2013年濟南市麻疹病毒的基因型及流行狀況分析
本文關(guān)鍵詞:2013年濟南市麻疹病毒的基因型及流行狀況分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:[研究背景] 麻疹是由麻疹病毒引起的一種以發(fā)熱、呼吸道卡他癥狀和全身斑丘疹為特征的急性呼吸道傳染病,病后有持久免疫力。是我國法定的丙類傳染病。 60年代初我國麻疹減毒活疫苗問世,隨著擴大免疫規(guī)劃的開展,麻疹流行基本上得到控制。但近些年來,由于麻疹病毒的基因變異,又導(dǎo)致麻疹發(fā)病率的回升,并且年齡分布也有所改變。隨著改革開放、經(jīng)濟發(fā)展加快,同時人口流動增加,部分兒童麻疹疫苗漏種或免疫失敗,加上初免后隨著年齡增長而免疫力逐漸降低等原因,致使麻疹小規(guī)模流行時有發(fā)生。 麻疹病毒是單股負鏈RNA病毒,目前發(fā)現(xiàn)8個基因組(A-H)23個基因型(A,B1-3,Cl-2, D1-10, E,F,Gl-3, H1-2),具有六個結(jié)構(gòu)基因編碼六個主要結(jié)構(gòu)蛋白。其中N基因C末端456bp序列為變異度最大的基因片段,是WHO規(guī)定鑒定基因性別所需的最少序列。 1993年~2012年我國共分的2756株麻疹病毒分離株,發(fā)現(xiàn)6個基因型,其中H1為絕對優(yōu)勢流行株,即我國的本土株。徐文波等按2%基因變異劃分基因亞型,將中國的優(yōu)勢流行株H1基因型毒株劃分為3個亞型:H1a、H1b、H1c。其中Hla亞型病毒是中國流行的主要亞型病毒,H1b占第2位,Hlc亞型病毒的流行已由1993~1994年的強勢轉(zhuǎn)為1995~2012年的弱勢。 現(xiàn)階段,有關(guān)麻疹病毒的基因變異、現(xiàn)行疫苗的預(yù)防作用及成人麻疹等問題成為國內(nèi)外研究的熱點,WHO要求將消滅麻疹作為無脊髓灰質(zhì)炎地區(qū)的下一個目標,對麻疹病毒的監(jiān)測和研究變得更加緊迫。因此,濟南市麻疹病毒的監(jiān)測工作需要繼續(xù)加強開展。2013年之前濟南市對麻疹病毒的研究局限于血清學監(jiān)測和免疫水平監(jiān)測方面,對麻疹本土流行株的基因分型以及對抗原漂移的闡述工作開展較少,現(xiàn)有必要從分子流行病學方面深入研究其對麻疹病毒的傳播和流行的影響,闡明我市麻疹野毒株的抗原變異特點。本篇論文從基因變異、病毒流行、抗體水平這三點著手研究,為加速我國麻疹防控提供強有力的科學依據(jù)。 [研究目的] 1.了解2013年濟南市麻疹病毒野毒株的基因型及基因變異特點。 2.描述2013年濟南市麻疹病毒的“三間分布”特征,分析麻疹病毒的流行趨勢。 3.了解麻疹病毒在健康人群中的抗體水平,為麻疹的防控提供科學依據(jù)。 [研究方法] 一.麻疹野毒株基因變異特征研究方法 1.采集2013年濟南市疑似麻疹患者的咽拭子和尿液標本,用熒光PCR方法進行鑒定,對麻疹病毒陽性的樣本使用Vero-Slam細胞分離病毒。 2.提取病毒培養(yǎng)液中的RNA,用一步RT-PCR方法擴增麻疹病毒編碼核蛋白(nucleoprotein)的N基因C末端456bp核苷酸片段,擴增產(chǎn)物直接測序后使用DNAstar軟件將測序結(jié)果與國際標準株比對并進行生物信息學分析。 3.使用MEGA軟件將測序結(jié)果與同時期國內(nèi)、國外的野毒株序列結(jié)果構(gòu)建麻疹野毒株的遺傳進化樹,分析親緣關(guān)系。 二.麻疹病毒流行趨勢的研究方法 1.依照《全國麻疹監(jiān)測方案》2009年版的指示,及時對麻疹病例的信息上報中國疾病預(yù)防控制中心疾病監(jiān)測信息系統(tǒng)并進行結(jié)果錄入。 2.將來自于中國疾病預(yù)防控制中心疾病監(jiān)測信息系統(tǒng)的傳染病報告信息管理系統(tǒng)的麻疹病例的信息進行歸納整理。 3.使用Excel對疫情資料進行數(shù)據(jù)分析,使用Epi-Info軟件繪制病例的地理分布,使用SPSS軟件對數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計學分析。了解濟南市2013年麻疹病例在時間、地區(qū)、人群的“三間分布”,掌握麻疹病毒在濟南市的疫情流行情況及變化趨勢。 4.對麻疹病例的免疫史進行總結(jié)分析。 5.對麻疹病例的臨床癥狀數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析。 三.麻疹病毒在健康人群中抗體水平的分析方法 1.使用酶聯(lián)免疫方法對健康人群血清中的麻疹抗體(IgG)水平進行檢測,探討不同地區(qū)、不同人群的麻疹減毒活疫苗對流行病毒株的保護效果。 2.使用酶聯(lián)免疫方法對適齡兒童免疫前后血清中的麻疹抗體(IgG)水平進行檢測,分析免疫成功率。 3.使用SPSS軟件對數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計學分析。 [研究結(jié)果] 一.麻疹野毒株基因變異特征研究結(jié)果 1.采集2013年濟南地區(qū)的麻疹疑似病例標本,共151份,其中咽拭子91份,尿標本60份,經(jīng)熒光PCR檢測得到陽性咽拭子樣本30份,陽性率為33.33%,陽性尿標本4份,陽性率為6.67%。30份麻疹病毒陽性咽拭子中分離到19株麻疹病毒,4份尿標本中分離到2株麻疹病毒。21份陽性毒株中咽拭子標本和尿標本均來自不同病例,無重合。 2.21株麻疹野毒株經(jīng)對N基因C末端456bp的RT-PCR進行同源性分析證實均為H1a基因型,其中未發(fā)現(xiàn)疫苗相關(guān)株(A基因型),表明H1a亞型為2013年濟南市優(yōu)勢流行株。以麻疹病毒H1a標準株(china93-2)的相應(yīng)核苷酸以及核苷酸序列推導(dǎo)的氨基酸序列為標準,21個標本的456個核苷酸中有9處基因突變屬于同義突變。遺傳距離為0-0.017。 3.從遺傳進化樹可得21株麻疹病毒基因和國內(nèi)、國外分離得到的H1a毒株在同一分支中,說明全球流行情況保持一致,其中存在兩個小的分支提示可能存在兩個不同的小基因變異鏈同時流行。 二.麻疹病毒流行狀況的研究結(jié)果 1.2013年濟南市發(fā)病率為4.46/10萬(299/6704036),呈現(xiàn)明顯的春季流行,槐蔭區(qū)、天橋區(qū)、歷城區(qū)為前三位的發(fā)病地區(qū)。 2.麻疹病毒主要侵犯1歲以下的兒童,其中,0~7月齡占64%(105/164)。其次為20歲以上的成人。不同年齡組間的男女性別差異無統(tǒng)計學意義。 3.發(fā)病病例中有免疫接種記錄的人群為10例,占總發(fā)病數(shù)的3.3%,其他均為不詳。其中0~1歲的為6例,1~5歲的為3例,20歲以上的1例。 4.臨床癥狀分布除發(fā)熱、出疹之外前四位為咳嗽、卡它癥狀、結(jié)膜炎和柯氏斑,可供臨床參考。 三.麻疹病毒在健康人群中抗體水平的研究結(jié)果 1.采集的295份健康人群血清中,IgG陽性率為90.51%(267/295),GMC為1901.25(IU/ml)。陽性率和GMC水平與國內(nèi)其他地區(qū)一些報告基本一致。三個地區(qū)中,不同地區(qū)的抗體陽性率差異有統(tǒng)計學意義,商河縣的陽性率和GMC最高。不同性別間麻疹抗體陽性率差異無統(tǒng)計學意義。各年齡組中麻疹抗體陽性率差異有統(tǒng)計學意義,2歲~4歲組陽性率和GMC最高,GMC水平隨著年齡的增長大致呈下降的趨勢。 2.對45例8月齡以下嬰兒麻疹免疫前后的抗體水平進行監(jiān)測,顯示免疫前抗體陽性率33.33%,免疫后IgG抗體陽性率為100%,GMC水平也從801.15IU/ml提高到2862.32IU/ml。 [結(jié)論] 1.21株麻疹野毒株為H1a基因型。 2.對比Hla參考株,21株麻疹野毒株456bp核苷酸片段中,有義突變7處,遺傳距離為1-0.017,提示有遺傳變異正在發(fā)生。 3.遺傳進化樹中,H1a分支中提示有兩個小分支正在流行,需引起重視。 4.應(yīng)考慮對重點區(qū)(縣)加大麻疹的防控、監(jiān)督力度。 5.應(yīng)考慮對20歲以上的大年齡組人群補種麻疹疫苗,其中育齡婦女人群是重點補種對象。 6.及時對適齡兒童進行免疫接種對阻斷麻疹的傳播有非常顯著的效果。
【關(guān)鍵詞】:麻疹病毒 基因型 流行病學 抗體水平監(jiān)測
【學位授予單位】:山東大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R373;R181.3
【目錄】:
- 中文摘要6-10
- ABSTRACT10-16
- 符號說明16-17
- 前言17-21
- 第一部分 2013年濟南市麻疹病毒的基因型分析21-39
- 研究目的21
- 材料與方法21-25
- 結(jié)果25-37
- 討論37-38
- 結(jié)論38-39
- 第二部分 2013年濟南市麻疹病毒的監(jiān)測資料分析39-49
- 研究目的39
- 材料與方法39-42
- 結(jié)果42-47
- 討論47-48
- 結(jié)論48-49
- 第三部分 2013年健康人群中麻疹抗體水平的監(jiān)測49-55
- 研究目的49
- 材料與方法49-51
- 結(jié)果51-53
- 討論53-54
- 結(jié)論54-55
- 參考文獻55-60
- 致謝60-61
- 攻讀學位期間發(fā)表的學術(shù)論文目錄61-62
- 學位論文評閱及答辯情況表62
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
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本文關(guān)鍵詞:2013年濟南市麻疹病毒的基因型及流行狀況分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號:370124
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