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自噬相關(guān)基因多態(tài)性與江蘇漢族人群女性乳腺癌遺傳易感性的關(guān)聯(lián)研究

發(fā)布時(shí)間:2017-04-26 07:12

  本文關(guān)鍵詞:自噬相關(guān)基因多態(tài)性與江蘇漢族人群女性乳腺癌遺傳易感性的關(guān)聯(lián)研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤,嚴(yán)重威脅著全球女性健康。據(jù)統(tǒng)計(jì),,2008年全球有138萬(wàn)乳腺癌新發(fā)病例,約占女性所有惡性腫瘤新發(fā)病例的23%,一半以上的乳腺癌新發(fā)病例和死亡病例都來(lái)自于發(fā)展中國(guó)家。乳腺癌也是我國(guó)女性最常見的惡性腫瘤,且其發(fā)病率仍以每年3-5%的速度遞增,發(fā)病年齡呈現(xiàn)年輕化的趨勢(shì)。因此,如何識(shí)別高危人群,針對(duì)性地開展預(yù)防和篩查,降低乳腺癌的發(fā)病率和死亡率是當(dāng)前面臨的重要挑戰(zhàn)。 乳腺癌的發(fā)生發(fā)展是遺傳因素與環(huán)境因素共同作用的結(jié)果,而遺傳背景的差異可能影響個(gè)體在相同暴露因素下對(duì)乳腺癌的易感性。迄今為止,乳腺癌遺傳易感性的研究已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了一些與其發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)的基因,比如目前已經(jīng)確定的高共顯性基因,包括經(jīng)典的BRCA1/BRCA2抑癌基因,共濟(jì)失調(diào)毛細(xì)血管擴(kuò)張癥突變基因ATM以及TP53基因等,這些高共顯性基因與家族性乳腺癌的發(fā)生密切相關(guān),而且它們的突變可以顯著增加乳腺癌的患病風(fēng)險(xiǎn)。研究發(fā)現(xiàn),大約25%的家族性乳腺癌的病人可以歸因于這些基因的突變,但是這些高共顯性的基因在一般人群中的頻率又極低,只能解釋不到5%的散發(fā)性的乳腺癌病人,這些結(jié)果提示我們一些低共顯性基因的變異在乳腺癌的發(fā)生發(fā)展中同樣起到不可忽視的作用。近年來(lái),全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)作為研究復(fù)雜性疾病強(qiáng)有力的工具,也先后發(fā)現(xiàn)了染色體1p11,5p12,6q25,8q24,14q24等多個(gè)乳腺癌易感區(qū)域,但是由于GWAS研究對(duì)疾病的選擇有所限制,不但需要非常大的樣本量來(lái)篩選易感位點(diǎn),對(duì)于低頻率的SNP需要更大的測(cè)序工作量來(lái)保證篩選工作的有效性,而且這些位點(diǎn)也僅僅能解釋不到30%的家族性乳腺癌發(fā)病原因。因此,大量候選基因的遺傳變異在乳腺癌的發(fā)生發(fā)展中所起的重要作用就有可能彌補(bǔ)乳腺癌的遺傳易感信息缺失。 自噬,又稱為II型程序性細(xì)胞死亡,在進(jìn)化過(guò)程中高度保守,普遍存在于真核細(xì)胞,是細(xì)胞維持生存的一種重要機(jī)制。在饑餓、缺氧等狀態(tài)下,細(xì)胞迫切需要能量產(chǎn)生,為了減少自身?yè)p傷,細(xì)胞依靠自噬作用對(duì)受損的細(xì)胞器或生物大分子物質(zhì)進(jìn)行降解,以實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)胞內(nèi)成分的循環(huán)利用并提供能量,從而維持其正常的生命活動(dòng)。自噬在腫瘤的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中起到抑制和促進(jìn)的雙重作用。一方面,自噬抑制或缺失可以導(dǎo)致細(xì)胞的惡性轉(zhuǎn)化,進(jìn)而產(chǎn)生自發(fā)性腫瘤,如自噬基因Beclin1敲除的小鼠乳腺癌的發(fā)生率升高,另一方面,由于細(xì)胞遭遇應(yīng)激(如抗腫瘤藥物)時(shí),自噬可以保護(hù)細(xì)胞并提高其存活能力,可見自噬激活也可能有利于腫瘤的發(fā)展。由此可見,自噬相關(guān)基因在促進(jìn)乳腺癌的發(fā)展進(jìn)程以及影響其預(yù)后方面均發(fā)揮著重要的作用。 在自噬體形成過(guò)程中,與自噬體發(fā)生相關(guān)的兩個(gè)必要過(guò)程已經(jīng)被認(rèn)識(shí):(1)在自噬體的形成中依賴于Ⅲ型磷脂酰肌醇三磷酸激酶(Class III PI3K)的作用,Class III PI3K與Beclin1形成復(fù)合體介導(dǎo)囊泡成核,促使其他自噬蛋白的定位,形成杯狀的分隔膜,促進(jìn)自噬體膜的形成;(2)在自噬體形成的過(guò)程中,兩條泛素樣蛋白加工修飾途徑:ATG12-ATG5結(jié)合途徑和LC3修飾途徑在自噬體膜的擴(kuò)展中起著促進(jìn)自噬膜的伸展擴(kuò)展,使之由開始的小囊泡樣、杯樣結(jié)構(gòu)逐漸發(fā)展為半環(huán)狀、環(huán)狀結(jié)構(gòu)的作用。參與這兩個(gè)過(guò)程的關(guān)鍵分子可以發(fā)揮致癌或者抑癌基因的作用,影響包括乳腺癌在內(nèi)的多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展。目前關(guān)于自噬基因遺傳變異的多態(tài)性研究多集中在肺結(jié)核、炎癥性腸病以及胃癌,尚未見自噬基因多態(tài)性與乳腺癌易感性的關(guān)聯(lián)研究報(bào)道。因此,為了探索自噬過(guò)程在乳腺癌發(fā)生中的作用,研究自噬通路相關(guān)基因多態(tài)性與乳腺癌易感性的關(guān)系有助于進(jìn)一步闡明乳腺癌的遺傳易感機(jī)制。 本研究選取了參與自噬體形成的兩個(gè)過(guò)程的12個(gè)基因(BECN1, VMP1,UVRAG, AMBRA1, SH3GLB1, TP53INP2, ATG3, ATG5, ATG7, ATG10, ATG12和LC3),聯(lián)合Hapmap、SNPinfo等多個(gè)公共數(shù)據(jù)庫(kù)資源結(jié)合HaploView軟件篩選了23個(gè)功能性單核苷酸多態(tài)性(SNPs)位點(diǎn),采用病例對(duì)照研究設(shè)計(jì)探討自噬相關(guān)基因多態(tài)性與江蘇漢族女性人群乳腺癌易感性之間的關(guān)聯(lián),應(yīng)用IlluminaInfinium BeadChip (Illumina lnc.)平臺(tái)在1064例來(lái)自2004年1月至2010年4月收集的南京周邊地區(qū)經(jīng)病理組織學(xué)確診的新發(fā)乳腺癌病例和來(lái)自2004年至2006年期間江蘇省進(jìn)行社區(qū)慢性非傳染性疾病篩查的健康人群1073例年齡匹配的健康女性對(duì)照中進(jìn)行基因型檢測(cè)。采用χ~2檢驗(yàn)或t檢驗(yàn)比較人口學(xué)特征、乳腺癌發(fā)病相關(guān)因素及23個(gè)多態(tài)位點(diǎn)基因型頻率在病例組和對(duì)照組間的分布。采用logistic回歸(調(diào)整因素為年齡、初潮年齡以及絕經(jīng)狀態(tài))分析計(jì)算優(yōu)勢(shì)比(oddsratio,OR)及其95%可信區(qū)間(confidence interval,CI),估計(jì)各多態(tài)性位點(diǎn)與乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián)強(qiáng)度,分層分析和多因素logistic回歸控制混雜因素對(duì)分析結(jié)果的影響。 研究發(fā)現(xiàn),參與調(diào)節(jié)Beclin1-Vps34-p150復(fù)合體功能的UVRAG基因上游4.5kb的多態(tài)性rs7126727(CA)與乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在統(tǒng)計(jì)學(xué)關(guān)聯(lián)(OR=0.84,95%CI=0.71-0.99, P=0.040)。與CC基因型相比,每增加一個(gè)A等位基因,乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)平均下降16%。分層分析顯示,該位點(diǎn)在首胎活產(chǎn)高年齡組效應(yīng)更顯著(首胎活產(chǎn)年齡24歲:OR=1.09,95%CI=0.80-1.49;首胎活產(chǎn)年齡≥24歲:OR=0.74,95%CI=0.60-0.91)(交互作用P值=0.041),其余的年齡、初潮年齡、絕經(jīng)狀態(tài)以及雌激素受體(estrogen receptor)狀態(tài)、孕激素受體(progestrone receptor)狀態(tài)各層亞組中均不存在顯著差異(P0.05)。此外,本研究未發(fā)現(xiàn)位于VMP1、AMBRA1、SH3GLB1、TP53INP2基因8個(gè)位點(diǎn)與乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在顯著關(guān)聯(lián)。 在參與促使自噬體膜擴(kuò)展的兩條泛素樣蛋白加工修飾途徑的5個(gè)基因14個(gè)功能性SNP位點(diǎn)中,位于ATG10基因第6外顯子rs1864182(AC)和第2內(nèi)含子區(qū)域rs10514231(AG)與乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)顯著相關(guān)(rs1864182:OR=0.77,95%CI=0.61-0.96,P=0.023;rs10514231:OR=0.75,95%CI=0.59-0.93,P=0.010)。此外,位于該基因第6外顯子區(qū)域的rs1864183G等位基因可降低乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=0.82,95%CI=0.68-1.00),但尚未達(dá)到統(tǒng)計(jì)學(xué)水準(zhǔn)(P=0.052)。分層分析顯示在未絕經(jīng)、月經(jīng)初潮年齡早(16歲)、首胎活產(chǎn)年齡大(≥24歲)、ER陽(yáng)性或者PR陽(yáng)性的女性中效應(yīng)更加顯著。進(jìn)一步研究基因環(huán)境交互作用發(fā)現(xiàn),rs1864182和首胎活產(chǎn)年齡在乳腺癌發(fā)病危險(xiǎn)中具有顯著的交互作用(交互作用P值=0.025)。此外,本研究未發(fā)現(xiàn)ATG3, ATG5, ATG7, ATG12以及ATG10其他11個(gè)位點(diǎn)與乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)存在顯著關(guān)聯(lián)。 本研究首次系統(tǒng)篩選了參與自噬體形成兩個(gè)過(guò)程12個(gè)基因23個(gè)位點(diǎn),并在中國(guó)人群中探討自噬相關(guān)基因多態(tài)性位點(diǎn)與乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的關(guān)聯(lián),研究結(jié)果表明位于調(diào)節(jié)Beclin1-Vps34-p150復(fù)合體功能的UVRAG基因上游4.5kb(rs7126727)和自噬體形成泛素樣蛋白加工修飾途徑ATG10基因第6外顯子和第2內(nèi)含子位置(rs1864182和rs10514231)的多態(tài)性與中國(guó)江蘇漢族人群女性乳腺癌的遺傳易感性相關(guān)。這些研究結(jié)果顯示自噬相關(guān)基因多態(tài)性可能參與乳腺癌的發(fā)生,影響個(gè)體對(duì)乳腺癌的易感性。本研究發(fā)現(xiàn)的乳腺癌相關(guān)位點(diǎn)可能作為易感性生物標(biāo)志物用于乳腺癌高危人群篩選,對(duì)乳腺癌預(yù)防和早期篩檢具有一定的指導(dǎo)意義。
【關(guān)鍵詞】:乳腺癌 自噬 單核苷酸多態(tài)性 UVRAG ATG10
【學(xué)位授予單位】:南京醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R737.9;R181.3
【目錄】:
  • 中文摘要5-9
  • Abstract9-12
  • 前言12-18
  • 材料與方法18-27
  • 結(jié)果27-36
  • 討論36-41
  • 總結(jié)41-42
  • 參考文獻(xiàn)42-47
  • 綜述47-61
  • 參考文獻(xiàn)57-61
  • 附錄61-64
  • 附錄一、論文縮略詞表61-62
  • 附錄二、發(fā)表論文62-64
  • 致謝64

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 鄭瑩,李德

本文編號(hào):327976


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