北京地區(qū)社區(qū)獲得性耐甲氧西林金黃色葡萄球菌的流行病學(xué)和分子機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2017-10-26 08:03
本文關(guān)鍵詞:北京地區(qū)社區(qū)獲得性耐甲氧西林金黃色葡萄球菌的流行病學(xué)和分子機(jī)制研究
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【摘要】:背景:社區(qū)獲得性耐甲氧西林的金黃色葡萄球菌(Community-associated methicillin-resistant Staphylococcus aureus, CA-MRSA)與院內(nèi)獲得性MRSA相比,在耐藥性、分子特征和流行方式等諸多方面有著明顯的區(qū)別。CA-MRSA在社區(qū)的流行為疾病已經(jīng)開始威脅健康人群,為社區(qū)疾病的預(yù)防和治療帶來了新的挑戰(zhàn)。院內(nèi)獲得性MRSA在世界范圍內(nèi)進(jìn)行了深入和廣泛的研究,而對(duì)于CA-MRSA則認(rèn)識(shí)有限,本研究目的在于對(duì)CA-MRSA進(jìn)行前瞻性研究,以獲取CA-MRSA在我國(guó)的流行情況和耐藥數(shù)據(jù),并通過分子生物學(xué)方法探求CA-MRSA和HA-MRSA在遺傳背景上的異同;利用DNA芯片技術(shù)對(duì)CA-MRSA和HA-MRSA進(jìn)行全基因組范圍的比較和分析,試圖揭示在CA-MRSA中是哪些基因?qū)ζ鋫鞑?毒力和致病其著至關(guān)重要的作用。 方法:前瞻性收集北京4所醫(yī)院的社區(qū)獲得性皮膚軟組織感染的病例,對(duì)每一位病例填寫病例報(bào)告表收集病史信息,分析CA-MRSA感染的疾病特點(diǎn)。對(duì)分離標(biāo)本進(jìn)行病原學(xué)檢查,收集所有的分離菌株。對(duì)所有分離到的金黃色葡萄球菌進(jìn)行瓊脂稀釋法抗生素敏感性試驗(yàn)和SCCmec、MLST、spa和毒素基因篩查的研究。采用DNA芯片技術(shù)進(jìn)行HA-MRSA和CA-MRSA的比較基因組學(xué)分析。 結(jié)果:從4所不同的醫(yī)院一共入組皮膚軟組織病例501例,總共分離到164株金黃色葡萄球菌,其中有5株為CA-MRSA菌株。這5株CA-MRSA菌株SCCmec分型分別是SCCmecⅠ,Ⅲ,Ⅳ,Ⅴ和一株未分型。藥敏實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示這5株CA-MRSA對(duì)β內(nèi)酰胺類抗生素、左氧氟沙星、紅霉素和克林霉素具有較高的耐藥性,而對(duì)萬古霉素、替考拉寧、利奈唑胺和復(fù)方磺胺敏感。分子特征的研究顯示PVL基因在甲氧西林敏感的金黃色葡萄球菌中的陽性率為41.9%,在5株CA-MRSA中共發(fā)現(xiàn)2株為PVL陽性菌株。其他的毒素在MSSA和MRSA中的表達(dá)水平也相當(dāng)。結(jié)合MLST分型和spa分型在MSSA中主要的克隆是ST398-t034, ST7-t796, ST398-t571, ST1-t127,和ST188-t189;而在CA-MRSA中主要的克隆是ST239-t037-SCCmec I, ST239-t632-SCCmec III, ST59-t437-SCCmec V, ST8-t008-SCCmec IV.除去功能未知的基因,利用基因芯片技術(shù)在CA-MRSA中共檢測(cè)出30個(gè)基因是HA-MRSA菌株所沒有的,此外CA-MRSA缺少HA-MRSA中的12個(gè)基因。這些基因多為莢膜多糖合成酶、絲氨酸蛋白酶、整合酶、轉(zhuǎn)座酶和毒素等。正是這些基因的作用提供CA-MRSA在社區(qū)傳播的生存優(yōu)勢(shì)。 結(jié)論:CA-MRSA在北京地區(qū)的SSTI中的分離率為1%,CA-MRSA在SSTI中分離的金黃色葡萄球菌中的比例為3.05%,低于國(guó)際其他地區(qū)的報(bào)道。分子特征研究顯示CA-MRSA與HA-MRSA的遺傳背景差異明顯,提示其來源的不同。分離的ST239-t037克隆提示從醫(yī)院環(huán)境傳播到社區(qū)的可能,而USA300菌株則提示CA-MRSA在不同地區(qū)間的傳播。對(duì)CA-MRSA和HA-MRSA的主要流行克隆進(jìn)行比較基因組學(xué)分析,結(jié)果提示CA-MRSA和HA-MRSA在分子結(jié)構(gòu)上具有比較明顯的差異,CA-MRSA具有更多的HA-MRSA所不具有的基因,為CA-MRSA在社區(qū)傳播提供了生存優(yōu)勢(shì)。
【關(guān)鍵詞】:社區(qū)獲得性耐甲氧西林的金黃色葡萄球菌 皮膚軟組織感染 MLST PVL spa基因芯片
【學(xué)位授予單位】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2011
【分類號(hào)】:R446.5;R181.3
【目錄】:
- 摘要4-6
- Abstract6-9
- 前言9-10
- 第一部分 菌株對(duì)抗菌藥物的體外敏感性研究10-21
- 材料與方法10-15
- 結(jié)果15-19
- 討論19-21
- 第二部分 社區(qū)分離的金黃色葡萄球菌的分子特征研究21-55
- 材料和方法21-34
- 結(jié)果34-45
- 討論45-55
- 第三部分 社區(qū)獲得性金黃色葡萄球菌的比較基因組學(xué)研究55-65
- 材料和方法55-59
- 結(jié)果59-63
- 討論63-65
- 全文結(jié)論65-66
- 參考文獻(xiàn)66-69
- 文獻(xiàn)綜述69-79
- 參考文獻(xiàn)76-79
- 研究生期間發(fā)表的論文和其他學(xué)術(shù)活動(dòng)79-80
- 附錄80-84
- 個(gè)人簡(jiǎn)歷84-86
- 致謝86-87
【引證文獻(xiàn)】
中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條
1 劉洋;我國(guó)動(dòng)物源金黃色葡萄球菌的耐藥性和分型研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2012年
,本文編號(hào):1097746
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