APE1/REF-1和P2RY2基因多態(tài)性與中國漢族人群缺血性腦卒中的相關(guān)性研究
發(fā)布時(shí)間:2021-01-06 20:58
目的:缺血性卒中(ischemic stroke,IS)是一種急性神經(jīng)疾病事件,可導(dǎo)致神經(jīng)組織的死亡。由于高血壓的更好控制和吸煙水平下降使近年來在發(fā)達(dá)國家中IS的發(fā)生率有所下降。隨著人口老齡化,很多國家IS患者的絕對數(shù)量仍在繼續(xù)增加。我們對于IS的傳統(tǒng)風(fēng)險(xiǎn)因素已經(jīng)了解了很多。但是IS的遺傳病學(xué)體系,仍然很大程度上是未確定的。近年來,專家們使用基因多態(tài)性關(guān)聯(lián)分析方法,已經(jīng)證實(shí)了一些新的與IS有關(guān)的易感性基因,但這些試驗(yàn)結(jié)果尚未在不同地區(qū)、不同種族中得到重復(fù)以及肯定。作為IS的高發(fā)地區(qū)的主要人群,在中國北方漢族人群中進(jìn)行IS易感基因的病例對照研究有十分重要的意義。在IS的病理生理基礎(chǔ)中,動脈粥樣硬化的形成以及發(fā)展是至關(guān)重要的。而在動脈粥樣硬化的形成及發(fā)展過程中最重要的就是炎癥反應(yīng)。因此本研究選取了兩個(gè)與炎癥相關(guān)的基因,P2RY2基因和APE1/REF-1基因,采用回顧性分析及病例對照研究方法,分析了P2RY2基因(rs4944831,rs1783596,rs4944832)和APE1/REF-1基因(rs1760944,rs3136817,rs1130409)的基因型、等位基因和單倍型在I...
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:105 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略語
第一部分 P2RY2基因多態(tài)性與缺血性卒中的相關(guān)性研究
1 前言
2 材料和方法
2.1 主要試劑和儀器
2.1.1 主要試劑
2.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2.2 研究對象和分組
2.2.1 病例組的入選標(biāo)準(zhǔn)
2.2.2 正常對照組的入選標(biāo)準(zhǔn)
2.2.3 一般臨床資料的采集
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 血樣采集
2.3.2 全血基因組DNA提取步驟
2.3.3 檢測DNA含量及純度
2.3.4 遺傳標(biāo)記的選擇
2.4 Multiplex SNaPshot(多重單堿基延伸SNP分型)技術(shù)檢測P2RY2基因rs4944831,rs1783596,rs4944832多態(tài)性
2.4.1 SNP的確定及Multiplex SNaPshot方法的選擇
2.4.2 Multiplex SNaPshot的檢測原理
2.4.3 具體操作步驟
2.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2.5.1 數(shù)據(jù)庫建立
2.5.2 Hardy-Weinberg平衡(HWE)
2.5.3 等位基因及基因型頻率
2.5.4 連鎖不平衡分析(Linkage disequilibrium,LD)
2.5.5 單倍型分析
3 結(jié)果
3.1 臨床及生化資料
3.2 P2RY2基因各位點(diǎn)基因型判定結(jié)果
3.2.1 PCR產(chǎn)物電泳圖
3.2.2 Multiplex SNaPshot技術(shù)判定三個(gè)SNP位點(diǎn)基因型檢測結(jié)果(附:單位點(diǎn)分型圖)
3.3 P2RY2基因各SNP位點(diǎn)基因型HWE檢驗(yàn)結(jié)果
3.4 P2RY2基因各候選位點(diǎn)基因型及等位基因的頻率比較
3.4.1 IS組與對照組P2RY2基因各候選位點(diǎn)基因型及等位基因的頻率
3.4.2 LAA組與對照組P2RY2基因各候選位點(diǎn)基因型及等位基因頻率
3.4.3 SAO組與對照組P2RY2基因各候選位點(diǎn)基因型及等位基因頻率
3.4.4 男性IS組與男性對照組P2RY2基因各候選位點(diǎn)基因型及等位基因頻率
3.4.5 女性IS組與女性對照組P2RY2基因各候選位點(diǎn)基因型及等位基因頻率
3.5 P2RY2基因連鎖不平衡分析
3.6 P2RY2基因單倍型分析
4 討論
5 結(jié)論
第二部分 APE1/REF-1基因多態(tài)性與缺血性卒中的相關(guān)性
6 前言
7 材料和方法
7.1 主要試劑和儀器
7.1.1 主要試劑及生產(chǎn)廠家
7.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器
7.2 研究對象和分組
7.2.1 病例組的入選標(biāo)準(zhǔn)
7.2.2 正常對照組的入選標(biāo)準(zhǔn)
7.2.3 一般臨床資料的采集
7.3 實(shí)驗(yàn)方法
7.3.1 血樣采集
7.3.2 全血基因組DNA提取步驟
7.3.3 檢測DNA含量及純度
7.3.4 遺傳標(biāo)記的選擇
7.4 Multiplex SNaPshot檢測APE1/REF-1基因位點(diǎn)多態(tài)性
7.4.1 SNP的確定及Multiplex SNaPshot方法的選擇
7.4.2 Multiplex SNaPshot的檢測原理
7.4.3 具體實(shí)驗(yàn)操作步驟
7.4.4 基因型的判定
7.4.5 基因分型質(zhì)量控制
7.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
7.5.1 數(shù)據(jù)庫建立
7.5.2 Hardy-Weinberg平衡(HWE)
7.5.3 等位基因及基因型頻率
7.5.4 連鎖不平衡(Linkage disequilibrium,LD)分析
7.5.5 單倍型分析
8 結(jié)果
8.1 臨床及生化資料
8.2 APE1/REF-1基因rs1760944,rs3136817和rs1130409位點(diǎn)基因型判定
8.2.1 PCR產(chǎn)物電泳圖
8.2.2 MultiplexSNaPshot技術(shù)判定基因型檢測結(jié)果(附:單位點(diǎn)分型圖)
8.3 APE1/REF-1基因rs1760944,rs3136817和rs1130409各位點(diǎn)HWE檢驗(yàn)結(jié)果
8.4 IS組及各亞組與對照組SNPs等位基因及基因型頻率的比較
8.4.1 IS組與對照組APE1/REF-1基因型比較結(jié)果
8.4.2 LAA組與對照組APE1/REF-1基因型和等位基因頻率比較
8.4.3 SAO組與對照組APE1/REF-1基因型和等位基因頻率比較
8.4.4 IS組及對照組男性APE1/REF-1基因各位點(diǎn)基因型和等位基因頻率
8.4.5 女性APE1/REF-1基因各位點(diǎn)基因型和等位基因頻率
8.5 APE1/REF-1基因連鎖不平衡分析
8.6 APE1/REF-1基因rs1760944,rs3136817和rs1130409位點(diǎn)單倍型分析
8.6.1 IS組與對照組APE1/REF-1基因rs1760944-rs3136817-rs1130409單倍型頻率比較
8.6.2 不同IS亞組與對照組APE1/REF-1基因單倍型頻率比較
8.6.3 不同性別IS組與對照組APE1/REF-1基因單倍型頻率比較
9 討論
10 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性的自我評價(jià)
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]局部晚期非小細(xì)胞肺癌患者血清中Ape1/Ref-1、ICAM-1及IL-17A水平與放射性肺炎發(fā)生的相關(guān)性研究[J]. 郭雷鳴,丁高峰,徐文才,葛紅,蔣月,陸寓非. 中國肺癌雜志. 2018(05)
[2]Associations between thromboxane A synthase 1 gene polymorphisms and the risk of ischemic stroke in a Chinese Han population[J]. Lei Li,Zhi-yi He,Yan-zhe Wang,Xu Liu,Li-ying Yuan. Neural Regeneration Research. 2018(03)
本文編號:2961248
【文章來源】:中國醫(yī)科大學(xué)遼寧省
【文章頁數(shù)】:105 頁
【學(xué)位級別】:博士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略語
第一部分 P2RY2基因多態(tài)性與缺血性卒中的相關(guān)性研究
1 前言
2 材料和方法
2.1 主要試劑和儀器
2.1.1 主要試劑
2.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2.2 研究對象和分組
2.2.1 病例組的入選標(biāo)準(zhǔn)
2.2.2 正常對照組的入選標(biāo)準(zhǔn)
2.2.3 一般臨床資料的采集
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 血樣采集
2.3.2 全血基因組DNA提取步驟
2.3.3 檢測DNA含量及純度
2.3.4 遺傳標(biāo)記的選擇
2.4 Multiplex SNaPshot(多重單堿基延伸SNP分型)技術(shù)檢測P2RY2基因rs4944831,rs1783596,rs4944832多態(tài)性
2.4.1 SNP的確定及Multiplex SNaPshot方法的選擇
2.4.2 Multiplex SNaPshot的檢測原理
2.4.3 具體操作步驟
2.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2.5.1 數(shù)據(jù)庫建立
2.5.2 Hardy-Weinberg平衡(HWE)
2.5.3 等位基因及基因型頻率
2.5.4 連鎖不平衡分析(Linkage disequilibrium,LD)
2.5.5 單倍型分析
3 結(jié)果
3.1 臨床及生化資料
3.2 P2RY2基因各位點(diǎn)基因型判定結(jié)果
3.2.1 PCR產(chǎn)物電泳圖
3.2.2 Multiplex SNaPshot技術(shù)判定三個(gè)SNP位點(diǎn)基因型檢測結(jié)果(附:單位點(diǎn)分型圖)
3.3 P2RY2基因各SNP位點(diǎn)基因型HWE檢驗(yàn)結(jié)果
3.4 P2RY2基因各候選位點(diǎn)基因型及等位基因的頻率比較
3.4.1 IS組與對照組P2RY2基因各候選位點(diǎn)基因型及等位基因的頻率
3.4.2 LAA組與對照組P2RY2基因各候選位點(diǎn)基因型及等位基因頻率
3.4.3 SAO組與對照組P2RY2基因各候選位點(diǎn)基因型及等位基因頻率
3.4.4 男性IS組與男性對照組P2RY2基因各候選位點(diǎn)基因型及等位基因頻率
3.4.5 女性IS組與女性對照組P2RY2基因各候選位點(diǎn)基因型及等位基因頻率
3.5 P2RY2基因連鎖不平衡分析
3.6 P2RY2基因單倍型分析
4 討論
5 結(jié)論
第二部分 APE1/REF-1基因多態(tài)性與缺血性卒中的相關(guān)性
6 前言
7 材料和方法
7.1 主要試劑和儀器
7.1.1 主要試劑及生產(chǎn)廠家
7.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器
7.2 研究對象和分組
7.2.1 病例組的入選標(biāo)準(zhǔn)
7.2.2 正常對照組的入選標(biāo)準(zhǔn)
7.2.3 一般臨床資料的采集
7.3 實(shí)驗(yàn)方法
7.3.1 血樣采集
7.3.2 全血基因組DNA提取步驟
7.3.3 檢測DNA含量及純度
7.3.4 遺傳標(biāo)記的選擇
7.4 Multiplex SNaPshot檢測APE1/REF-1基因位點(diǎn)多態(tài)性
7.4.1 SNP的確定及Multiplex SNaPshot方法的選擇
7.4.2 Multiplex SNaPshot的檢測原理
7.4.3 具體實(shí)驗(yàn)操作步驟
7.4.4 基因型的判定
7.4.5 基因分型質(zhì)量控制
7.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
7.5.1 數(shù)據(jù)庫建立
7.5.2 Hardy-Weinberg平衡(HWE)
7.5.3 等位基因及基因型頻率
7.5.4 連鎖不平衡(Linkage disequilibrium,LD)分析
7.5.5 單倍型分析
8 結(jié)果
8.1 臨床及生化資料
8.2 APE1/REF-1基因rs1760944,rs3136817和rs1130409位點(diǎn)基因型判定
8.2.1 PCR產(chǎn)物電泳圖
8.2.2 MultiplexSNaPshot技術(shù)判定基因型檢測結(jié)果(附:單位點(diǎn)分型圖)
8.3 APE1/REF-1基因rs1760944,rs3136817和rs1130409各位點(diǎn)HWE檢驗(yàn)結(jié)果
8.4 IS組及各亞組與對照組SNPs等位基因及基因型頻率的比較
8.4.1 IS組與對照組APE1/REF-1基因型比較結(jié)果
8.4.2 LAA組與對照組APE1/REF-1基因型和等位基因頻率比較
8.4.3 SAO組與對照組APE1/REF-1基因型和等位基因頻率比較
8.4.4 IS組及對照組男性APE1/REF-1基因各位點(diǎn)基因型和等位基因頻率
8.4.5 女性APE1/REF-1基因各位點(diǎn)基因型和等位基因頻率
8.5 APE1/REF-1基因連鎖不平衡分析
8.6 APE1/REF-1基因rs1760944,rs3136817和rs1130409位點(diǎn)單倍型分析
8.6.1 IS組與對照組APE1/REF-1基因rs1760944-rs3136817-rs1130409單倍型頻率比較
8.6.2 不同IS亞組與對照組APE1/REF-1基因單倍型頻率比較
8.6.3 不同性別IS組與對照組APE1/REF-1基因單倍型頻率比較
9 討論
10 結(jié)論
本研究創(chuàng)新性的自我評價(jià)
參考文獻(xiàn)
綜述
參考文獻(xiàn)
攻讀學(xué)位期間取得的研究成果
致謝
個(gè)人簡介
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]局部晚期非小細(xì)胞肺癌患者血清中Ape1/Ref-1、ICAM-1及IL-17A水平與放射性肺炎發(fā)生的相關(guān)性研究[J]. 郭雷鳴,丁高峰,徐文才,葛紅,蔣月,陸寓非. 中國肺癌雜志. 2018(05)
[2]Associations between thromboxane A synthase 1 gene polymorphisms and the risk of ischemic stroke in a Chinese Han population[J]. Lei Li,Zhi-yi He,Yan-zhe Wang,Xu Liu,Li-ying Yuan. Neural Regeneration Research. 2018(03)
本文編號:2961248
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