[研究背景]膠質(zhì)瘤（Glioma）是中樞神經(jīng)系統(tǒng)中最常見(jiàn)的原發(fā)性、惡性腫瘤,約占所有原發(fā)性中樞神經(jīng)系統(tǒng)腫瘤的30%,約占中樞神經(jīng)系統(tǒng)惡性腫瘤的80%。其中惡性度最高的是膠質(zhì)母細(xì)胞瘤（glioblastomamultiforme,GBM）,約占膠質(zhì)瘤的一半以上。目前國(guó)內(nèi)外臨床針對(duì)膠質(zhì)瘤患者普遍建議采用“手術(shù)+放、化療”綜合治療方案,但是GBM的中位生存期也仍然只有15個(gè)月左右。雖然近年來(lái)手術(shù)設(shè)備更新、技術(shù)改進(jìn)、放化療技術(shù)的不斷發(fā)展,但是膠質(zhì)瘤的治療效果依舊差強(qiáng)人意,仍然沒(méi)有取得重大突破,同時(shí)膠質(zhì)瘤的明確致病因素仍不清楚,有關(guān)膠質(zhì)瘤發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制研究一直是學(xué)術(shù)界的熱點(diǎn)之一。2013年研究人員對(duì)膠質(zhì)瘤全基因組進(jìn)行了分析,結(jié)合近年來(lái)有關(guān)膠質(zhì)瘤研究的相關(guān)結(jié)果,目前膠質(zhì)瘤常見(jiàn)的突變基因有 PTEN,TP53,EGFR,PIK3CA,PIK3R1,NF1,RB1,IDH1 和 PDGFRA 等,常見(jiàn)易感通道有p53,Rb,PI3K等。除了研究功能基因,非編碼RNA（Non coding RNA）逐漸成為包括腫瘤在內(nèi)的各類(lèi)生物領(lǐng)域研究的熱點(diǎn),有研究表明非編碼RNA（包括micRNA、lncRNA等... 

【文章來(lái)源】：昆明醫(yī)科大學(xué)云南省

【文章頁(yè)數(shù)】：138 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【部分圖文】：

圖１為ＩｎｃＲＮＡ測(cè)序?qū)嶒?yàn)流程圖

物擴(kuò)增偏差等原因，往往導(dǎo)致在測(cè)序過(guò)程中得到的每個(gè)ｒｅａｄ前６－１０個(gè)堿基有較??大的波動(dòng)干擾，這種波動(dòng)干擾屬于正常情況，但是其后續(xù)循環(huán)堿基組成應(yīng)該趨于??平穩(wěn)。如圖３所示。??Ｂａｓｅｓ?ｃｏｎｔｅｎｔ?ａｌｏｎｇ?ｒｅａｄｓ??５〇－?Ｉ??４０??Ｉ?ｒ??０－???０?＇Ｘ?２Ｃ０?ＺＯＯ??Ｐｏｓｉｔｉｏｎ?ｉｎ?ｒｅａｄ（ｂｐ）??圖３堿基組成分布圖??統(tǒng)計(jì)每個(gè)測(cè)序循環(huán)的堿基質(zhì)量，并繪制堿基質(zhì)量分布箱線(xiàn)圖，以便從整體??水平上評(píng)估測(cè)序質(zhì)量。圖中循環(huán)的堿基質(zhì)量平均值用藍(lán)色線(xiàn)代表，藍(lán)色長(zhǎng)方形代??表四分位數(shù)ＩＱＲ（第一四分位點(diǎn)和第三四分位點(diǎn)）的范圍，藍(lán)色長(zhǎng)方形外的黑色水??平線(xiàn)代表質(zhì)量值的上限和下限。堿基質(zhì)量值一般會(huì)隨測(cè)序循環(huán)數(shù)的增加而有所降??低，這種情況多考慮是由于測(cè)序過(guò)程中試劑消耗以及隨著時(shí)間推移酶活性降低導(dǎo)??致的。如圖４所示。??Ｑｕａｌｉｔｙ?ａｌｏｎｇ?ｒｅａｄｓ??３０－??９）??８??Ｗ２０－??１０??Ｐｏｓｉｔｉｏｎ?ｉｎ?ｒｅａｄ（ｂｐ）??圖４堿基質(zhì)量分布圖??同樣道理，由于測(cè)序過(guò)程中引物擴(kuò)增偏差等原因，序列前６－１０個(gè)堿基的錯(cuò)??誤率較高，隨后其趨勢(shì)應(yīng)該趨于平穩(wěn)。但是隨著測(cè)序過(guò)程中化學(xué)試劑的消耗以及??隨著時(shí)間推移酶活性的降低，測(cè)序錯(cuò)誤率又會(huì)逐漸升高。如圖５所示。??２１??

平線(xiàn)代表質(zhì)量值的上限和下限。堿基質(zhì)量值一般會(huì)隨測(cè)序循環(huán)數(shù)的增加而有所降??低，這種情況多考慮是由于測(cè)序過(guò)程中試劑消耗以及隨著時(shí)間推移酶活性降低導(dǎo)??致的。如圖４所示。??Ｑｕａｌｉｔｙ?ａｌｏｎｇ?ｒｅａｄｓ??３０－??９）??８??Ｗ２０－??１０??Ｐｏｓｉｔｉｏｎ?ｉｎ?ｒｅａｄ（ｂｐ）??圖４堿基質(zhì)量分布圖??同樣道理，由于測(cè)序過(guò)程中引物擴(kuò)增偏差等原因，序列前６－１０個(gè)堿基的錯(cuò)??誤率較高，隨后其趨勢(shì)應(yīng)該趨于平穩(wěn)。但是隨著測(cè)序過(guò)程中化學(xué)試劑的消耗以及??隨著時(shí)間推移酶活性的降低，測(cè)序錯(cuò)誤率又會(huì)逐漸升高。如圖５所示。??２１??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Roles of long non-coding RNAs in gastric cancer metastasis[J]. Zi-Guo Yang,Ling Gao,Xiao-Bo Guo,Yu-Long Shi.  World Journal of Gastroenterology. 2015(17)
[2]轉(zhuǎn)錄組與RNA-Seq技術(shù)[J]. 張春蘭,秦孜娟,王桂芝,紀(jì)志賓,王建民.  生物技術(shù)通報(bào). 2012(12)
[3]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒.  遺傳. 2011(11)
[4]新一代高通量RNA測(cè)序數(shù)據(jù)的處理與分析[J]. 王曦,汪小我,王立坤,馮智星,張學(xué)工.  生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2010(08)



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