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諾如病毒急性胃腸炎分子流行病學(xué)調(diào)查研究

發(fā)布時間:2017-05-21 11:23

  本文關(guān)鍵詞:諾如病毒急性胃腸炎分子流行病學(xué)調(diào)查研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:研究背景諾如病毒是杯狀病毒科、諾如病毒屬,依據(jù)諾如病毒基因編碼RdRp或者衣殼氨基酸序列的不同,諾如病毒可以分為五個基因組(Genogroup)GⅠ-GⅤ,其中導(dǎo)致人群急性胃腸炎的主要是GⅠ和G Ⅱ組諾如病毒,而GⅡ.4基因型導(dǎo)致諾如病毒胃腸炎暴發(fā)和散發(fā)最常見,而且諾如病毒基因重組導(dǎo)致的暴發(fā)和散發(fā)也越來越被人們重視。研究目的本研究收集了北京市解放軍總醫(yī)院急性腹瀉標(biāo)本,通過對諾如病毒陽性標(biāo)本的篩選、諾如病毒基因分型,以及通過檢索數(shù)據(jù)庫中有關(guān)諾如病毒的數(shù)據(jù),初步探討北京地區(qū)諾如病毒胃腸炎的流行病學(xué)特征。研究方法由于諾如病毒目前尚不能在體外環(huán)境中培養(yǎng),而且沒有有效的諾如病毒動物模型,本研究采用從腹瀉患者糞便標(biāo)本中直接提取病毒核酸,并采用RT-PCR技術(shù)將核酸擴(kuò)增,最后測序分型的方法,對北京地區(qū)諾如病毒分子流行病學(xué)特征進(jìn)行分析。研究結(jié)果本研究共收集腹瀉標(biāo)本685份,檢測到諾如病毒陽性標(biāo)本66份,陽性率為9.6%(66/685),男性腹瀉標(biāo)本中共檢出36份陽性,女性30份,陽性率分別為9.9%(36/365)、9.4%(30/320),檢出率在男女患者之間未發(fā)現(xiàn)有統(tǒng)計學(xué)差異(p=0.829);檢出率在各年齡組間也未發(fā)現(xiàn)有統(tǒng)計學(xué)關(guān)聯(lián)。住院患者的檢出率為5.05%,門診患者的檢出率為10.72%,卡方檢驗并未發(fā)現(xiàn)有統(tǒng)計學(xué)差異(p=0.082);諾如病毒胃腸炎在時間分布上也沒有出現(xiàn)明顯的季節(jié)性。對66份陽性標(biāo)本ORF2區(qū)測序分型,其中成功分型的有43份,GⅠ組諾如病毒共10份,占22.7%,包括G Ⅰ.3型2份、GⅠ.4型1份、G Ⅰ.5型4份、G Ⅰ.7型3份;GⅡ組諾如病毒共33份,占77.3%,其中以GⅡ.4型為主,占60.6%(20/33),其它包括GⅡ.2型1份、GⅡ.3型1份、,GⅡ.5型1份、GⅡ.6型2份、GⅡ.7型1份、GⅡ.12型7份。出現(xiàn)GⅠ組和G Ⅱ組諾如病毒混合感染的有6例,成功分型的有G Ⅰ.3/GⅡ.7、 G Ⅰ.5/GⅡ.5、G Ⅰ.4/GⅡ.4。通過對部分標(biāo)本編碼RdRp區(qū)基因分型發(fā)現(xiàn),諾如病毒間存在重組現(xiàn)象,其中檢測到重組變種G Ⅱ.g/G Ⅱ.12和G Ⅱ.12/GⅡ.3,重組位點(diǎn)位于ORF1/ORF2重疊區(qū)上游,而且GⅡ.g/GⅡ.12變種首次在國內(nèi)被檢測到。通過檢索諾如病毒數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn),北京地區(qū)重組現(xiàn)象普遍,其中已經(jīng)檢測到的有Ⅰ.a/Ⅰ.3、Ⅰ.d/Ⅰ.3、Ⅰ.b/Ⅰ.6、Ⅰ.d/Ⅰ.3、Ⅱ.n/Ⅱ.22、Ⅱ.12/Ⅱ.3、Ⅱ.7/Ⅱ.14、Ⅱ.g/Ⅱ.12。研究結(jié)論諾如病毒陽性率為9.6%(66/685),陽性率在性別間、年齡組間、門診和住院患者間都沒有統(tǒng)計學(xué)差異;諾如病毒的流行沒有明顯的季節(jié)趨勢;諾如病毒胃腸炎以腹痛、惡心、嘔吐、發(fā)熱為主要癥狀。通過對諾如病毒測序分析,腹瀉患者諾如病毒呈現(xiàn)基因多樣性,而且以G Ⅱ組為主,其中G Ⅱ.42006a和2006b是主要的流行變種,而且存在GⅠ和G Ⅱ組混合感染的現(xiàn)象。諾如病毒間存在重組現(xiàn)象,G Ⅱ.g ORF1和GⅡ.12ORF2之間、GⅡ.12ORF1和GⅡ.3ORF2之間存在重組,而且此兩種重組類型已經(jīng)在世界范圍內(nèi)流行。通過對檢索到的數(shù)據(jù)庫中的諾如病毒分型發(fā)現(xiàn),北京地區(qū)檢測到的基因型有多種,包括GⅠ.4、Ⅰ.8、GⅡ.4、GⅡ.15、GⅡ.16基因型,而且GⅡⅡ.4基因型全部為2006b變種;GⅠ和GⅡ組內(nèi)諾如病毒各有重組發(fā)生,而且重組的種類很多,這些重組在世界其它地方都被檢測到,而且GⅡ組內(nèi)的重組影響范圍比GⅠ組廣
【關(guān)鍵詞】:急性胃腸炎 諾如病毒 分子流行病學(xué)
【學(xué)位授予單位】:山東大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2012
【分類號】:R181.3
【目錄】:
  • 中文摘要6-8
  • 英文摘要8-10
  • 引言10-13
  • 第一部分 諾如病毒檢測與基因分型13-25
  • 材料和方法13-17
  • 結(jié)果17-22
  • 討論22-25
  • 第二部分 諾如病毒基因重組鑒定25-36
  • 材料和方法26-27
  • 結(jié)果27-30
  • 討論30-36
  • 第三部分 北京地區(qū)諾如病毒分子生物學(xué)特征分析36-43
  • 方法36-37
  • 結(jié)果37-38
  • 討論38-43
  • 結(jié)論43-44
  • 參考文獻(xiàn)44-50
  • 綜述一50-56
  • 參考文獻(xiàn)55-56
  • 綜述二56-70
  • 參考文獻(xiàn)64-70
  • 致謝70-71
  • 攻讀學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文71-72
  • 學(xué)位論文評閱及答辯情況72

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 吳疆;高志勇;劉桂榮;劉園;李潔;羅明;吳曉娜;賈蕾;竇相峰;嚴(yán)寒秋;;北京地區(qū)諾如病毒感染的流行病學(xué)調(diào)查[J];中華流行病學(xué)雜志;2007年07期


  本文關(guān)鍵詞:諾如病毒急性胃腸炎分子流行病學(xué)調(diào)查研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號:383520

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