廣東省部分地區(qū)豬瘟分子流行病學(xué)調(diào)查
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《山東農(nóng)業(yè)大學(xué)》 2013年
廣東省部分地區(qū)豬瘟分子流行病學(xué)調(diào)查
彭志成
【摘要】:豬瘟是由豬瘟病毒(Classical Swine Fever Virus, CSFV)引起的一種豬的高度接觸性傳染病,每年給養(yǎng)豬業(yè)造成嚴(yán)重經(jīng)濟(jì)損失。1833年,豬瘟最早發(fā)現(xiàn)于美國(guó)的俄亥俄洲,此后,亞洲、非洲、拉丁美洲和歐洲等一些主要養(yǎng)豬的國(guó)家,相繼報(bào)道有豬瘟的爆發(fā)和流行。除南極洲外,豬瘟的流行幾乎覆蓋世界范圍內(nèi)各個(gè)國(guó)家和地區(qū),對(duì)養(yǎng)豬業(yè)構(gòu)成嚴(yán)重威脅。世界動(dòng)物衛(wèi)生組織(OIE)將其列為A類傳染病并將其納入必須申報(bào)的疫病目錄之中,中國(guó)也將其定為Ⅰ類烈性傳染病。 20世紀(jì)90年代末,涂長(zhǎng)春研究員及其同事對(duì)我國(guó)豬瘟進(jìn)行分子流行病學(xué)研究,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在我國(guó)流行的基因型有1.1,2.1,2.2和2.3亞型,2.1亞型毒株占主導(dǎo)地位,其中流行于廣東省的毒株有2.1b,2.2,2.3和1.1亞型。近幾年,陳寧等一些學(xué)者研究表明我國(guó)東南地區(qū)豬瘟流行毒株主要為2.1b毒株。近幾十年,大量研究材料顯示,豬瘟病毒流行毒株有向Ⅱ群演化的趨勢(shì)。在亞洲一些國(guó)家和地區(qū)包括中國(guó)、日本、韓國(guó)和臺(tái)灣地區(qū)的豬瘟病毒流行毒株,由于豬瘟疫苗的選擇壓力等因素發(fā)生了轉(zhuǎn)變。這種轉(zhuǎn)變可能跟豬瘟病毒自身對(duì)宿主選擇壓力的適應(yīng)能力有關(guān)。而我國(guó)廣東省近十幾年豬瘟病毒流行毒株流行態(tài)勢(shì)尚不清楚。 為了充分掌握我國(guó)豬瘟高發(fā)地區(qū)-廣東省豬瘟的流行態(tài)勢(shì)以及CSFV流行毒株的遺傳多樣性,本研究對(duì)2011年來(lái)自廣東省11個(gè)城市所轄區(qū)、縣的不同豬瘟發(fā)病豬場(chǎng)或散養(yǎng)戶415份豬瘟疑似樣本,通過(guò)歐盟豬瘟診斷手冊(cè)推薦使用的巢式RT-PCR方法進(jìn)行豬瘟病毒核酸檢測(cè),共檢出豬瘟陽(yáng)性樣本57份,豬瘟陽(yáng)性率為13.7%。另外,對(duì)于豬瘟病毒檢測(cè)呈陽(yáng)性的樣本,我們又進(jìn)行了豬藍(lán)耳病病毒(PRRSV),豬圓環(huán)病毒2型(PCV-2)和豬偽狂犬病病毒(PRV),三種豬常見病毒病的檢測(cè),57份豬瘟陽(yáng)性樣本中,56份檢出豬圓環(huán)病毒2型(PCV-2),34份檢出高致病豬藍(lán)耳病病毒(PRRSV),1份(GDZC-294)檢出豬偽狂犬病毒(PRV),廣東省豬瘟與豬圓環(huán)、豬藍(lán)耳病混合感染十分嚴(yán)重,豬瘟與豬偽狂犬混合感染較輕,與其它疾病混合感染是當(dāng)今廣東豬瘟防控嚴(yán)峻的問(wèn)題之一。 通過(guò)對(duì)巢式RT-PCR產(chǎn)物進(jìn)行測(cè)序,我們獲得57條廣東省豬瘟病毒E2主要抗原區(qū)域編碼基因序列,參考GenBank收錄的國(guó)內(nèi)外該段基因序列及實(shí)驗(yàn)室以前測(cè)得的序列,利用系統(tǒng)進(jìn)化分析軟件MEGA5.05針對(duì)該段基因(190bp)對(duì)廣東省CSFV流行毒株構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,遺傳進(jìn)化分析表明在該地區(qū)流行的毒株除4株為1.1亞型,其余毒株全部屬于2.1亞型,以前該地區(qū)流行的2.2和2.3亞型毒株在本研究中沒(méi)有發(fā)現(xiàn)。值得注意地是在進(jìn)行豬瘟監(jiān)測(cè)的地區(qū)出現(xiàn)了2個(gè)新的2.1亞亞型,即2.1c和2.1d,這些毒株的流行表明該地區(qū)CSFV毒株遺傳多樣性出現(xiàn)了新的變化。 為長(zhǎng)期保存這些珍貴的生物學(xué)材料,為我國(guó)廣東省豬瘟的防控積累豐富的病毒資源和探索豬瘟病毒在細(xì)胞中的適應(yīng)特點(diǎn)等研究,我們PK-15和EC兩種細(xì)胞對(duì)57豬瘟病毒陽(yáng)性樣本中豬瘟病毒進(jìn)行了分離與培養(yǎng),并初步探索兩種細(xì)胞對(duì)豬瘟病毒的易感性分析。通過(guò)病毒分離的方法,我們共分離出24株豬瘟病毒流行毒株,除該地區(qū)傳統(tǒng)經(jīng)典流行毒株2.1b外,還涵蓋新出現(xiàn)的兩個(gè)亞型毒株2.1c,2.1d毒株,為今后研究該地區(qū)豬瘟病毒提供了物質(zhì)基礎(chǔ)。 豬瘟病毒囊膜糖蛋白E2是病毒識(shí)別和吸附宿主細(xì)胞的病毒結(jié)構(gòu)蛋白,在CSFV增殖過(guò)程中具有重要作用,同時(shí),E2蛋白能夠誘導(dǎo)機(jī)體產(chǎn)生中和抗體,E2的變異與毒株的免疫逃逸有關(guān)。為弄清這兩種新出現(xiàn)的亞亞型E2基因遺傳變異特點(diǎn),我們從57份樣本中選取具有代表性的16份樣本,對(duì)這些毒株的E2全基因進(jìn)行擴(kuò)增、測(cè)序,系統(tǒng)進(jìn)化分析表明16株CSFV流行毒株有15株為基因2.1亞型,另外1株屬于基因1.1亞型,結(jié)果和根據(jù)E2主要抗原編碼基因(190bp)分析結(jié)果一致。根據(jù)E2全基因核苷酸同源性的大小,,我們將2.1亞型豬瘟病毒流行毒株進(jìn)一步劃分為4個(gè)亞亞型2.1a,2.1b,2.1c和2.1d。其中,2.1c和2.1d亞亞型毒株是首次報(bào)道在該地區(qū)流行,到目前為止2.1a毒株尚未發(fā)現(xiàn)在廣東省流行。通過(guò)對(duì)豬瘟病毒E2基因核苷酸的系統(tǒng)進(jìn)化分析和氨基酸序列多序列比對(duì),結(jié)果表明2.1亞型中4個(gè)亞亞型,具有群特異性的氨基酸替換,這些結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)了2.1亞型的分型結(jié)果的正確性。 綜上所述,我們通過(guò)研究覆蓋廣東省大部分地區(qū),來(lái)自不同豬瘟發(fā)病豬場(chǎng)或散養(yǎng)戶的疑似病料,開展對(duì)我國(guó)廣東省分子流行病學(xué)調(diào)查工作,基于E2基因序列的系統(tǒng)進(jìn)化分析和氨基酸多序列比對(duì)證明我國(guó)廣東省CSFV流行毒株遺傳多樣性發(fā)生變化,有新的2.1c和2.1d亞亞型毒株開始在該地區(qū)流行,這些研究結(jié)果將為我國(guó)廣東省豬瘟防控策略的制定提供科學(xué)依據(jù)。
【關(guān)鍵詞】:
【學(xué)位授予單位】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R181.3
【目錄】:
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【參考文獻(xiàn)】
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7 楊坤,鮑作義,李韓平,李林,莊道民,李敬云;河南省HIV-1流行毒株pol基因的分型與系統(tǒng)發(fā)生分析[J];中國(guó)艾滋病性病;2005年03期
8 蔣就喜;李赫偉;周方;駱安德;徐茹;曾思恩;;桂林市HIV-1流行毒株的基因序列測(cè)定和亞型分析[J];廣西師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2010年02期
9 朱洪浩,徐西雁,劉傳楠,林新明,周敦金,彭勁松;武漢市2003年流感監(jiān)測(cè)及當(dāng)前優(yōu)勢(shì)流行毒株的抗原性和基因特性分析[J];中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志;2004年03期
10 俞永新;近年來(lái)西尼羅熱的流行現(xiàn)狀及其流行毒株的表型和基因型特性[J];國(guó)外醫(yī)學(xué).流行病學(xué).傳染病學(xué)分冊(cè);2005年03期
中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 王琴;涂長(zhǎng)春;黃保續(xù);范學(xué)政;郭煥成;蓋華武;高光;江禹;李金花;徐和敏;徐璐;蘭廣義;溫磊;王在時(shí);趙耘;趙啟祖;寧宜寶;沈青春;宋立;;豬瘟流行病學(xué)信息系統(tǒng)(CSF info)的建立及應(yīng)用[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)2006學(xué)術(shù)年會(huì)論文集(下冊(cè))[C];2006年
2 范培虎;危艷武;郭龍軍;黃立平;劉長(zhǎng)明;;2005年~2010年豬繁殖與呼吸綜合征病毒流行毒株的遺傳變異分析[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)畜牧獸醫(yī)生物技術(shù)學(xué)分會(huì)暨中國(guó)免疫學(xué)會(huì)獸醫(yī)免疫分會(huì)第八次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2010年
3 劉道新;陳杰;邱伯根;李曉成;談志祥;邱立新;黃保續(xù);魯杏華;任鳳梅;范仲鑫;;湖南省規(guī)模豬場(chǎng)豬瘟流行毒株分子流行病學(xué)調(diào)查及研究[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)畜牧獸醫(yī)生物技術(shù)學(xué)分會(huì)暨中國(guó)免疫學(xué)會(huì)獸醫(yī)免疫分會(huì)第六次研討會(huì)論文集[C];2005年
4 王澤霖;;雞傳染性支氣管炎流行毒Jin13株的定型鑒定與免疫效力評(píng)價(jià)[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)禽病學(xué)分會(huì)第十五次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2010年
5 尤永君;王茹英;朱小甫;王永件;劉志強(qiáng);;一株雞新城疫流行毒株的分離鑒定及油乳劑滅活苗免疫效果評(píng)價(jià)[A];首屆中國(guó)黃羽肉雞行業(yè)發(fā)展大會(huì)會(huì)刊[C];2008年
6 龔文杰;曾政;查云峰;邵明富;范金紅;孫彥偉;余興龍;江禹;涂長(zhǎng)春;;動(dòng)物狂犬病流行毒株的抗原性差異分析[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)生物制品學(xué)分會(huì)中國(guó)微生物學(xué)會(huì)獸醫(yī)微生物學(xué)專業(yè)委員會(huì)2010年學(xué)術(shù)年會(huì)(第三屆中國(guó)獸藥大會(huì)學(xué)術(shù)論壇)論文集[C];2010年
7 涂長(zhǎng)春;;中國(guó)豬瘟病毒分子流行病學(xué)研究進(jìn)展[A];第一屆中國(guó)養(yǎng)豬生產(chǎn)和疾病控制技術(shù)大會(huì)——2005中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2005年
8 王旭榮;宋長(zhǎng)緒;楊增岐;李春玲;王貴平;黃忠;祝衛(wèi)國(guó);;5株廣東省豬繁殖與呼吸綜合征流行毒株主要結(jié)構(gòu)蛋白基因的變異分析[A];第一屆中國(guó)養(yǎng)豬生產(chǎn)和疾病控制技術(shù)大會(huì)——2005中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)學(xué)術(shù)年會(huì)論文集[C];2005年
9 薛景景;;雞新城疫病毒(La Sota株)、雞傳染性支氣管炎病毒(M41株)、禽流感病毒(H9亞型,HL株)三聯(lián)滅活苗與H9亞型禽流感病毒流行毒株交叉免疫研究[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)禽病學(xué)分會(huì)第十四次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2008年
10 郭龍軍;陸月華;危艷武;黃立平;劉長(zhǎng)明;;我國(guó)部分地區(qū)豬圓環(huán)病毒2型流行毒株的遺傳變異分析[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)家畜傳染病學(xué)分會(huì)第七屆全國(guó)會(huì)員代表大會(huì)暨第十三次學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集(上冊(cè))[C];2009年
中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 李天舒;[N];健康報(bào);2008年
2 王哲 薛曉玲 趙飛 袁源 孫國(guó)清 朱新朋;[N];中國(guó)中醫(yī)藥報(bào);2006年
3 白毅;[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2008年
4 陳滟;[N];國(guó)際商報(bào);2007年
5 記者 陳滟 通訊員 彭彤彤;[N];中國(guó)國(guó)門時(shí)報(bào);2007年
6 邵斌 實(shí)習(xí)記者 郝東方;[N];大眾科技報(bào);2003年
7 特約記者 曾利明;[N];醫(yī)藥導(dǎo)報(bào);2006年
8 中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué) 趙繼勛 張國(guó)中;[N];中國(guó)畜牧獸醫(yī)報(bào);2006年
9 鄭靈巧;[N];健康報(bào);2006年
10 滬檢;[N];中國(guó)國(guó)門時(shí)報(bào);2007年
中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 陳寧;攜帶流行毒株E2基因的重組豬瘟病毒C株的拯救與鑒定[D];浙江大學(xué);2009年
2 王興龍;豬繁殖與呼吸綜合征病毒流行毒株NSP2基因遺傳變異及GM-CSF對(duì)GP3/GP5的免疫增強(qiáng)作用研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年
3 唐青海;豬瘟病毒NS2蛋白功能的研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2010年
4 韓雪清;豬瘟病毒E2基因遺傳變異及體外表達(dá)研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2002年
5 郭抗抗;豬瘟病毒的shRNA干擾、強(qiáng)弱毒鑒別及基因工程疫苗研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2010年
6 李素;豬瘟病毒感染血管內(nèi)皮細(xì)胞的差異蛋白質(zhì)及細(xì)胞因子表達(dá)變化分析[D];吉林大學(xué);2011年
7 胡杰;廣西種豬場(chǎng)豬瘟監(jiān)控方法的建立及其應(yīng)用[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年
8 何雷;豬瘟病毒NS5A蛋白在病毒致病中作用的研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2012年
9 李艷伍;貂阿留申病病毒流行毒株分子特征及其VP2基因重組桿狀病毒免疫特性研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年
10 陳鍇;豬瘟慢性感染對(duì)豬免疫功能影響的細(xì)胞與分子機(jī)制研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年
中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條
1 彭志成;廣東省部分地區(qū)豬瘟分子流行病學(xué)調(diào)查[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年
2 唐紅慧;豬瘟兔化弱毒苗抗原量測(cè)定方法的探索及不同免疫程序的差異性比較研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2010年
3 李曉華;龍巖市規(guī);i場(chǎng)豬瘟流行病學(xué)調(diào)查及其控制[D];福建農(nóng)林大學(xué);2010年
4 譚穎翌;廣西部分規(guī)模豬場(chǎng)種豬群豬瘟感染情況調(diào)查及免疫效果評(píng)估[D];廣西大學(xué);2012年
5 吳顯實(shí);廣西豬瘟流行毒株全基因組的克隆與序列分析[D];廣西大學(xué);2003年
6 李玲偉;我國(guó)部分省區(qū)豬瘟病毒E0、E2基因遺傳變異分析及流行株全基因測(cè)定與分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2010年
7 鄭逢梅;豬流行性腹瀉流行毒株部分基因分子特征及防治措施研究[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年
8 官丁明;IBDV地方流行毒株的分離鑒定及生物學(xué)特性研究[D];廣西民族大學(xué);2010年
9 孫石靜;廣西豬瘟流行毒株E_2基因的克隆與序列分析[D];廣西大學(xué);2002年
10 陳立力;云南和廣西HIV-1流行毒株的基因變異和分子進(jìn)化研究[D];中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2011年
本文關(guān)鍵詞:廣東省部分地區(qū)豬瘟分子流行病學(xué)調(diào)查,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):236765
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