2010年南京市手足口病流行病學和病原學特征分析
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《蘭州大學》 2012年
2010年南京市手足口病流行病學和病原學特征分析
李靜
【摘要】:目的通過對2010年南京市手足口病流行病學及病原學的分析,了解南京市手足口病的流行規(guī)律和特點,明確引起2010年南京市手足口病流行的病原,并對主要病原進行基因特征分析。進一步了解其進化規(guī)律及特點。 方法采集2010年南京兒童醫(yī)院手足口病患兒的咽拭子標本共248份,使用RD細胞(來源于人橫紋肌肉瘤組織)和VERO細胞(來源于非洲綠猴腎細胞)進行病毒分離。經(jīng)real-time PCR對陽性分離物進行篩選,然后用RT-PCR (reverse transcript polymerase chain reaction,逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應)方法對分離到的EV71和CoxAl6進行VP1編碼區(qū)擴增,并對擴增產(chǎn)物進行核苷酸序列測定;選取來自不同臨床病例類型的20株EV71與其EV71的參考毒株序列構(gòu)建親緣性進化樹,并對其進行核苷酸和氨基酸同源性分析;將分離到的所有CoxAl6進行VP1區(qū)核苷酸和氨基酸同源性分析,并構(gòu)建CoxAl6的親緣性進化樹。 結(jié)果(1)248份咽拭子標本共分離出146株病毒分離物。其中110株EV71,28株CoxAl6,其他腸道病毒8株,檢出率分別為44.35%,11.29%,3.23%。其中有5株為EV71和CoxAl6混合感染。(2)對20株EV71進行VP1區(qū)核苷酸和氨基酸分析,發(fā)現(xiàn)其彼此間同源性較高,分別為95.51%-100%和98.32%~100%。構(gòu)建EV71親緣性進化樹顯示20株EV71與C4a基因亞型的代表株處于同一分支,屬于C4a基因亞型。(3)對28株CoxAl6進行VP1區(qū)核苷酸序列測定分析,發(fā)現(xiàn)它們在VP1區(qū)核苷酸水平和氨基酸水平上有一定差異,同源性分別為90.01%-100%和97.98%-100%。與CoxAl6各基因型和基因亞型的代表株構(gòu)建的親緣進化樹中顯示,28株CoxAl6與B2基因亞型的代表株處于同一分支,說明本地流行的CoxAl6屬于B2基因型,且存在多個傳播鏈。 結(jié)論2010年引起南京市手足口病流行的主要病原為EV71(?)CoxAl6;在南京流行的EV71和CoxAl6分別為C4a和B2基因亞型;手足口病的臨床病例分型與EV71的基因型無相關性;5株與EV71混合感染的CoxAl6與單獨感染的CoxAl6在VP1區(qū)并未發(fā)現(xiàn)有明顯差異;EV71和CA16的混合感染并未加重病人的病情。
【關鍵詞】:
【學位授予單位】:蘭州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2012
【分類號】:R725.1;R181.3
【目錄】:
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本文關鍵詞:2010年南京市手足口病流行病學和病原學特征分析,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
,本文編號:240481
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