目的挖掘癲癇腦內(nèi)星形膠質(zhì)細(xì)胞異常炎性激活的關(guān)鍵信號(hào)分子,為進(jìn)一步闡明神經(jīng)免疫促癇機(jī)理提供生物信息學(xué)基礎(chǔ)。方法 NCBI GEO數(shù)據(jù)庫獲取癲癇動(dòng)物模型（GSE73878）和星形膠質(zhì)細(xì)胞炎性激活細(xì)胞模型（GSE73022）基因芯片結(jié)果,GEO2R在線篩選共有差異表達(dá)基因（DEGs）,DAVID數(shù)據(jù)庫進(jìn)行GO功能模塊和KEGG通路富集分析,STRING數(shù)據(jù)庫和Cytoscape軟件構(gòu)建DEGs蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò),多算法篩選Hub基因,最后利用GEPIA數(shù)據(jù)庫在易發(fā)癲癇的低級(jí)別膠質(zhì)瘤患者中驗(yàn)證。結(jié)果兩芯片交集共獲得72個(gè)DEGs,主要富集在調(diào)控免疫反應(yīng)、細(xì)胞因子活力等過程,病毒感染類似信號(hào)、Toll樣受體信號(hào)等通路;59個(gè)基因可構(gòu)成大的蛋白互作網(wǎng)絡(luò),其中24個(gè)基因組成核心模塊,多算法篩選結(jié)合GEIPA數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn)Gbp3、Ifit3、Irf7、Stat1是Hub基因。結(jié)論癲癇腦內(nèi)星形膠質(zhì)細(xì)胞異常炎性激活與Gbp3、Ifit3、Irf7、Stat1等基因關(guān)系密切,其可能是調(diào)控癲癇腦內(nèi)神經(jīng)免疫促癇過程的新靶點(diǎn)。 

【文章來源】：現(xiàn)代預(yù)防醫(yī)學(xué). 2020,47(23)北大核心

【文章頁數(shù)】：5 頁

【部分圖文】：

共有DEGs篩選

GO和KEGG富集分析

PPI network分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
[1]星形膠質(zhì)細(xì)胞在免疫刺激誘發(fā)的幼年小鼠癲癇發(fā)作易感中的作用及機(jī)制[D]. 秦花萍.浙江大學(xué) 2016



本文編號(hào)：3353929