miR-134過(guò)表達(dá)載體和CREB、SYT11、MAPT雙熒光素酶報(bào)告基因... 

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【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

Cleantag堿基質(zhì)量分布圖

基在 reads 中的位置，Y 軸則代表堿基的質(zhì)量值，圖中每點(diǎn)表示達(dá)到此質(zhì)量的堿基數(shù)量，數(shù)量越多顏色越深。本次高通量測(cè)序所得堿基質(zhì)量絕大部分分布在 2以上，說(shuō)明測(cè)序質(zhì)量較好。在小 RNA 長(zhǎng)度分布圖中，X 軸為小 RNA 長(zhǎng)度，軸為小 RNA 所占比例，直接反映測(cè)序數(shù)據(jù)中小 RNA 的種類(lèi)，由圖可見(jiàn)，miRN＞piRNA＞siRNA。表 1.2 各樣品測(cè)序數(shù)據(jù)量統(tǒng)計(jì)S a mple n ame S e quence t ype R a w t ag c ount C l ean t ag c ount P e rcentage(%)T1 SE50 11,977,688 11,035,541 92.13T2 SE50 11,699,993 10,731,760 91.57T3 SE50 12,253,944 11,143,668 90.94C SE50 12,415,591 11,462,527 92.32

吉林大學(xué)博士學(xué)位論文1.2.2 基因組比對(duì)將數(shù)據(jù)過(guò)濾后得到的 clean tag 與包括 miRBase[33]、Rfam[34]、siRNA、piRNA、snoRNA 等在內(nèi)的已知數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)，表 1.3 為比對(duì)統(tǒng)計(jì)，圖 1.3 顯示比對(duì)情況。表 1.3 基因組比對(duì)統(tǒng)計(jì)S a mple n ame T o tal t ag M a pped t ag P e rcentage(%)T1 1 1 ,035,541 1 0 ,915,609 9 8 .91T2 1 0 ,713,760 1 0 ,532,355 9 8 .31T3 1 1 ,143,668 1 0 ,988,303 9 8 .61C 1 1 ,462,527 1 1 ,277,721 9 8 .39


本文編號(hào)：3473144