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MAGOH在膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)及其臨床意義

發(fā)布時(shí)間:2021-07-16 17:44
  目的:探討在不同級(jí)別膠質(zhì)瘤臨床標(biāo)本中mago-nashi同源基因(MAGOH)的表達(dá)量之間的關(guān)系及其與患者治療預(yù)后的相關(guān)性分析,期待本研究結(jié)果能為膠質(zhì)瘤患者的診療提供相關(guān)理論依據(jù)。方法:在CGGA mRNAseq FPKM數(shù)據(jù)庫和CGGAmRNA microarray數(shù)據(jù)庫中運(yùn)用R語言進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘MAGOH的相關(guān)生物學(xué)信息,并對(duì)不同級(jí)別膠質(zhì)瘤組織中MAGOH的表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。通過Real-time-PCR(qPCR)技術(shù)檢測(cè)包含48例病理診斷為不同級(jí)別膠質(zhì)瘤臨床標(biāo)本和10例正常腦組織標(biāo)本中MAGOH的表達(dá)水平,針對(duì)MAGOH在不同標(biāo)本中的表達(dá)水平分析其表達(dá)差異性,并就此差異性對(duì)其與膠質(zhì)瘤的病理分級(jí)及其治療預(yù)后作出相關(guān)性分析。結(jié)果:在CGGA mRNAseq FPKM數(shù)據(jù)庫和CGGAmRNA microarray數(shù)據(jù)庫中:MAGOH的表達(dá)量隨膠質(zhì)瘤組織WHO分級(jí)的增高而上調(diào),即膠質(zhì)瘤組織的WHO分級(jí)與MAGOH的表達(dá)量呈正相關(guān),且MAGOH的表達(dá)量越高,其治療預(yù)后越差。qPCR實(shí)驗(yàn)也證實(shí)了MAGOH在不同級(jí)別臨床膠質(zhì)瘤標(biāo)本中的表達(dá)存在差異性,即隨膠質(zhì)瘤組織病理分級(jí)的增高,MAGOH的表... 

【文章來源】:皖南醫(yī)學(xué)院安徽省

【文章頁數(shù)】:48 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

MAGOH在膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)及其臨床意義


MAGOH的表達(dá)水平與IDH1和TP53突變之間的關(guān)系

相關(guān)性分析,數(shù)據(jù)庫,膠質(zhì)


皖南醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文13獨(dú)立的生物標(biāo)志物來預(yù)判膠質(zhì)瘤放化療療效【11~12】。因此,為了明確膠質(zhì)瘤患者M(jìn)AGOH與MGMT表達(dá)水平之間的關(guān)系,通過利用CGGA數(shù)據(jù)庫中所提供的數(shù)據(jù),本研究對(duì)二者做了共表達(dá)分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn)在CGGA數(shù)據(jù)庫中,MAGOH的表達(dá)量隨MGMT表達(dá)量的增高而出現(xiàn)逐漸增高趨勢(shì),即MAGOH的表達(dá)水平與MGMT的表達(dá)表現(xiàn)出明顯的正相關(guān)關(guān)系(皮爾森相關(guān)系數(shù)=0.440,p<0.01)(圖2)。圖2CGGA數(shù)據(jù)庫中MAGOH與MGMT表達(dá)水平的相關(guān)性分析(此圖引自本人以第一作者身份發(fā)表在右江民族醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào)2019年第四期期刊:MAGOH在膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)及其臨床意義)3.在CGGAmRNAseqFPKM公共數(shù)據(jù)庫中,膠質(zhì)瘤患者M(jìn)AGOH的表達(dá)水平與其WHO分級(jí)呈現(xiàn)出正相關(guān)。我們分別對(duì)CGGAmRNAseqFPKM數(shù)據(jù)庫和CGGAmRNAmicroarray庫中膠質(zhì)瘤患者M(jìn)AGOH表達(dá)水平與其WHO分級(jí)之間的關(guān)系做了分析。結(jié)果顯示,MAGOH的表達(dá)水平在CGGAmRNAseqFPKM數(shù)據(jù)庫中的膠質(zhì)瘤患者中表現(xiàn)出明顯的差異性,且伴隨著膠質(zhì)瘤級(jí)別的增高,MAGOH表達(dá)量亦出現(xiàn)遞增趨勢(shì),即膠質(zhì)瘤患者M(jìn)AGOH的表達(dá)水平與其WHO分級(jí)呈正相關(guān)(圖3A),p<0.001,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。在CGGAmRNAmicroarray數(shù)據(jù)庫中不同級(jí)別膠質(zhì)瘤患者M(jìn)AGOH的表達(dá)數(shù)據(jù)雖然呈現(xiàn)出差異性,但與腫瘤的WHO分級(jí)并未表現(xiàn)出明顯相關(guān)性。結(jié)果顯示MAGOH表達(dá)量在WHOIV級(jí)與WHOⅢ級(jí)膠質(zhì)瘤中皆高于WHOII級(jí),但WHOIV級(jí)中MAGOH表達(dá)量較WHOⅢ級(jí)中MAGOH表達(dá)量略低(圖3B)。因此,為了進(jìn)一步明確膠質(zhì)瘤的WHO分級(jí)與其MAGOH的表達(dá)水平之間的關(guān)系,探討膠質(zhì)瘤組織中MAGOH表達(dá)的臨床意義,我們?cè)O(shè)計(jì)了

膠質(zhì)


皖南醫(yī)學(xué)院碩士學(xué)位論文14qPCR實(shí)驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證。圖3MAGOH的表達(dá)水平與膠質(zhì)瘤WHO分級(jí)的關(guān)系注:(A):在CGGAmRNAseqFPKM數(shù)據(jù)中膠質(zhì)瘤患者M(jìn)AGOH的表達(dá)水平與其WHO分級(jí)之間的關(guān)系;(B):在CGGAmRNAmicroarray數(shù)據(jù)中膠質(zhì)瘤患者M(jìn)AGOH的表達(dá)水平與其WHO分級(jí)之間的關(guān)系。***表示p<0.001。(此圖引自本人以第一作者身份發(fā)表在右江民族醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào)2019年第四期期刊:MAGOH在膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)及其臨床意義)4.MAGOH在膠質(zhì)瘤樣本組織中的表達(dá)水平增高,與膠質(zhì)瘤組織WHO分級(jí)呈正相關(guān)。在CGGA中的兩個(gè)數(shù)據(jù)庫中,膠質(zhì)瘤組織中MAGOH的表達(dá)水平都表現(xiàn)出顯著上調(diào)趨勢(shì)。為了進(jìn)一步探究膠質(zhì)瘤組織中MAGOH的表達(dá)量與WHO分級(jí)之間的關(guān)系,我們通過使用qRT-PCR技術(shù)檢測(cè)正常腦組織組與不同WHO分級(jí)臨床腦膠質(zhì)瘤標(biāo)本中MAGOH的表達(dá)量。結(jié)果顯示MAGOH的表達(dá)量在正常腦組織組中最低;在3組臨床腦膠質(zhì)瘤樣本中,MAGOH的表達(dá)量隨腫瘤樣本W(wǎng)HO分級(jí)的增高而呈現(xiàn)出遞增趨勢(shì),即在腦膠質(zhì)瘤組織中MAGOH的表達(dá)水平與腫瘤WHO分級(jí)呈現(xiàn)顯著正相關(guān)(圖4),p<0.001,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。這一結(jié)果與CGGAmRNAseqFPKM數(shù)據(jù)中MAGOH表達(dá)量與膠質(zhì)瘤WHO分級(jí)呈正相關(guān)結(jié)果相符。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]MAGOH在膠質(zhì)瘤組織中的表達(dá)及其臨床意義[J]. 劉杰,張德龍,毛捷,夏大勇,徐善水.  右江民族醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào). 2019(04)



本文編號(hào):3287465

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