癲癇作為神經(jīng)內科常見疾病,發(fā)病機制尚不清楚,目前觀點認為除遺傳、環(huán)境外,突觸重塑、離子通道異常、神經(jīng)元細胞凋亡以及外傷、炎癥等都可能是癲癇的病因。其中,以苔蘚纖維出芽為基本病理改變的突觸可塑性則是癲癇諸多病理生理過程共同的基礎。癲癇的反復發(fā)作導致突觸重塑,形成異常網(wǎng)絡結構,這種異常的網(wǎng)絡結構又會促使癲癇反復發(fā)作,并最終發(fā)展為難治性癲癇。miRNAs能夠在轉錄后水平調控癲癇發(fā)生發(fā)展的多個環(huán)節(jié),且在癲癇中也存在多種miRNAs的表達異常。本研究通過高通量測序技術對癲癇患者海馬組織中miRNAs表達譜變化進行研究,篩選差異表達的miRNAs,利用生物信息學技術對這些差異表達的miRNAs進行靶基因預測,并通過雙熒光素酶報告基因驗證靶標關系,最后在構建的體內外模型中研究miRNA-134影響癲癇發(fā)生發(fā)展的具體作用機制,為癲癇的病因學研究和抗癲癇藥物開發(fā)提供理論基礎。目的:1.研究癲癇患者海馬組織中miRNAs表達譜的變化,篩選在癲癇中差異表達的miRNAs并進行靶基因預測;2.體外培養(yǎng)大鼠原代海馬神經(jīng)元并神經(jīng)元鑒定;構建miR-134過表達載體和CREB、SYT11、MAPT雙熒光素酶報告基因... 

【文章來源】：吉林大學吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

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【學位級別】：博士

【部分圖文】：

Cleantag堿基質量分布圖

基在 reads 中的位置，Y 軸則代表堿基的質量值，圖中每點表示達到此質量的堿基數(shù)量，數(shù)量越多顏色越深。本次高通量測序所得堿基質量絕大部分分布在 2以上，說明測序質量較好。在小 RNA 長度分布圖中，X 軸為小 RNA 長度，軸為小 RNA 所占比例，直接反映測序數(shù)據(jù)中小 RNA 的種類，由圖可見，miRN＞piRNA＞siRNA。表 1.2 各樣品測序數(shù)據(jù)量統(tǒng)計S a mple n ame S e quence t ype R a w t ag c ount C l ean t ag c ount P e rcentage(%)T1 SE50 11,977,688 11,035,541 92.13T2 SE50 11,699,993 10,731,760 91.57T3 SE50 12,253,944 11,143,668 90.94C SE50 12,415,591 11,462,527 92.32

吉林大學博士學位論文1.2.2 基因組比對將數(shù)據(jù)過濾后得到的 clean tag 與包括 miRBase[33]、Rfam[34]、siRNA、piRNA、snoRNA 等在內的已知數(shù)據(jù)庫進行比對，表 1.3 為比對統(tǒng)計，圖 1.3 顯示比對情況。表 1.3 基因組比對統(tǒng)計S a mple n ame T o tal t ag M a pped t ag P e rcentage(%)T1 1 1 ,035,541 1 0 ,915,609 9 8 .91T2 1 0 ,713,760 1 0 ,532,355 9 8 .31T3 1 1 ,143,668 1 0 ,988,303 9 8 .61C 1 1 ,462,527 1 1 ,277,721 9 8 .39


本文編號：3473144