基于多模態(tài)MRI圖像的腦腫瘤分割方法
本文選題:腦腫瘤分割 + 多模態(tài)MRI圖像; 參考:《電子科技大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:腦腫瘤分割是一種從灰質(zhì)、白質(zhì)和腦脊液等正常的腦組織中,分離水腫、活躍和腫瘤壞死組織等不同的腦腫瘤結(jié)構(gòu)的一種腦腫瘤輔助診斷技術(shù)。由于腫瘤在顱內(nèi)產(chǎn)生,只能通過非侵入式顯影方式(如:CT和MRI等)觀察腫瘤的情況。在這些影像中腫瘤結(jié)構(gòu)僅以灰度變化表征,不同設(shè)備不同條件獲得的顯影圖像也可能有所差別,使得傳統(tǒng)的圖像分割方法很難較好地處理腦腫瘤圖像的分割問題。隨著MRI成像技術(shù)的不斷成熟、多模態(tài)MRI圖像的逐漸普及以及機(jī)器學(xué)習(xí)技術(shù)的飛速發(fā)展,腦腫瘤分割問題開始煥發(fā)新的活力。本文在這樣的背景下,以腦腫瘤分割為立足點(diǎn),以多模態(tài)MRI圖像為基礎(chǔ),以機(jī)器學(xué)習(xí)方法為工具,針對(duì)腦腫瘤分割問題展開了如下研究:1、從腦腫瘤分割技術(shù)的發(fā)展脈絡(luò)出發(fā),在回顧經(jīng)典方法的基礎(chǔ)上,針對(duì)MRI圖像本身的灰度不均勻的問題,利用多模態(tài)MRI圖像數(shù)據(jù)本身的顯影特異性,提出了一種針對(duì)多模態(tài)腦腫瘤分割的差分操作運(yùn)算。同時(shí),在多模態(tài)圖像差分信息的輔助下,實(shí)現(xiàn)了利用多模態(tài)信息定位腫瘤區(qū)域的方法,為獲得腦腫瘤的準(zhǔn)確分割提供了一定的保障。從而也為充分的利用多模態(tài)MRI圖像數(shù)據(jù)提供了一種可能的參考。在此基礎(chǔ)上,將基于自組織神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(SOM)和主動(dòng)輪廓模型(ACM)方法的自組織映射主動(dòng)輪廓模型(SOAC)引入到腦腫瘤分割問題中,構(gòu)造了基于多模態(tài)MRI圖像的混合自組織主動(dòng)輪廓模型(MSOAC)的腦腫瘤分割方法。以MRI數(shù)據(jù)預(yù)處理技術(shù)為先導(dǎo),結(jié)合多模態(tài)差分定位腫瘤區(qū)域,通過MRI的slices數(shù)據(jù)為基礎(chǔ)構(gòu)建了一種基于多模態(tài)MRI圖像的全自動(dòng)的腦腫瘤分割方法。2、結(jié)合卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和反卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)技術(shù),以多模態(tài)MRI圖像為依托,利用BRATS2015 training中3D MRI的slices數(shù)據(jù),通過對(duì)要描述的腫瘤區(qū)域、腫瘤的活躍區(qū)域和腫瘤核區(qū)域分別構(gòu)建反卷積子網(wǎng)絡(luò)的方法,進(jìn)行end-to-end的訓(xùn)練和參數(shù)調(diào)優(yōu),從而構(gòu)建起多路深度反卷積網(wǎng)絡(luò)模型。不同于以往在腦腫瘤分割中CNN采用的圖像塊訓(xùn)練的方法,這里直接利用slices訓(xùn)練,最后通過softmax預(yù)測每個(gè)像素的類別,得到pixel-wise的分割結(jié)果。
[Abstract]:Brain tumor segmentation is a technique for the diagnosis of brain tumors, which separates different brain tumor structures, such as edema, active and necrotic tissues, from normal brain tissues such as gray matter, white matter and cerebrospinal fluid. Because tumors occur in the brain, they can only be observed by non-invasive imaging (such as: Ct and MRI). In these images, the tumor structure is only represented by gray changes, and the development images obtained by different equipment and different conditions may also be different, which makes it difficult for traditional image segmentation methods to deal with the problem of brain tumor image segmentation. With the maturation of MRI imaging technology, the popularization of multimodal MRI images and the rapid development of machine learning technology, the segmentation of brain tumors begins to take on new vitality. In this context, this paper takes brain tumor segmentation as a foothold, based on multimodal MRI images, and uses machine learning method as a tool to study the problem of brain tumor segmentation as follows: 1, starting from the development of brain tumor segmentation technology. On the basis of reviewing the classical methods and aiming at the uneven grayscale of MRI images, a differential operation for multimodal brain tumor segmentation is proposed by using the development specificity of the multimodal MRI image data itself. At the same time, with the help of multi-modal image differential information, the method of using multi-mode information to locate tumor regions is realized, which provides a certain guarantee for accurate segmentation of brain tumors. It also provides a possible reference for making full use of multimodal MRI image data. On this basis, the self-organizing mapping active contour model (SOAC) based on the self-organizing neural network (SOM) and the active contour model (ACM) is introduced into the brain tumor segmentation problem. A new method of brain tumor segmentation based on multimodal MRI image is proposed, which is based on mixed self-organizing active contour model (MSOAC). Using MRI data preprocessing technology as the guide, combined with multi-modal differential localization of tumor region, Based on the slices data of MRI, an automatic segmentation method of brain tumor based on multimodal MRI image. 2. Combined with convolution neural network and deconvolution neural network technology, based on multimodal MRI image. Using the slices data of 3D MRI in BRATS2015 training, the deconvolution sub-network of the tumor region, the active region and the nuclear region of the tumor were constructed respectively to train and optimize the parameters of end-to-end. Thus the multichannel depth deconvolution network model is constructed. Different from the previous image block training method used by CNN in brain tumor segmentation, slices training is directly used here. Finally, the classification of each pixel is predicted by softmax, and the segmentation result of pixel-wise is obtained.
【學(xué)位授予單位】:電子科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R739.41;R445.2;TP391.41
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,本文編號(hào):1796952
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