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腦膠質(zhì)瘤中ppENK基因啟動(dòng)子區(qū)的甲基化狀態(tài)研究

發(fā)布時(shí)間:2021-02-12 13:38
  目的表觀遺傳學(xué)修飾的DNA甲基化在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中起著重要的作用。腫瘤細(xì)胞的發(fā)生常存在多基因的異常甲基化現(xiàn)象,尤其是抑癌基因的高甲基化與腦膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。本研究旨在采用巢氏聚合酶鏈反應(yīng)(nPCR法)和亞硫酸氫鹽修飾后測(cè)序法(BSP法)方法檢測(cè)腦膠質(zhì)瘤組織中候選抑癌基因ppENK基因啟動(dòng)子區(qū)的甲基化狀態(tài),探討ppENK基因啟動(dòng)子的異常甲基化水平在腦膠質(zhì)瘤發(fā)生發(fā)展中的作用以及與臨床病理資料之間的關(guān)系。方法采用巢式聚合酶鏈反應(yīng)(nested polymerase chain reaction nPCR)方法和亞硫酸氫鹽修飾后測(cè)序法(Bisulfite sequence polymerase chain reaction BSP),檢測(cè)32例腦膠質(zhì)瘤組織和10例正常腦組織中ppENK基因啟動(dòng)子區(qū)CpG島的甲基化狀態(tài)。利用所學(xué)統(tǒng)計(jì)學(xué)方法分析ppENK基因啟動(dòng)子的異常甲基化水平與臨床病例資料(病理分級(jí)、年齡、性別、病理分型)之間的關(guān)系。本實(shí)驗(yàn)中32例腦膠質(zhì)瘤標(biāo)本均經(jīng)病理證實(shí),術(shù)前未進(jìn)行放療或化療。10例正常腦組織標(biāo)本來(lái)源腦外傷顱內(nèi)減壓手術(shù)患者。結(jié)果10例正常腦組織中未檢測(cè)到ppENK基因... 

【文章來(lái)源】:安徽醫(yī)科大學(xué)安徽省

【文章頁(yè)數(shù)】:37 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

腦膠質(zhì)瘤中ppENK基因啟動(dòng)子區(qū)的甲基化狀態(tài)研究


標(biāo)本組織DNA提取后對(duì)DNA質(zhì)量進(jìn)行檢測(cè)電泳圖(1-6標(biāo)本組織,N1-H2O陰性對(duì)照M-DNA片段Marker)

電泳圖,標(biāo)本,電泳圖,巢式PCR


標(biāo)本組織 DNA 提取后對(duì) DNA 質(zhì)量進(jìn)行檢測(cè)電泳圖(1-6 標(biāo)本組織,N1-H2O M-DNA 片段 Marker) Results of inspection Genomic DNA after extraction quality (1 to 6 were tissues, Ntive water control, Lane M was DNA marker)1 2 3 4 5 6 N1 M1 2 3 4 5 6 N2 M400bp200bp

序列,亞硫酸氫鹽,CpG島甲基化,測(cè)序


Fig 2 Results of amplification by electrophoresis (1 to 6 were tissues, N2 were negative watercontrol, Lane M was DNA marker)2.3.4 產(chǎn)物測(cè)序結(jié)果(Sequencing result)根據(jù) BSP 方法對(duì)擴(kuò)增 PCR 產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,根據(jù)測(cè)序結(jié)果可確定目的片段內(nèi)每個(gè) CpG 島中胞嘧啶(C)的甲基化狀態(tài),是目前檢測(cè)目的基因啟動(dòng)子區(qū) CpG島甲基化水平的金標(biāo)準(zhǔn)。本實(shí)驗(yàn)測(cè)序工作由上海生物芯片公司協(xié)助完成,主要儀器為 ABI 3730XL 全自動(dòng) DNA 測(cè)序儀(遺傳分析儀)。測(cè)序的主要原理:若原基因序列 CpG 島中的 C 即胞嘧啶發(fā)生了甲基化反應(yīng),則經(jīng)亞硫酸氫鹽修飾測(cè)序后胞嘧啶 C 保持不變(如圖 3);若原基因序列中 CpG 島未發(fā)生甲基化反應(yīng),則經(jīng)亞硫酸氫鹽修飾、PCR 擴(kuò)增和測(cè)序后原胞嘧啶 C 轉(zhuǎn)變?yōu)樾叵汆奏?T(如圖 4)。

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號(hào):3030943

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