中青年帕金森病患者高通量測序及變異位點(diǎn)致病性分析
本文選題:帕金森病 + 高通量測序 ; 參考:《山東大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:研究背景帕金森病(Parkinson,s Disease,PD)是第二大神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病。典型臨床表現(xiàn)除運(yùn)動(dòng)遲緩、肌強(qiáng)直、靜止性震顫及姿勢平衡障礙等運(yùn)動(dòng)癥狀外,尚包括嗅覺減退、便秘、疼痛及快速動(dòng)眼睡眠行為障礙等非運(yùn)動(dòng)癥狀,且隨病程進(jìn)展而加重。已有研究表明,原發(fā)性帕金森病患者中,約10%與遺傳因素相關(guān),目前與PD相關(guān)的突變基因有20多個(gè);蛲蛔冃蚉D患者起病年齡一般較早,中青年發(fā)病群體中基因突變PD患者所占比例較高,但缺乏特異性臨床表型可以將其與散發(fā)性PD患者鑒別。因此,對(duì)中青年P(guān)D患者群體進(jìn)行基因檢測,研究不同基因突變?cè)谄渲兴急壤?并對(duì)新發(fā)現(xiàn)變異位點(diǎn)進(jìn)行致病性規(guī)范化解讀,對(duì)PD的診治具有重要的臨床意義。研究目的本研究旨在通過最新的高通量靶向捕獲測序技術(shù),檢測中青年P(guān)D患者中屮相關(guān)致病基因的變異情況,并結(jié)合ACMG指南,對(duì)所檢出變異位點(diǎn)進(jìn)行規(guī)范化解讀,以期:(1)利用高通量測療技術(shù),建立PD遺傳學(xué)診斷的規(guī)范化解讀及診斷策略;(2)研究中青年P(guān)D患者中不同基因突變亞型分布及常見變異位點(diǎn);(3)發(fā)現(xiàn)未曾報(bào)道的具有潛在致病意義的新發(fā)突變位點(diǎn)。研究對(duì)象與研究方法研究對(duì)象本研究隨機(jī)連續(xù)收集于2014年9月至2016年12月,就診于山東大學(xué)齊魯醫(yī)院神內(nèi)內(nèi)科門診和病房的中青年P(guān)D患者109例,其中包括男性51例,女性58例。研究方法1.納入標(biāo)準(zhǔn):符合帕金森病UK腦庫診斷標(biāo)準(zhǔn),年齡≤65歲。本研究已通過山東大學(xué)齊魯醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn),且所有臨床納入對(duì)象均已簽署知情同意書。2.臨床資料收集:每位入組的PD患者均分別由兩名帕金森病及運(yùn)動(dòng)障礙疾病?漆t(yī)師獨(dú)立評(píng)估病情并進(jìn)行確診,采集臨床基本信息,包括性別、年齡、起病年齡等;3.P D相關(guān)基因高通量捕獲測序:P D相關(guān)基因高通量捕獲芯片的設(shè)計(jì)及樣本測序;4.數(shù)據(jù)分析:PD致病基因分類匯總、基因頻率計(jì)算及根據(jù)ACMG指南對(duì)變異位點(diǎn)進(jìn)行致病性解讀。結(jié)果1.109例PD患者中,符合基因突變致病的比例為18例(16.5%),包括10例LRRK2病例(9.17%)、5 例 PARK2 病例(4.59%)、1 例 LRRK2+PARK2 病例(0.92%)、1例 HTRA2 病例(0.92%)和 1例 PINK1病例(0.92%)。2.無基因突變組、LRRK2突變組、PARK2致病突變組及PARK2雜合突變攜帶組PD患者平均起病年齡分別為40.3歲、45歲、33歲和41.5 歲。3.LRRK2(P.G2385R)在所測樣本中,基因頻率最高(3.67%)。其次依次為PARK2(p.G135R,2.75%),PARK2(p.M309L,1.38%),LRRK2(p.A419V,0.92%),PARK2(p.R217W,0.92%),PARK2(p.V231L,0.92%),PARK2(p.E309X,0.92%)和PINK1(p.L519fs,0.92%)。4.發(fā)現(xiàn)22處未報(bào)道變異位點(diǎn),其中5個(gè)變異位點(diǎn)具有較大的潛在致病性意義,分R%為 PARK2(c.838+2TC,splicing)、PARK2(p.R217W)、PARK2(p.S223X)、LRRK2(c.3777+1GA,splicing)和 PARK2(p.E309X)。結(jié)論1.高通量靶向捕獲測序聯(lián)合多重連接探針擴(kuò)增技術(shù),并遵循ACMG指南對(duì)變異位點(diǎn)的致病性進(jìn)行規(guī)范化解讀,在帕金森病患者的遺傳學(xué)診斷中,具有重要意義;2.中青年P(guān)D患者,符合基因突變致病的比例為16.5%,最常見的基因突變PD亞型為LRRK2突變(9.17%)和PARK2突變病例4.59%。最常見突變位點(diǎn)為LRRK2(p.G2385R)和 PARK2(p.G135R)。3.對(duì)于新發(fā)現(xiàn)的變異位點(diǎn),致病性尚不明確,在利用ACMG對(duì)致病性進(jìn)行分析基礎(chǔ)上,有待進(jìn)一步驗(yàn)證。
[Abstract]:This study was carried out on the basis of the latest high - throughput targeting capture and sequencing technique , which included male 51 male and female 58 cases . Results 1.There were 18 cases ( 16.05 % ) of patients with PD , including 10 cases of LRRK2 ( 9.17 % ) , PARK2 ( p . R217W , 0.92 % ) , PARK2 ( p . R217W , 0.92 % ) , PARK2 ( p . R217W , 0.92 % ) , PARK2 ( p . R217W , 0.92 % ) , PARK2 ( p . The most common mutation sites were LRRK2 ( p . G2385R ) and PARK2 ( p . G135R ) . 3 . The most common mutation sites were LRRK2 ( p . G2385R ) and PARK2 ( p . G135R ) . 3 . The most common mutation sites were LRRK2 ( p . G2385R ) and PARK2 ( p . G135R ) .
【學(xué)位授予單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R742.5
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,本文編號(hào):1838700
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