【摘要】：第一部分：2009-2010年上海地區(qū)人副流感病毒流行病學(xué)研究及HPIV-3基因特征分析目的：研究上海地區(qū)上呼吸道感染患兒中人副流感病毒(Human Parainfluenza viruse, HPIVs)的流行病學(xué)規(guī)律,以及人3型副流感病毒(HPIV-3)的基因特征,為中國(guó)大陸地區(qū)人副流感病毒的分子流行病學(xué)研究積累數(shù)據(jù)。材料和方法：1.收集2009年6月7日至2010年6月5日在上海交通大學(xué)附屬新華醫(yī)院發(fā)熱門(mén)診就診的有發(fā)熱、咳嗽、流涕和咽痛等散發(fā)上呼吸道感染癥狀的患兒咽拭子標(biāo)本164例。2.采用多重RT-PCR方法檢測(cè)其包括HPIV1-4在內(nèi)的多種常見(jiàn)呼吸道病原,并對(duì)HPIVs在嬰幼兒呼吸道感染中所占的比例、性別、年齡和季節(jié)分布進(jìn)行分析。3.選擇檢測(cè)出的HPIV-3陽(yáng)性樣本,用兩對(duì)引物擴(kuò)增出HPIV-3 HN基因的全長(zhǎng)并測(cè)序,根據(jù)序列測(cè)定結(jié)果進(jìn)行核苷酸和氨基酸的同源性分析,應(yīng)用比鄰法(Neighbor-Joining Tree)建立HPIV-3 HN基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果：1.164例患兒咽拭子標(biāo)本均用Seeplex(?)RV15 ACE方法檢測(cè),共檢測(cè)出病毒感染陽(yáng)性病例129例,總檢出率達(dá)78.7%,其中HPIVs檢測(cè)總陽(yáng)性率為42.7%(70/164),是檢出率最高的呼吸道病毒。70例HPIVs陽(yáng)性標(biāo)本中,HPIV-1檢出14例,陽(yáng)性率為8.5%(14/164)；HPIV-2檢出30例,陽(yáng)性率為18.3%(30/164)；HPIV-3檢出23例,陽(yáng)性率為14.0%(23/164)；HPIV-4檢出3例,陽(yáng)性率為1.8%(3/164)。2.70例HPIVs陽(yáng)性標(biāo)本中,45.7%(32/70)存在混合感染。HPIVs感染在12-24月組患兒檢出人數(shù)最多為74.1%(40/54),在0-12月組檢出人數(shù)最低為9.7%(6/62), HPIVs在各年齡組間檢出率差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=50.408,P=0.000)。HPIVs感染患兒男女間檢出率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=1.844,P=0.204)。3.本地區(qū)HPIVs感染具有明顯的季節(jié)性分布,春季(76.5%)和夏季(47.2%)的檢出率高于秋季(32.3%)和冬季(22.2%),四個(gè)季節(jié)總檢出率差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=14.594,P=0.002)。4.基因同源性分析表明,5株HPIV-3上海株之間核苷酸和氨基酸的同源性分別為99.0-99.5%和99.7-100%,與11株國(guó)內(nèi)代表株系的HPIV-3之間核苷酸和氨基酸的同源性分別為97.1-99.8%和99.0-100%；與日本(除去GP株)、印度和沙特阿拉伯這三個(gè)亞洲國(guó)家的HPIV-3之間核苷酸和氨基酸的同源性分別為96.0-98.7%和97.0-99.5%；與美國(guó)(除去俄克拉何馬州)、加拿大和澳大利亞的HPIV-3之間核苷酸和氨基酸的同源性分別為94.4-95.4%和96.7-97.7%,同源性最低。5.系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)把5株HPIV-3上海株和36株代表株系共41株分為了A、B、C三個(gè)進(jìn)化群,C群又進(jìn)一步分為4個(gè)亞群C1-C4。C群主要由2002-2011年期間在亞洲國(guó)家發(fā)現(xiàn)的HPIV-3構(gòu)成,傳播范圍較廣,涉及日本、印度、沙特阿拉伯和中國(guó),可能是現(xiàn)今亞洲地區(qū)HPIV-3流行的主要基因型。5株上海株和中國(guó)北京2008-2009年間的多個(gè)HPIV-3分離株都屬于C3a株系,其中ShangHai.210與BJ001/08、ShangHai.1261與BJ001/08、ShangHai.1431與BJ005/08、ShangHai.1431與BJ270/09之間核苷酸的同源性分別為99.6%、99.4%、99.4%和99.1%,但是其氨基酸的同源性都為100%。結(jié)論：1.HPIVs在上海地區(qū)嬰幼兒呼吸道感染中占有重要地位,42.7%的患兒HPIVs檢測(cè)陽(yáng)性,其中HPIV-2感染人數(shù)最多,HPIV-1和HPIV-3次之。2.HPIVS感染有明顯的年齡分布特征,而無(wú)性別分布差異,在12-24月年齡組患兒檢出人數(shù)最多。HPIVs感染也具有明顯的季節(jié)性分布,流行高峰在春夏季。3.系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)把41株HPIV-3株系分為了A、B、C三個(gè)進(jìn)化群,C群是現(xiàn)今亞洲地區(qū)流行的主要基因型。5株上海株和中國(guó)北京2008-2009年間的多個(gè)HPIV-3分離株都屬于C3a株系,提示上海株可能是由北京株C3a亞群衍化而來(lái)。5株上海株與亞洲國(guó)家的多個(gè)HPIV-3株系均在同一亞群內(nèi),同源性也比較高,提示不同HPIV-3分離株之間的進(jìn)化很可能具有地域相關(guān)性。第二部分：1996-2013年中國(guó)人群中副流感病毒感染流行病學(xué)的Meta分析目的：綜合分析中國(guó)人群副流感病毒感染的流行狀況,為PIVs感染的診斷和相關(guān)疾病的防治提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)和科學(xué)根據(jù)。資料和方法：在Pubmed、相關(guān)期刊論文CNKI、維普中文科技期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù)、萬(wàn)方數(shù)據(jù)庫(kù)中檢索所有有關(guān)副流感病毒流行情況的文獻(xiàn),按照納入及排除標(biāo)準(zhǔn)篩選出質(zhì)量合格的文獻(xiàn),整理并制作成數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行Meta分析。結(jié)果：初選獲得493篇文獻(xiàn),最終納入文獻(xiàn)52篇,總樣本量為186,053例。我國(guó)急性呼吸道感染(ARI)患者中副流感病毒(PIVs)的綜合感染率為6.8%：0-3歲組(≤1歲組7.7%和1-3歲組8.9%)PIVs綜合感染率高于3歲組(6.8%),PIVs綜合感染率在男女性別間差異無(wú)顯著性；不同季節(jié)ARI患者PIVs的綜合感染率分別為春季8.2%、夏季8.0%、秋季6.6%和冬季5.1%；上、下呼吸道感染中PIVs的綜合感染率分別為7.2%和8.9%,PIVs感染較易引起支氣管炎(9.3%)、肺炎(8.2%)和支氣管肺炎(8.7%),毛細(xì)支氣管炎的綜合感染率稍低(7.1%)。結(jié)論：不同地區(qū)ARI患者PIVs的感染率各不相同；PIVs感染與患兒年齡呈負(fù)相關(guān),與男女性別無(wú)關(guān)；PIVs的綜合感染率春夏季偏高；PIVs感染以急性下呼吸道感染為主,主要為支氣管炎、肺炎和支氣管肺炎等。
【學(xué)位授予單位】：復(fù)旦大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號(hào)】：R725.1;R181.3
【圖文】：

產(chǎn)物１５份，陽(yáng)性率為９．１％（１５／１６４），腺病毒（ＡＤＶ）和呼吸道合胞病毒Ｂ化ＳＶＢ）逡逑的陽(yáng)性擴(kuò)增產(chǎn)物均為］４份，陽(yáng)性率均為８．５％邋（１４／１６４），其余病毒檢出情況見(jiàn)逡逑表６，各病毒檢出結(jié)果見(jiàn)圖５。逡逑表６．１６４例患兒標(biāo)本多重ＰＣＲ檢測(cè)結(jié)果逡逑陽(yáng)性數(shù)邐陽(yáng)性率（0／0）逡逑ＨＲＶ邐３７邐７Ｘ６逡逑ＦｌｕＡ邐３２邐１９．５逡逑ＨＰＩＶ－２邐３０邐１８．３逡逑ＨＰＩＶ－３邐２３邐１４．０逡逑ＨＥＶ邐１５邐９．１逡逑ＨＰＩＶ－１邐１４邐８．５逡逑ＡＤＶ邐１４邐８．５逡逑民邋ＳＶＢ邐１４邐８．５逡逑２２邋化／ＮＬ６３邐８邐４．９逡逑ＨＢｏＶ邐６邐３．７逡逑民邋ＳＶＡ邐５邐３．０逡逑郵邋Ｂ邐５邐３．０逡逑ＨＰＩＶ－４邐３邐１．８逡逑ＯＣ４３／ＨＫＵ１邐２邐１．２逡逑ｈＭＰＶ邐１邐０．６逡逑總陽(yáng)性樣本數(shù)量邐１２９邐７８．７逡逑總陰性樣本數(shù)量邐３５邐２１．３逡逑１９逡逑

復(fù)旦大學(xué)碩±學(xué)位論文邐第一部分逡逑（１１／５４），占ＨＰＩＶ－３感染總數(shù)的４７．８％邋（１１／２３），０－１２月年齡組檢出率最低為４．８％逡逑（３／６２），各年齡組間檢出率差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（片７．０３１，Ｐ＝０．０２９）。ＨＰＩＶ－４感染只發(fā)生在１２－３６月患兒，１２－２４月組和２４－３６月組的檢出率分別為３．７％（２／５４）逡逑和２．１％（１／４８），各年齡組間檢出率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（護(hù)２．１８０，邋Ｐ＝０．２９０）。ＨＰＩＶｓ逡逑感染的年齡分布見(jiàn)圖６－１０。逡逑表１０．不同年齡組冊(cè)ＩＶｓ的檢測(cè)情況由（。／訓(xùn)逡逑病毒邋０－１２月邋１２－２４月邋２４－％月邐統(tǒng)計(jì)學(xué)分析逡逑檢出例數(shù)邐＾邐５４邐４８逡逑ＨＰｒＶｓ邐６（９．７）邐４０（７４．１）邐２４（５０．０）邐ｘ＾＝５０．４０８，邐Ｐ＝０．０００逡逑ＨＰＩＶ－１邐３（４．８）邐８（１４．刮邐３（６３）邐％￣＝４．１３３，邐Ｐ＝０．１３０逡逑ＨＰｌＶ－２邐０邐１９（３５．叫邐１１邋口２．９）邋ｘ＾＝３0－８８９，邋Ｐ＝０．０００逡逑ＨＰＩＶ－３邐３（４．８）邐１１（２０．４）邐９（１８．８）邐＾＝７．０３１，邐Ｐ＝０．０２９逡逑ＨＰＩＶ－４邐０邐２（３．７）邐１（２．１）邐Ｐ＝０．２９Ｑ逡逑

圖１０．ＨＰＩＶ＂４年齡分布逡逑６．邋ＨＰＩＶｓ感染的季節(jié)分布逡逑２００９年６月到２０１０年６月研究期間，ＨＰＩＶｓ感染在１１個(gè)月中均有檢出，逡逑但在０９年１２月未檢測(cè)出病毒，１０年５月未收集到咽拭子標(biāo)本，ＨＰＩＶｓ感染的逡逑時(shí)間的分布見(jiàn)圖１１。由圖ｎ可見(jiàn)，ＨＰＩＶｓ感染在２００９年７、８和９月呈現(xiàn)感染逡逑高峰，檢出率分別為邋６０．０％邋（９／１５）、６１０％邋（１７／２７）、５２．２％邋（１２／２３）．邋１０邋月到逡逑２０１０年１月檢出率逐漸降低，從２月到４月ＨＰＩＶｓ的感染又開(kāi)始X椂�，检出率辶x暇衷冢擔(dān)埃埃�，�(duì)輪匭魯魷至說(shuō)詼齦腥靖叻濉１凈齲校桑鄭蟾腥揪哂忻饗藻義系募窘諦苑植跡杭荊ǎ罰叮擔(dān)ィ┖拖募荊ǎ矗罰玻ィ┑募斐雎矢哂誶錛荊ǎ常玻常ィ┖灣義隙荊ǎ玻玻玻ィ�，四更w窘謐薌斐雎什鉅煬哂型臣蒲б庖澹ㄆ保矗擔(dān)梗矗澹校劍埃埃埃玻�。辶x希齲校桑鄭痹誶錚幔叮唬歟ィ�、冬（ＡP矗ィ┝郊鏡募斐雎示哂詿夯

本文編號(hào)：2784071