PRMT2通過介導(dǎo)組蛋白H3R8me2a參與膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中原癌基因激活與腫瘤形成
發(fā)布時(shí)間:2021-01-07 09:28
研究目的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤是最常見、也是惡性程度最高的一種星型細(xì)胞瘤,平均生存期為15個(gè)月。轉(zhuǎn)錄調(diào)控異常在多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中起著重要作用,基于表觀遺傳修飾的可逆性,尋找關(guān)鍵的表觀遺傳調(diào)控因子對(duì)進(jìn)一步開發(fā)靶向治療策略顯得尤為重要。組蛋白賴氨酸甲基化和賴氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶的功能及作用機(jī)制已經(jīng)有了深入了解,但是與之相比,蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶PRMTs家族作為表觀遺傳因子在腫瘤中的作用還不清楚。本研究擬鑒定在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤中起關(guān)鍵作用的PRMT,并系統(tǒng)研究其表觀遺傳調(diào)控機(jī)制。研究方法1、通過臨床樣本的大數(shù)據(jù)分析(TCGA,CGGA等),明確蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶PRMTs與膠質(zhì)瘤惡性程度、與病人生存期相關(guān)性,同時(shí)結(jié)合臨床腫瘤樣本染色結(jié)果和細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn),進(jìn)一步明確研究目的蛋白為PRMT2。2、利用細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)和限度稀釋實(shí)驗(yàn),明確PRMT2對(duì)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞增殖和維持腫瘤干細(xì)胞自我更新能力意義;同時(shí)構(gòu)建顱內(nèi)原位成瘤模型,利用Luciferase成像技術(shù)檢測(cè)敲低PRMT2對(duì)腫瘤的生長和荷瘤小鼠生存期的影響。3、利用RNA-seq分析,明確PRMT2降低導(dǎo)致表達(dá)下降的基因富集情況,并通過Western Blot和...
【文章來源】:天津醫(yī)科大學(xué)天津市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:128 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
根據(jù)TCGA數(shù)據(jù)庫分析蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶PRMTs家族各成員在不同惡性程度的神經(jīng)膠質(zhì)瘤中mRNA水平
10aplan-Meier 生長曲線表示根據(jù) TCGA 數(shù)據(jù)分析蛋白精氨酸甲基家族各成員 mRNA 水平和神經(jīng)膠質(zhì)瘤病人生存期的相關(guān)性。確蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶家族成員對(duì)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤增殖的影響了解蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶家族成員對(duì)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤增殖的影株不同背景的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞,分別為 U87(PTEN deleted) WT),U87 是 PTEN 基因缺失的細(xì)胞,而 T98G 包含野生型的兩株細(xì)胞中分別有效地敲低蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶家族各個(gè)成 細(xì)胞增值實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶是否對(duì)細(xì)胞增殖所必的增殖實(shí)驗(yàn)結(jié)果 PRMT2 敲低對(duì)細(xì)胞增殖抑制均顯著,其他蛋酶成員敲低效果因細(xì)胞背景差不同差異較大(圖 1.3)。因此我T2 作為研究對(duì)象,探索其在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的發(fā)生或發(fā)展中的作
圖 1.3 表達(dá)相應(yīng)短發(fā)卡 RNA 的兩株膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞系的生長曲線。MTS 實(shí)驗(yàn)中時(shí)間節(jié)點(diǎn)的選擇依照相應(yīng)細(xì)胞的生長速度。誤差線 error bars 表示 SD,重復(fù)數(shù)n=3。Western Blot 實(shí)驗(yàn)確定 PTEN 基因表達(dá)狀態(tài)。1.2.3 通過對(duì)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者的生存分析和臨床組織染色結(jié)果明確研究對(duì)象PRMT2通過對(duì)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者的生存分析發(fā)現(xiàn),在所有我們分析的數(shù)據(jù)庫(TCGA,CGGA,REMBRANDT)(圖 1.4)里 PRMT2 的高表達(dá)與病人預(yù)后差均有明顯的正相關(guān)性。同時(shí)為了避免因?yàn)閮H包含 mRNA 表達(dá)譜造成實(shí)驗(yàn)結(jié)果的偏差,我們通過免疫組化的方法檢測(cè)原代神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞瘤中 PRMT2 蛋白表達(dá)情況,原代臨床樣本包括神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞瘤不同惡性程度共 21 例。正如圖 1.5 所展示,PRMT2 明顯富集在高惡性程度的神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞瘤的細(xì)胞核中。我們根據(jù)細(xì)胞染色面積和染色強(qiáng)度,對(duì)每個(gè)臨床樣本進(jìn)行打分評(píng)估,分析結(jié)果顯示 PRMT2陽性細(xì)胞率和腫瘤惡性程度呈現(xiàn)明顯的正相關(guān)(圖 1.6)。因此,我們得出結(jié)論P(yáng)RMT2 高表達(dá)可以用來指示惡性神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞的強(qiáng)侵略性。
本文編號(hào):2962312
【文章來源】:天津醫(yī)科大學(xué)天津市 211工程院校
【文章頁數(shù)】:128 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
根據(jù)TCGA數(shù)據(jù)庫分析蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶PRMTs家族各成員在不同惡性程度的神經(jīng)膠質(zhì)瘤中mRNA水平
10aplan-Meier 生長曲線表示根據(jù) TCGA 數(shù)據(jù)分析蛋白精氨酸甲基家族各成員 mRNA 水平和神經(jīng)膠質(zhì)瘤病人生存期的相關(guān)性。確蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶家族成員對(duì)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤增殖的影響了解蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶家族成員對(duì)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤增殖的影株不同背景的膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞,分別為 U87(PTEN deleted) WT),U87 是 PTEN 基因缺失的細(xì)胞,而 T98G 包含野生型的兩株細(xì)胞中分別有效地敲低蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶家族各個(gè)成 細(xì)胞增值實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證蛋白精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶是否對(duì)細(xì)胞增殖所必的增殖實(shí)驗(yàn)結(jié)果 PRMT2 敲低對(duì)細(xì)胞增殖抑制均顯著,其他蛋酶成員敲低效果因細(xì)胞背景差不同差異較大(圖 1.3)。因此我T2 作為研究對(duì)象,探索其在膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的發(fā)生或發(fā)展中的作
圖 1.3 表達(dá)相應(yīng)短發(fā)卡 RNA 的兩株膠質(zhì)母細(xì)胞瘤細(xì)胞系的生長曲線。MTS 實(shí)驗(yàn)中時(shí)間節(jié)點(diǎn)的選擇依照相應(yīng)細(xì)胞的生長速度。誤差線 error bars 表示 SD,重復(fù)數(shù)n=3。Western Blot 實(shí)驗(yàn)確定 PTEN 基因表達(dá)狀態(tài)。1.2.3 通過對(duì)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者的生存分析和臨床組織染色結(jié)果明確研究對(duì)象PRMT2通過對(duì)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤患者的生存分析發(fā)現(xiàn),在所有我們分析的數(shù)據(jù)庫(TCGA,CGGA,REMBRANDT)(圖 1.4)里 PRMT2 的高表達(dá)與病人預(yù)后差均有明顯的正相關(guān)性。同時(shí)為了避免因?yàn)閮H包含 mRNA 表達(dá)譜造成實(shí)驗(yàn)結(jié)果的偏差,我們通過免疫組化的方法檢測(cè)原代神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞瘤中 PRMT2 蛋白表達(dá)情況,原代臨床樣本包括神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞瘤不同惡性程度共 21 例。正如圖 1.5 所展示,PRMT2 明顯富集在高惡性程度的神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞瘤的細(xì)胞核中。我們根據(jù)細(xì)胞染色面積和染色強(qiáng)度,對(duì)每個(gè)臨床樣本進(jìn)行打分評(píng)估,分析結(jié)果顯示 PRMT2陽性細(xì)胞率和腫瘤惡性程度呈現(xiàn)明顯的正相關(guān)(圖 1.6)。因此,我們得出結(jié)論P(yáng)RMT2 高表達(dá)可以用來指示惡性神經(jīng)膠質(zhì)細(xì)胞的強(qiáng)侵略性。
本文編號(hào):2962312
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