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RNA結(jié)合蛋白UNR促進(jìn)人神經(jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞的遷移并調(diào)控RPL9的表達(dá)

發(fā)布時(shí)間:2020-06-02 10:44
【摘要】:RNA結(jié)合蛋白種類較多,其可以結(jié)合單鏈或者雙鏈RNA,在眾多的細(xì)胞生物學(xué)進(jìn)程中扮演重要角色,特別在轉(zhuǎn)錄后水平對(duì)基因表達(dá)有很重要的調(diào)控作用。它幾近完全地參與了 RNA的代謝過(guò)程:經(jīng)由構(gòu)成核糖核蛋白復(fù)合物,它可以調(diào)控RNA的成熟,剪接,運(yùn)輸,多聚腺苷酸化,mRNA(message RNA)的穩(wěn)定性,mRNA的翻譯等等。目前有報(bào)道指出,當(dāng)一些RNA結(jié)合蛋白表達(dá)異;蛘甙l(fā)生突變,其可能參與一些惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展。UNR(Upstream-ofN-Ras),在哺乳動(dòng)物中也被稱作是 CSDE1(Cold Shock Domain containing E1)是一種具有五個(gè)保守冷休克結(jié)構(gòu)域的RNA結(jié)合蛋白,其主要參與調(diào)控細(xì)胞生理進(jìn)程中mRNA的穩(wěn)定性,mRNA的翻譯等過(guò)程。然而最近一些報(bào)道指出,UNR在人黑色素瘤中具有較高的蛋白表達(dá)水平并促進(jìn)黑色素瘤的侵襲和轉(zhuǎn)移;其較高的表達(dá)水平可以作為胰腺導(dǎo)管腺癌預(yù)后理想的分子標(biāo)志物。但是,UNR是否在人神經(jīng)膠質(zhì)瘤中具有功能還是未知的。在我們的研究結(jié)果中,發(fā)現(xiàn)UNR在神經(jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞和病人組織樣本中呈較高的表達(dá)水平。并且,敲低UNR可以明顯的抑制腫瘤細(xì)胞的遷移能力但不影響其細(xì)胞增殖。通過(guò)分析已公開的UNR在人黑色素瘤中的iCLIP-seq,RNA測(cè)序和核糖體印記測(cè)序這一系列測(cè)序數(shù)據(jù),我們?cè)谏窠?jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞中通過(guò)RNA免疫沉淀和生物素標(biāo)記的RNA pull down實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了 UNR可以結(jié)合PTEN和核糖體蛋白R(shí)PL9mRNA的3'UTR。同時(shí),我們發(fā)現(xiàn)敲低UNR可以抑制RPL9的表達(dá)。RPL9在人神經(jīng)膠質(zhì)瘤中高表達(dá),利用siRNA敲低RPL9,腫瘤遷移侵襲有關(guān)的標(biāo)志物Vimentin的表達(dá)有明顯的下調(diào)。這提示RPL9可能通過(guò)一定的機(jī)制參與調(diào)控了膠質(zhì)瘤細(xì)胞的侵襲遷移。本研究首次在膠質(zhì)瘤細(xì)胞中揭示了 RNA結(jié)合蛋白UNR的功能,并且發(fā)現(xiàn)了它可以調(diào)控核糖體蛋白R(shí)PL9的表達(dá)。這為我們更進(jìn)一步研究膠質(zhì)瘤的發(fā)展提供了新思路。
【圖文】:

轉(zhuǎn)錄本,號(hào)外,異構(gòu)體


是這在_+/-雜合小鼠的表型上并沒(méi)有所表現(xiàn)[6]。另一方面,iV-rm基因的表逡逑達(dá)變化對(duì)WVi?基因的表達(dá)也沒(méi)有影響[7]。現(xiàn)代生物測(cè)序技術(shù)發(fā)現(xiàn),t/M?具有六逡逑個(gè)轉(zhuǎn)錄本,它們?cè)冢蔡?hào),,3號(hào)和6號(hào)外顯子上有所不同,如圖2所示。之前的一逡逑項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn),缺少6號(hào)外顯子的2號(hào)轉(zhuǎn)錄本與1號(hào)轉(zhuǎn)錄本相比在除了大腦以外的逡逑一些實(shí)驗(yàn)所用組織中均具有較高的表達(dá)水平[8]。除此之外,UNR的2號(hào)蛋白異逡逑構(gòu)體,其對(duì)應(yīng)的轉(zhuǎn)錄本缺少6號(hào)外顯子而使得蛋白異構(gòu)體缺少31個(gè)氨基酸[9]。逡逑該異構(gòu)體與1號(hào)異構(gòu)體相比,在發(fā)揮刺激人類鼻病毒(HRV-2)邋IRES處的翻譯逡逑起始過(guò)程中具有更高的生物學(xué)活性[1()]。逡逑Transcript邋variant邐Exon邋structure逡逑4邐1邋1邋|邐2邐1邋3邋1邋4邋1邋5邋1邋6邋1邋7邋1邐8-21邐|邋4330邋nt逡逑3邐1邋1邋|邐2邐1邋3邋1邋4邋[邋S邋1邋7邋|邐8-21邐|邋4237邋nt逡逑1邐1邋1邋j邋2邋I邋4邋1邋5邋I邋6邋1邋7邋1邐8-21邐丨邋4183邋m逡逑2邐1邐1邋|邐2邐1邋4邋1邋5邋|邋7邋1邐8-21邐\邋4090邋nt逡逑5邋|邋1邋j邋4邋1邋5邋1邋6邋1邋7邋1邐8-21邐 ̄|邋3796邋nt逡逑6邐1邐1邋1邋4邋1邋5邋1邋7邋1邐8-21邐1邋3703邋nt逡逑圖2邋MVi?各轉(zhuǎn)錄本的情況逡逑2.邋UNR的生物學(xué)功能逡逑UNR在基因表達(dá)調(diào)控中兼?zhèn)渲喾N功能

模式圖,模式圖,測(cè)序,原始內(nèi)胚層


蛋白(SXL)邋—起,要抑制劑量補(bǔ)償復(fù)合物中msl-2的翻譯,它們通過(guò)結(jié)合在逡逑msl-2的3’UTR來(lái)抑制其翻譯,進(jìn)而來(lái)抑制雌性生物中X染色體的劑量補(bǔ)償[15,16],逡逑如圖3所示。逡逑3'邋UTR逡逑"P,0逡逑43S邐1邐elF4G邋|逡逑5.UTR逡逑圖3邋UNR作用于msl-2邋mRNA的3’UTR模式圖逡逑除此之外,在近期的一項(xiàng)研宄中,通過(guò)利用UNR在人黑色素瘤中的iCLIP-seq,逡逑RNA測(cè)序和核糖體印跡測(cè)序這一系列測(cè)序數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)UNR逡逑可能在翻譯的延伸或者終止中發(fā)揮著重要作用[17]。總而言之,UNR作為一個(gè)逡逑mRNA調(diào)節(jié)因子,其發(fā)揮什么樣的功能取決于其靶向結(jié)合哪種mRNA和細(xì)胞的逡逑類型。逡逑UNR也介入一些正常的生理過(guò)程中。近年來(lái)一些報(bào)道指出,UNR參與神經(jīng)元逡逑的遷移,敲低UNR會(huì)阻滯小腦前神經(jīng)元朝目標(biāo)區(qū)域的遷移UNR參與維持人逡逑類胚胎千細(xì)胞處于未分化的狀態(tài)[19];邋UNR還阻滯小鼠胚胎干細(xì)胞向原始內(nèi)胚層逡逑的分化[2()]。逡逑3.UNR與疾病逡逑UNR與某些疾病的發(fā)生發(fā)展也有密切關(guān)系
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:R739.4

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1 田寧宇;RNA結(jié)合蛋白UNR促進(jìn)人神經(jīng)膠質(zhì)瘤細(xì)胞的遷移并調(diào)控RPL9的表達(dá)[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2018年



本文編號(hào):2693036

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