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廣東南澳廣州管圓線蟲宿主小尺度空間分析及蟲體遺傳多樣性研究

發(fā)布時間:2018-03-04 22:22

  本文選題:廣州管圓線蟲 切入點:小管福壽螺 出處:《中國疾病預(yù)防控制中心》2017年碩士論文 論文類型:學(xué)位論文


【摘要】:目的掌握廣東省南澳島廣州管圓線蟲中間宿主小管福壽螺和褐云瑪瑙螺以及終末宿主鼠的密度及其感染狀況、基于村級小尺度研究宿主空間分布特征及規(guī)律,探索空間分析技術(shù)和空間建模技術(shù)在廣州管圓線蟲宿主空間分析中的適用性。同時分析南澳地區(qū)廣州管圓線蟲的遺傳多樣性,探討蟲株類型及其來源,并研究我國不同地區(qū)廣州管圓線蟲蟲株間的親緣關(guān)系,從而為廣州管圓線蟲及其宿主的防控提供方法學(xué)參考和理論依據(jù)。方法1.采用分層隨機抽樣法從廣東省南澳島抽取3個行政村作為研究區(qū)域,分別于2015年12月~2016年9月每個季度對研究區(qū)域內(nèi)廣州管圓線蟲的中間宿主小管福壽螺和褐云瑪瑙螺以及終末宿主鼠的密度及其感染狀況進(jìn)行現(xiàn)場調(diào)查。采用肺檢法結(jié)合酶消化法和勻漿法檢測小管福壽螺體內(nèi)廣州管圓線蟲Ⅲ期幼蟲感染情況,褐云瑪瑙螺采用酶消化法和勻漿法檢測。鼠類采用鼠籠法捕獲,將捕獲的鼠鑒定鼠種后,水淹法處死并解剖其心肺組織,檢查蟲體感染情況。用 GPS 儀(GPS map 60CS,Garmin Corp.,Kansas,USA)記錄各采樣點的經(jīng)緯度和高程,同時收集季節(jié)、孳生環(huán)境、水系分布、離居民區(qū)距離等數(shù)據(jù)。2.借助于Arc GIS10.2(ESRI Corp.,USA)及其空間分析技術(shù)擬合半變異函數(shù)對宿主感染率數(shù)據(jù)基于村級小尺度進(jìn)行空間自相關(guān)性分析,同時運用SatScan9.4(NCI,USA)基于Possion模型對小管福壽螺和鼠的空間分布進(jìn)行空間聚集性分析,并基于蒙特卡洛模擬法構(gòu)建統(tǒng)計量對數(shù)似然比(Likelihood Ratio,LLR)來判斷其最大可能聚集區(qū),最后運用Arc GIS10.2(ESRI Corp.,USA)中地理統(tǒng)計工具分別構(gòu)建普通最小二乘法模型(Ordinary least squares regression model,OLS)和地理加權(quán)回歸模型(Geographically weighted regression model,GWR)來研究宿主感染率空間分布與其影響因素間的關(guān)系,并比較這兩種模型的擬合效果。3.解剖從廣東南澳捕獲的鼠,從其心肺組織(包括肺血管)收集廣州管圓線蟲成蟲;同時從采獲的小管福壽螺和瑪瑙螺中收集廣州管圓線蟲Ⅲ期幼蟲,實驗室接種SD大鼠6周后從中收集成蟲。提取成蟲基因組DNA,PCR特異性擴增核糖體DNA內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)2(internal transcribed spacer 2,ITS2)和線粒體DNA細(xì)胞色素氧化酶Ⅰ亞基(cytochrome c oxidase subunit I,COI)基因序列并測序,運用ClustalX1.83比對序列,DnaSP5.10分析序列特征及遺傳多樣性。從GenBank和文獻(xiàn)報道上獲取我國部分地區(qū)廣州管圓線蟲相應(yīng)基因序列,運用Mega6.06基于Kumara雙參數(shù)模型計算各地區(qū)蟲株間的遺傳距離,并分別基于鄰接法和最大似然法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹分析各地區(qū)蟲株間親緣關(guān)系。結(jié)果1.共采獲小管福壽螺2191只,隨機抽取1190只用于檢測,檢測到感染性螺72只,平均感染率為6.05%(72/1190)。采獲褐云瑪瑙螺24只,檢測到感染性螺20只,感染率為83.33%(20/24)。共捕獲鼠110只,包括褐家鼠(Rattus norvegicus)、黃胸鼠(Rattus flavipectus)、臭,

本文編號:1567570

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