口腔鱗狀細(xì)胞癌（OSCC）占口腔癌的90%以上,是全球最常見的口腔腫瘤�；蛟诳谇击[狀細(xì)胞癌的發(fā)病機制中起著不可忽視的作用。然而,目前對口腔鱗狀細(xì)胞癌分子機理的研究還不完全。為了確定與疾病相關(guān)的基因,研究人員通常會關(guān)注表達(dá)值的均值在疾病和正常之間存在差異的基因,實際上在兩種不同的生物狀態(tài)（疾病vs.正常）之間基因表達(dá)值的方差如果存在差異同樣也具有生物學(xué)意義。方差是統(tǒng)計中的另一個重要衡量標(biāo)準(zhǔn),表示數(shù)據(jù)集包含的信息量。一般方差越大,數(shù)據(jù)集包含的信息就越多。本文提出了一種新的口腔鱗狀細(xì)胞癌相關(guān)基因檢測方法,在該方法中,不僅比較了口腔鱗狀細(xì)胞癌患者與對照組基因表達(dá)值的均值差異,而且比較了患者與對照組之間的基因表達(dá)值的方差差異。目前,比較疾病患者與對照組基因表達(dá)值的均值差異,即基因表達(dá)差異（DE）分析方法已經(jīng)成功應(yīng)用于復(fù)雜人類疾病的相關(guān)基因檢測,如黑色素瘤、漿液性卵巢癌、肺腺癌和頭頸部鱗狀細(xì)胞癌。然而跟據(jù)已有文獻可知,目前還沒有研究來檢測口腔鱗狀細(xì)胞癌差異變異性（DV）基因探針。在具體分析中,基于來自GEO公共數(shù)據(jù)庫的兩個基因芯片數(shù)據(jù)集GSE30784和GSE6791,檢測到了456個DV探針,... 

【文章來源】：北京工業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校

【文章頁數(shù)】：74 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

基因表達(dá)矩陣示意圖

圖 2-2 基因芯片數(shù)據(jù)分析的一般流程Figure 2-2 General analysis process of gene data sets因表達(dá)差異分析選表達(dá)差異的基因是基因芯片數(shù)據(jù)分析在層次（1）上的重要手段。因是指在不同實驗條件（疾病 vs.正常）下表達(dá)值存在顯著性差異的基實驗條件包括：不同的組織細(xì)胞、不同的藥物處理時間、不同的病人實驗處理等。表達(dá)的差異通常指在排除實驗和檢測等因素后，一個基驗條件下的表達(dá)水平達(dá)到一定的差異，且同時具有統(tǒng)計學(xué)和生物學(xué)意表達(dá)差異基因的檢測方法主要有以下幾類：因芯片發(fā)展之初，往往根據(jù)基因表達(dá)的倍數(shù)變化直接區(qū)分表達(dá)的差異最廣泛應(yīng)用于基因芯片數(shù)據(jù)分析的方法，該方法是通過對基因芯片的小排序。f 值是由實驗組與對照組基因表達(dá)值的比值來計算得到，用在兩類樣本中存在表達(dá)差異的基因。一般 f 值大于 2 或小于 0.5 時，

圖 2-3 數(shù)據(jù)集 GSE30784 對數(shù)化和歸一化后的基因表達(dá)軌跡圖re 2-3 The plot of the quantiles of gene expression levels for GSE3078圖 2-4 數(shù)據(jù)集 GSE6791 對數(shù)化和歸一化后的基因表達(dá)軌跡圖ure 2-4 The plot of the quantiles of gene expression levels for GSE6791

【參考文獻】：
期刊論文
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碩士論文
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