成釉細(xì)胞瘤患者lncRNA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析及作用研究
發(fā)布時間:2021-11-07 20:55
目的:分析成釉細(xì)胞瘤患者與正常人群基因表達(dá)譜芯片差異表達(dá)的基因和長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA),探討關(guān)鍵lncRNA及其參與的信號通路。材料與方法:在公共數(shù)據(jù)庫基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(gene expression omnibus,GEO)中下載成釉細(xì)胞瘤相關(guān)芯片數(shù)據(jù)集GES38494及GES132472,篩選差異表達(dá)的基因及l(fā)ncRNA,構(gòu)建lncRNA-m RNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)并分析其參與的GO及KEGG通路,STRING數(shù)據(jù)庫進(jìn)行蛋白質(zhì)相互作用分析并篩選核心基因。結(jié)果:經(jīng)差異分析共篩選出801個差異表達(dá)基因,其中差異表達(dá)的lnc RNA6個,與283個m RNA存在共表達(dá)關(guān)系。lncRNA-m RNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)中的m RNA主要參與上皮發(fā)育、皮膚發(fā)育、表皮細(xì)胞分化、角化細(xì)胞分化、角化作用等生物學(xué)功能和干細(xì)胞多能性調(diào)節(jié)通路、胰腺分泌、視黃醇代謝、軸突導(dǎo)向、細(xì)胞外基質(zhì)-受體相互作用、黏著班等KEGG信號通路。蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(protein-protein interaction,PPI)分析中IVL是連接度最大的核心基因,與其共表達(dá)的lnc RN...
【文章來源】:2020年中華口腔醫(yī)學(xué)會口腔生物醫(yī)學(xué)專業(yè)委員會第十次全國口腔生物醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)年會暨第六次全國口腔杰青優(yōu)青論壇論文匯編中華口腔醫(yī)學(xué)會會議論文集
【文章頁數(shù)】:2 頁
本文編號:3482393
【文章來源】:2020年中華口腔醫(yī)學(xué)會口腔生物醫(yī)學(xué)專業(yè)委員會第十次全國口腔生物醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)年會暨第六次全國口腔杰青優(yōu)青論壇論文匯編中華口腔醫(yī)學(xué)會會議論文集
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