本文關(guān)鍵詞：應(yīng)用MLST系統(tǒng)進(jìn)行中國幽門螺桿菌的分子流行病學(xué)研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

應(yīng)用MLST系統(tǒng)進(jìn)行中國幽門螺桿菌的分子流行病學(xué)研究

第三軍醫(yī)大學(xué)碩士學(xué)位論文

息進(jìn)行ＭＬＳＴ分析，得到菌株的等位基因圖譜。確定Ｈｐｙ腸一臨床分離株的序列分型（ＳｅｑｕｅｎｃｅＴｙｐｅ，ＳＴ），并與國際菌株進(jìn)行比較。應(yīng)用ＢＵＲＳＴ（Ｂａｓｅｄ

ＳｅｑｕｅｎｃｅＵｐｏｎＲｅｌａｔｅｄＴｙｐｅｓ）運(yùn)算規(guī)則將菌株歸為各個(gè)譜系組（ｃｌｏｎａｌｃｏｍｐｌｅｘ），應(yīng)用ＳＴＡＲＴ程序計(jì)

ｏｆ算相關(guān)系數(shù)（ｉｎｄｅｘａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ，厶）并進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建。

４．針對ｖ以ｃＡ基因信號區(qū)及中間區(qū)序列設(shè)計(jì)引物，檢測Ｈｐｙ如ｒｆ的等位基因，１，日ｃＡｓｌａ、ｖ口ｃＡｓｌｂ、ｖ以ｃＡｓ２、ｖ以ｃＡｍ１、ｖ以ｃＡｍ２。確定菌株所屬的ｖ以ｃＡ基因亞型。

結(jié)果：

１．ＰｃＲ擴(kuò)增所篩選的Ｈｐ），勵一的８個(gè)管家基因的核心核酸片段，對４０株日．ｐｙ勵以臨床分離株進(jìn)行ＭＬＳＴ分析，８個(gè)基因座位多態(tài)性位點(diǎn)從ａｔｐＡ的１．７７％到ｍｕｔＹ的３．８６％不等。一共獲得了３８個(gè)ＳＴｓ序列型，均為在幽門螺桿菌ＭＬＳＴ數(shù)據(jù)庫中未報(bào)道的。

２．菌株核酸序列的ＳＴ型結(jié)果按類平均數(shù)聚類方法（ＵＰＧＭＡ）繪制進(jìn)化樹，得到的樣本菌株樹形聚類圖，，顯示了菌株的親緣關(guān)系，可將４０株ＨｐｙｆＤ訂菌株大致分為三大類。

３．ｖ口ｃＡ基因分型結(jié)果，ｖ口ｃＡｓｌａ陽性為３３株（８２．５％），ｖ以叢ｓｌｂ陽性為７株（１７．５％），ｖ口ｃＡｍ２陽性為３９株（９７．５％），未發(fā)現(xiàn)Ｊ２型菌株，其中標(biāo)準(zhǔn)株ＮＣＴＣｌｌ６３７和１１６３８的結(jié)果為ｖ口ｃＡｓ１“ｍ１型。

結(jié)論：

１．首次應(yīng)用ＭＬｓＴ的方法對中國４個(gè)大城市的ＨｐｙＺＤ一臨床分離株進(jìn)行了研究，本實(shí)驗(yàn)中等位基因的多樣性與Ｈｐｙ脅一ＭＬＳＴ數(shù)據(jù)庫中之前的研究結(jié)果差異不大。所得到的ＳＴｓ序列型，不屬于原有的譜系。同時(shí)Ｓｉｎ９１ｅｔｏｎ序列型在本實(shí)驗(yàn)中占了大部分（９５％），與其它基因型相比它們代表了遺傳距離較遠(yuǎn)的基因型。

２．對幽門螺桿菌菌株進(jìn)行了ｖ口ｃＡ基因分型，結(jié)果以ｓ１“ｍ２型為主，消化性潰瘍組與慢性胃炎組之間ｓｌａ型有顯著性差異，而ｍ２型差異無顯著性。提示可能從消化性潰瘍患者胃粘膜標(biāo)本中分離出ｖ以ｃＡｊＪｆ口型的可能性高于其他慢性胃炎的患者，而１，口ｃＡｍ２型則與Ｈｐｙ脅一相關(guān)胃部疾病的相關(guān)性不大。

３．由于樣本量的限制，ｖ日甜基因分型結(jié)果與ＭＬＳＴ序列型之間未發(fā)現(xiàn)明確關(guān)聯(lián)，但是可以相信隨著ＨｐｙｆＤ—ＭＬＳＴ數(shù)據(jù)的增加，可以更加明確基因型間的遺傳相關(guān)性。ｍ１、

關(guān)鍵詞：幽門螺桿菌；多位點(diǎn)序列分析；ｖ以ｃＡ基因；管家基因；序列型

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