發(fā)布時(shí)間：2017-04-21 14:06

  本文關(guān)鍵詞：青海省2000-2011年麻疹病毒的分子流行病學(xué)研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的研究2000～2011年引起青海省麻疹流行的麻疹病毒的基因型特征,分析麻疹病毒的來源、傳播和基因分布,進(jìn)一步累積并豐富青海省本土流行的麻疹病毒的基因和氨基酸變異資料,并及時(shí)發(fā)現(xiàn)可能的輸入病毒,為該地區(qū)進(jìn)一步控制和消除麻疹提供科學(xué)依據(jù)。 方法使用淋巴信號(hào)激活因子轉(zhuǎn)染的非洲綠猴腎細(xì)胞(Vero/SLAM細(xì)胞)對麻疹疑似病例的咽拭子和/或尿標(biāo)本進(jìn)行病毒分離。經(jīng)逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(reverse transcript polymerase chain reaction, RT-PCR)方法對分離的麻疹病毒進(jìn)行N基因羧基(carboxyl, COOH)末端676個(gè)核苷酸片段的擴(kuò)增。通過對上述RT-PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行核苷酸序列測定和分析,以N基因COOH末端450個(gè)核苷酸序列片段構(gòu)建基因親緣性關(guān)系樹,并進(jìn)行核苷酸和氨基酸同源性分析,分析與疫苗株S191、中國麻疹H1a代表株China9322N蛋白羧基末端150個(gè)氨基酸的變異及2000～2011年麻疹流行株間N蛋白羧基末端150個(gè)氨基酸的變異。 結(jié)果青海省2000～2011年分離的19株麻疹野病毒,均為H1基因型中的H1a基因亞型。19株H1a基因亞型麻疹野病毒N基因COOH末端序列分析結(jié)果顯示,它們之間的核苷酸同源性為96.0%～100%,氨基酸同源性為92.7%～100%；與H1a基因型代表株Chin9322的核苷酸同源性為97.1%～99.5%,氨基酸同源性為94.0%～99.3%；以中國麻疹疫苗株S191為基準(zhǔn),青海省2000～2011年分離到的19株麻疹病毒共有32個(gè)氨基酸發(fā)生置換,置換率為21.3%(32/150),有16個(gè)氨基酸位點(diǎn)全部發(fā)生變異,有16個(gè)位點(diǎn)為部分氨基酸變異；青海省2000～2011年分離到的19株麻疹病毒與中國麻疹Hla代表株China9322的氨基酸差異為1～8個(gè),2009～2011年的10株麻疹病毒與China9322的氨基酸差異明顯增多；與2000～2005年的麻疹病毒流行株相比,2009～2011年的麻疹病毒N蛋白基因序列推導(dǎo)的氨基酸均有共同的3個(gè)氨基酸變化,在422位點(diǎn)由甘氨酸(G)變異為絲氨酸(S),在457位點(diǎn)由S變異為G,在497位點(diǎn)由精氨酸(R)變異為賴氨酸(K)。 結(jié)論青海省2000～2011年流行的麻疹野病毒仍以本土基因亞型Hla為絕對優(yōu)勢基因亞型,未發(fā)現(xiàn)Hlb和Hlc亞型；2000～2005年分離到的的麻疹病毒在同一小分支,形成傳播鏈1,2009-2011年分離到的麻疹病毒在另一小分支,形成傳播鏈2。隨著年份增加,19株麻疹病毒與中國麻疹疫苗株S191和中國麻疹Hla代表株China9322之間的氨基酸差異呈現(xiàn)增加趨勢。2009～2011年的麻疹病毒N蛋白基因序列推導(dǎo)的氨基酸均有共同的3個(gè)氨基酸變異,提示應(yīng)關(guān)注N蛋白氨基酸變異狀況及變化趨勢。
【關(guān)鍵詞】：麻疹病毒 H1a基因亞型 序列測定和分析
【學(xué)位授予單位】：山西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2012
【分類號(hào)】：R181.3
【目錄】：

• 摘要5-6
• Abstract6-8
• 前言8-9
• 1. 材料與方法9-15
• 1.1 標(biāo)本來源9
• 1.2 細(xì)胞來源9
• 1.3 試劑及主要實(shí)驗(yàn)儀器9-11
• 1.3.1 試劑9-10
• 1.3.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器10-11
• 1.4 實(shí)驗(yàn)方法11-15
• 1.4.1 Vero/SLAM細(xì)胞培養(yǎng)11-12
• 1.4.2 病毒分離12-13
• 1.4.3 增殖病毒13
• 1.4.4 病毒RNA提取13
• 1.4.5 逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(Reverse transcript polymerase chain reaction,RT-PCR)13-14
• 1.4.6 PCR產(chǎn)物的檢測及鑒定14
• 1.4.7 PCR產(chǎn)物切膠純化14
• 1.4.8 標(biāo)記反應(yīng)14-15
• 1.4.9 標(biāo)記反應(yīng)產(chǎn)物純化15
• 1.4.10 序列測定15
• 1.4.11 序列整理和其他相關(guān)分析軟件15
• 2. 結(jié)果15-25
• 2.1 標(biāo)本基本情況15
• 2.2 青海省麻疹病毒的地理分布15-16
• 2.3 麻疹病毒分離結(jié)果16
• 2.4 用于研究的麻疹野毒株及其標(biāo)準(zhǔn)命名16-17
• 2.5 RT-PCR結(jié)果17
• 2.6 基因親緣性關(guān)系分析17-18
• 2.7 核甘酸和氨基酸同源性分析18-21
• 2.8 氨基酸變異分析21-25
• 2.8.1 與疫苗株S191相比N蛋白羧基末端150個(gè)氨基酸的變異分析21
• 2.8.2 與中國H1a基因型代表株China9322相比N蛋白的氨基酸變異分析21
• 2.8.3 青海省2000～2011年麻疹流行株間N蛋白氨基酸位點(diǎn)變異分析21-25
• 3. 討論25-27
• 結(jié)論27
• 參考文獻(xiàn)27-29
• 文獻(xiàn)綜述29-39
• 1 麻疹病毒的生物學(xué)特征29-30
• 2 麻疹病毒的基因型30-32
• 3 發(fā)病機(jī)制32
• 4 臨床表現(xiàn)及并發(fā)癥32-33
• 5 流行病學(xué)33-34
• 6 實(shí)驗(yàn)室診斷34
• 7 預(yù)防與治療34-36
• 綜述參考文獻(xiàn)36-39
• 個(gè)人簡歷39-40
• 致謝40

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前5條

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  本文關(guān)鍵詞：青海省2000-2011年麻疹病毒的分子流行病學(xué)研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號(hào)：320488