本文選題：吉蘭巴雷綜合征　切入點(diǎn)：lncRNAs　出處：《天津醫(yī)科大學(xué)》2017年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：研究背景:長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(Long Noncoding RNAs,lncRNAs)作為一種新近出現(xiàn)的對(duì)多種生物學(xué)過(guò)程及疾病的發(fā)病機(jī)制具有調(diào)節(jié)作用的生物小分子物質(zhì)已被眾多學(xué)者所認(rèn)識(shí),其近年來(lái)在腫瘤性疾病、自身免疫性疾病及神經(jīng)系統(tǒng)疾病中的研究進(jìn)展迅速,但目前l(fā)ncRNAs在吉蘭-巴雷綜合征(Guillain-BarréSyndrome,GBS)發(fā)病機(jī)制中的作用仍不十分明確。研究目的:通過(guò)lncRNAs芯片分析GBS患者與健康對(duì)照組的差異lncRNAs和mRNAs的表達(dá),并進(jìn)一步分析GBS患者CD14+的外周血單核細(xì)胞中mRNAs及l(fā)ncRNAs的差異性表達(dá),通過(guò)生物信息學(xué)分析lncRNAs的共表達(dá)基因、生物功能聚類及可能參與的信號(hào)通路,并構(gòu)建基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)圖分析lncRNAs在基因調(diào)控中的作用,為探索lncRNAs在GBS的發(fā)病機(jī)制中的作用奠定研究基礎(chǔ)。研究方法:研究1選取15名GBS患者及15名性別年齡相匹配的健康對(duì)照者行l(wèi)ncRNAs及mRNAs芯片表達(dá)譜分析其差異表達(dá),行qRT-PCR驗(yàn)證代表性顯著差異表達(dá)lncRNAs的芯片分析結(jié)果的可靠性,利用RMR軟件根據(jù)lncRNAs特征與靶點(diǎn)基因間的相關(guān)性及冗余度對(duì)lncRNAs及mRNAs的特征重要性進(jìn)行排序,并通過(guò)GO分析及KEGG信號(hào)通路分析差異表達(dá)的lncRNAs的生物學(xué)功能,構(gòu)建共表達(dá)基因網(wǎng)絡(luò)揭示lncRNAs與相關(guān)目的基因的潛在調(diào)控作用。研究2選取10名GBS患者及10名相匹配的健康對(duì)照者,提取CD14+外周血單核細(xì)胞的lncRNAs用于芯片表達(dá)譜分析,利用PCR的方法驗(yàn)證芯片分析結(jié)果的可靠性,并通過(guò)GO分析及KEGG信號(hào)通路分析差異表達(dá)的lncRNAs的生物學(xué)功能,構(gòu)建共表達(dá)基因網(wǎng)絡(luò)揭示lncRNAs與相關(guān)目的基因的潛在調(diào)控作用。研究結(jié)果:研究1對(duì)芯片表達(dá)譜數(shù)據(jù)分析篩選得到的差異表達(dá)lncRNAs和mRNAs行mRMR分析,根據(jù)其對(duì)GBS患者及健康對(duì)照者不同分類的最大相關(guān)及最小冗余特征,顯示了排序最靠前的310個(gè)mRNAs及114個(gè)lncRNAs。差異lncRNAs的GO分析結(jié)果表明GBS患者中l(wèi)ncRNAs高度富集于細(xì)胞成分、生理過(guò)程、信號(hào)通路等生物學(xué)功能,如細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞大分子復(fù)合物的裝配、細(xì)胞周期、連接酶活性及蛋白代謝過(guò)程等,而KEGG分析結(jié)果則表明lncRNAs可能與7條生物信息通路最為相關(guān),主要集中在蛋白酶體、剪接體、檸檬酸循環(huán)(三羧酸循環(huán))、NOD樣受體信號(hào)通路、原發(fā)性免疫缺陷、細(xì)胞吞噬及T細(xì)胞受體信號(hào)通路。LncRNAs-mRNAs共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析顯示,303個(gè)mRNAs及113個(gè)lncRNAs包含在共表達(dá)關(guān)系網(wǎng)絡(luò)中,其中1個(gè)mRNA可能與1-53個(gè)lncRNAs存在調(diào)控關(guān)系,而1個(gè)lncRNAs則可能與1-140個(gè)mRNAs起到互相調(diào)控作用,其中92個(gè)lncRNAs與6個(gè)mRNAs相互調(diào)控參與了“蛋白酶體”信號(hào)通路。研究2 LncRNAs及mRNAs的芯片表達(dá)譜分析結(jié)果表明GBS患者及健康對(duì)照者的CD14+外周血單核細(xì)胞中存在差異性表達(dá),其中包括304個(gè)異常表達(dá)的lncRNAs(141個(gè)表達(dá)水平顯著上調(diào),165個(gè)顯著下調(diào))及288個(gè)異常表達(dá)的mRNAs(171個(gè)顯著上調(diào),119個(gè)顯著下調(diào)),其中差異表達(dá)最為顯著的lncRNAs為ENST00000524361.1(上調(diào))及ENST00000412647.2(下調(diào)),而差異表達(dá)最顯著的mRNAs為DEFA3(上調(diào))及CCL2(下調(diào))。這些差異基因的PCR分析結(jié)果與芯片分析結(jié)果相一致。GO功能分析表明,差異表達(dá)lncRNAs在細(xì)胞激活、白細(xì)胞遷移、細(xì)胞遷移調(diào)控、細(xì)胞運(yùn)動(dòng)、單生物細(xì)胞粘附、胞吐及細(xì)胞趨化等功能上較為富集。而KEGG信號(hào)通路分析顯示系統(tǒng)性紅斑狼瘡、造血細(xì)胞系、縫隙連接、細(xì)胞因子-細(xì)胞因子受體相互作用、NOD樣受體信號(hào)通路、白細(xì)胞經(jīng)內(nèi)皮遷移以及趨化因子信號(hào)通路與差異表達(dá)lncRNAs最為相關(guān)。lncRNAs-mRNAs共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析表明1個(gè)mRNA可與數(shù)十個(gè)lncRNAs起相互調(diào)控作用,而1個(gè)lncRNA亦可與數(shù)十個(gè)mRNAs相互調(diào)控,其中4個(gè)mRNAs(EGF、GP1BA、JAM3及ITGB3)與102個(gè)差異表達(dá)lncRNAs相互調(diào)控相關(guān)性最大。結(jié)論:在吉蘭-巴雷綜合征的患者及正常人群中的外周血單個(gè)核細(xì)胞及CD14+單核細(xì)胞中mRNAs及l(fā)ncRNAs均存在差異表達(dá),差異表達(dá)的lncRNAs在GBS患者中可能參與多條信號(hào)通路,而差異表達(dá)lncRNAs與一些靶向基因間的調(diào)控作用可能在GBS的發(fā)病機(jī)制中起到至關(guān)重要的作用,進(jìn)一步針對(duì)GBS與lncRNAs基因改變的關(guān)系研究可能成為新型發(fā)病機(jī)制及治療靶點(diǎn)研究的方向
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：天津醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號(hào)】：R744.5

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本文編號(hào)：1559888