目的:利用二代測序技術(shù)（next-generation sequencing,NGS）比較分析人類免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus,HIV）感染者和HIV未感染者口腔唾液中真菌微生物物種組成和多樣性差異。方法:收集30例HIV感染者（HIV組）和30例HIV未感染者（對照組）的非刺激性口腔全唾液,采用Illumina NGS測序技術(shù)分析其物種多樣性和群落組成差異。結(jié)果:Illumina NGS高通量測序共獲得3450194條有效序列,采用Unoise3降噪得到4374個z OTU（zero-radius operational taxonomic units）。經(jīng)物種注釋獲得11個門,279個屬和298個種水平的物種。HIV組的Alpha多樣性指數(shù)Chao1和Shannon顯著高于對照組。輪枝孢屬、曲霉屬、伊薩酵母屬、鏈格孢屬等在對照組顯著富集,念珠菌屬、被孢霉屬、馬拉色氏菌屬、青霉屬、擬青霉等在HIV組顯著富集。結(jié)論:HIV感染組口腔唾液中真菌微生物物種豐富度和多樣性顯著高于HIV未感染組。兩組真菌微生物的門水平和屬水平優(yōu)勢物種均存在較大差異。H... 

【文章來源】：臨床口腔醫(yī)學雜志. 2020,36(03)

【文章頁數(shù)】：4 頁

【文章目錄】：
材料和方法
    1 樣本來源
    2 樣本采集
    3 DNA提取和測序
    4統(tǒng)計學分析
結(jié)果
    1二代測序所得樣本信息
    2微生物多樣性分析
    3 門水平上的分布
    4 屬水平上的分布
討論


【參考文獻】：
期刊論文
[1]口腔微生物組學與口腔個體化醫(yī)療研究進展[J]. 馬姝祺,周秦.  臨床口腔醫(yī)學雜志. 2016(10)
[2]HIV感染者伴口腔念珠菌及其它真菌感染[J]. 王園園,陳建鋼.  臨床口腔醫(yī)學雜志. 2014(02)



本文編號：3633816