淡色庫(kù)蚊溴氰菊酯抗性基因XN-P450的克
本文關(guān)鍵詞:淡色庫(kù)蚊溴氰菊酯抗性基因XN-P450的克隆、分析及CYP6F1的表達(dá),由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:淡色庫(kù)蚊是一種分布極廣的全球性衛(wèi)生害蟲(chóng),能夠傳播多種致命疾病。對(duì)其的防治主要是使用各類化學(xué)殺蟲(chóng)劑,這引起了殺蟲(chóng)劑抗性的產(chǎn)生和發(fā)展。淡色庫(kù)蚊抗性機(jī)理及抗性基因的研究成為熱點(diǎn)。本論文以淡色庫(kù)蚊為材料進(jìn)行了以下三方面的實(shí)驗(yàn): 1.比較使用了五種改良的方法:異硫氰酸胍法、Trizol法、Trizol+CTAB法、改良的Trizol法和CTAB法,從淡色庫(kù)蚊抗性品系中提取總RNA,通過(guò)對(duì)所提總RNA的純度、濃度、完整性以及耗用時(shí)間等方面進(jìn)行比較,并以實(shí)時(shí)熒光定量PCR的方法來(lái)定量比較了五種方法所提取產(chǎn)物中RNA的拷貝數(shù),結(jié)果顯示:改良的CTAB法為淡色庫(kù)蚊總RNA提取的最優(yōu)法。 2.以淡色庫(kù)蚊抗性相關(guān)的EST(EC093830.1)序列為模板,設(shè)計(jì)基因特異性引物,通過(guò)RACE的方法克隆得到了長(zhǎng)為1637bp的cDNA全長(zhǎng)序列——XN-P450。確定其開(kāi)放閱讀框長(zhǎng)1521bp,通過(guò)軟件對(duì)其進(jìn)行氨基酸、跨膜區(qū)、亞細(xì)胞定位、二級(jí)結(jié)構(gòu)及酶切位點(diǎn)等的預(yù)測(cè)。結(jié)果表明XN-P450編碼蛋白質(zhì)有506個(gè)氨基酸,二級(jí)結(jié)構(gòu)有53.16%的α螺旋,14.62%的β折疊及32.21%的環(huán),含4個(gè)主要的跨膜螺旋;經(jīng)亞細(xì)胞定位發(fā)現(xiàn)該蛋白多定位于線粒體和細(xì)胞質(zhì),且多在分泌通道部位,有多種酶類的切割位點(diǎn),這些都指明了該蛋白是一類能夠參與代謝、分泌等多種反應(yīng)的膜蛋白,推測(cè)其參與了淡色庫(kù)蚊的代謝抗性;通過(guò)定量PCR發(fā)現(xiàn)XN-P450在淡色庫(kù)蚊抗性中的表達(dá)量是敏感品系的1.58倍,這進(jìn)一步證實(shí)其在淡色庫(kù)蚊的抗藥性中扮演著代謝抗性執(zhí)行者的角色。 3. CYP6FI是淡色庫(kù)蚊抗性基因中研究比較透徹且比較典型的一例,該基因有著抗性代謝解毒酶基因最大一類的細(xì)胞色素P450的一些保守特征。本研究合成特異性引物,并以淡色庫(kù)蚊不同發(fā)育時(shí)期的幼蟲(chóng)、蛹及成蟲(chóng)所提RNA反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA為模板,進(jìn)行定量PCR鑒定。結(jié)果發(fā)現(xiàn)CYP6FI對(duì)于β-actin的相對(duì)表達(dá)量在淡色庫(kù)蚊體內(nèi)隨著發(fā)育時(shí)期的延長(zhǎng)在不斷增加,即相對(duì)于比較敏感的幼蟲(chóng),,具有抗性的成蟲(chóng)中該基因是超表達(dá)的。 綜上所述,以篩選得到的最合適淡色庫(kù)蚊RNA提取的方法為基礎(chǔ),克隆得到抗性基因XN-P450,分析其結(jié)構(gòu)及所編碼的蛋白質(zhì)序列,預(yù)測(cè)其功能,并檢測(cè)其在抗性與敏感品系中的表達(dá)差異,以確定該基因與抗性的相關(guān)性;定量檢測(cè)CYP6FI在不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)量的變化趨勢(shì)。通過(guò)以上三部分研究為淡色庫(kù)蚊總RNA提取找到一條最優(yōu)途徑,并且豐富了抗性基因的內(nèi)容,為新型殺蟲(chóng)劑的研發(fā)和使用提供了理論指導(dǎo),共同為蚊蟲(chóng)的有效防治提供理論基礎(chǔ)。
【關(guān)鍵詞】:淡色庫(kù)蚊 抗性基因 CYP6F1 表達(dá) 生物信息學(xué)分析
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2012
【分類號(hào)】:R184
【目錄】:
- 摘要5-7
- ABSTRACT7-11
- 第一章 文獻(xiàn)綜述11-24
- 1.1 蚊蟲(chóng)防治和殺蟲(chóng)劑抗性11-13
- 1.2 昆蟲(chóng)的抗藥性機(jī)理13-17
- 1.2.1 代謝抗性13-15
- 1.2.1.1 細(xì)胞色素 P450 單加氧酶14
- 1.2.1.2 非專一性酯酶14-15
- 1.2.1.3 谷胱甘肽-S-轉(zhuǎn)移酶15
- 1.2.2 靶標(biāo)抗性15-16
- 1.2.2.1 乙酰膽堿酯酶15
- 1.2.2.2 鈉離子通道15-16
- 1.2.2.3 γ-氨基丁酸受體氯離子通道16
- 1.2.3 抗藥性的遺傳研究16-17
- 1.3 抗性基因研究技術(shù)17-18
- 1.4 淡色庫(kù)蚊殺蟲(chóng)劑抗性相關(guān)基因研究現(xiàn)狀18-22
- 1.4.1 我國(guó)近年對(duì)淡色庫(kù)蚊抗性的監(jiān)測(cè)18-19
- 1.4.2 淡色庫(kù)蚊抗性基因研究狀況19-22
- 1.4.2.1 細(xì)胞色素 P450 家族的研究19-20
- 1.4.2.3 鈉離子通道基因的研究20
- 1.4.2.4 絲氨酸蛋白酶基因家族的研究20-21
- 1.4.2.5 視蛋白基因的研究21
- 1.4.2.6 跨膜蛋白基因的研究21-22
- 1.4.2.7 蚊核糖體蛋白基因的研究22
- 1.5 研究?jī)?nèi)容和意義22-24
- 第二章 不同方法提取淡色庫(kù)蚊總 RNA 的定量比較分析24-34
- 2.1 材料與方法24-28
- 2.1.1 總 RNA 的提取25-26
- 2.1.2 總 RNA 核酸濃度檢測(cè)與電泳檢測(cè)26
- 2.1.3 總 RNA 的純化26-27
- 2.1.4 反轉(zhuǎn)錄及其產(chǎn)物檢測(cè)27
- 2.1.5 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR(基于標(biāo)準(zhǔn)曲線的絕對(duì)定量)27-28
- 2.2 結(jié)果與分析28-31
- 2.2.1 五種方法獲得總 RNA 的純度、產(chǎn)量及電泳檢測(cè)28-29
- 2.2.2 總 RNA 經(jīng) DnaseI 純化的結(jié)果29-30
- 2.2.3 五種方法方法耗時(shí)比較30
- 2.2.4 反轉(zhuǎn)錄及其 PCR 產(chǎn)物電泳結(jié)果分析30-31
- 2.2.5 五種方法所提總 RNA 定量分析31
- 2.3 討論31-34
- 第三章 淡色庫(kù)蚊溴氰菊酯抗性相關(guān)基因 XN-P450 cDNA 的克隆與生物信息學(xué)分析34-45
- 3.1 材料與方法34-37
- 3.1.1 淡色庫(kù)蚊抗性與敏感品系蚊蟲(chóng)的總 RNA 的提取34
- 3.1.2 cDNA 第一鏈的合成34-35
- 3.1.2.1 3’-RACE-Ready- cDNA 的合成34-35
- 3.1.2.2 5’-RACE-Ready-cDNA 的合成35
- 3.1.3 EST 的引物驗(yàn)證及結(jié)果測(cè)序35
- 3.1.4 淡色庫(kù)蚊溴氰菊酯抗性相關(guān)基因的 3’、5’-RACE 擴(kuò)增、檢測(cè)35-36
- 3.1.4.1 3’-RACE PCR35-36
- 3.1.4.2 5’-RACE PCR36
- 3.1.5 基因測(cè)序36
- 3.1.5.1 RACE 產(chǎn)物的純化36
- 3.1.5.2 克隆36
- 3.1.5.3 陽(yáng)性克隆檢測(cè)36
- 3.1.5.4 測(cè)序結(jié)果的比對(duì)分析36
- 3.1.6 全長(zhǎng) cDNA 的擴(kuò)增36
- 3.1.7 生物信息學(xué)分析36-37
- 3.1.8 定量分析37
- 3.2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析37-43
- 3.2.1 抗性與敏感品系庫(kù)蚊的總 RNA 提取37-38
- 3.2.2 cDNA 第一鏈的合成38
- 3.2.3 EST 引物驗(yàn)證38
- 3.2.4 3’、5’- RACE 擴(kuò)增及測(cè)序38
- 3.2.5 全長(zhǎng) cDNA 的擴(kuò)增38-40
- 3.2.6 全長(zhǎng)基因的生物信息學(xué)分析40-43
- 3.2.7 定量分析該基因在兩種品系蚊蟲(chóng)中的差異表達(dá)43
- 3.3 討論43-45
- 第四章 淡色庫(kù)蚊抗性基因 CYP6F1 的時(shí)序性表達(dá)45-50
- 4.1 材料與方法45-46
- 4.1.1 不同發(fā)育時(shí)期淡色庫(kù)蚊總 RNA 的提取45-46
- 4.1.2 總 RNA 的純化、反轉(zhuǎn)錄46
- 4.1.3 實(shí)時(shí)熒光定量 PCR(相對(duì)定量)46
- 4.2 結(jié)果及分析46-48
- 4.2.1 不同發(fā)育時(shí)期庫(kù)蚊總 RNA 提取的濃度和純度46
- 4.2.2 總 RNA 的純化及反轉(zhuǎn)錄46-47
- 4.2.3 定量結(jié)果47-48
- 4.3 討論48-50
- 第五章 結(jié)論50-51
- 參考文獻(xiàn)51-57
- 致謝57-58
- 作者簡(jiǎn)介58
【參考文獻(xiàn)】
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本文關(guān)鍵詞:淡色庫(kù)蚊溴氰菊酯抗性基因XN-P450的克隆、分析及CYP6F1的表達(dá),由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):362430
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