江蘇口岸鼠類(lèi)監(jiān)測(cè)與重點(diǎn)鼠類(lèi)mtDNA-Cytb基因數(shù)據(jù)庫(kù)的建立
發(fā)布時(shí)間:2017-09-14 02:30
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【摘要】:[目的]監(jiān)測(cè)江蘇口岸本底鼠類(lèi)的種類(lèi)及其病原體攜帶情況,建立一套重要鼠類(lèi)的mt DNA-Cytb基因數(shù)據(jù)庫(kù)。[方法]2014年5月~2015年4月,在江蘇17個(gè)口岸采用夾夜法捕獲本底鼠樣;首先通過(guò)形態(tài)特征鑒定捕獲的鼠樣,在生物安全柜中解剖鼠樣取其肝臟與肺臟,分別提取鼠類(lèi)肝臟的DNA模板與肺臟的RNA模板;通過(guò)PCR擴(kuò)增和測(cè)序,測(cè)定鼠類(lèi)的Cytb基因序列,通過(guò)BLAST與NCBI的基因數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì),以同源性最高為分子鑒定結(jié)果。通過(guò)熒光PCR篩查捕獲鼠樣中的鼠疫桿菌和漢坦病毒感染情況,對(duì)陽(yáng)性結(jié)果再進(jìn)行測(cè)序驗(yàn)證與分型。最后將江蘇各口岸代表性鼠樣的Cytb基因序列信息與各口岸的地理分布信息結(jié)合,構(gòu)建江蘇口岸本底鼠類(lèi)的基因特征數(shù)據(jù)庫(kù),建立Cytb基因的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。[結(jié)果]共采集鼠樣418份,其中褐家鼠231只、黃胸鼠38只、小家鼠99只、黑線(xiàn)姬鼠44只和大麝,
本文編號(hào):847336
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