背景齲病是微生物發(fā)酵游離糖產(chǎn)生的酸性副產(chǎn)物對(duì)牙齒硬組織造成局部破壞的結(jié)果,其相關(guān)微生物一直是研究熱點(diǎn)。唾液和齦上菌斑是口腔微生物研究的常用樣本。但唾液能否代替齦上菌斑來研究齲病相關(guān)微生物具有爭(zhēng)議性。橫斷面調(diào)查和隊(duì)列研究都表明患有乳牙齲是第一恒磨牙患齲的危險(xiǎn)因素。但是,在第一恒磨牙尚未患齲時(shí),其菌斑微生物群落是否會(huì)受乳牙患齲狀態(tài)的影響,有關(guān)這方面的研究甚少。高通量測(cè)序技術(shù)為微生物研究提供了強(qiáng)有力的支持。新一代測(cè)序平臺(tái)具有短讀長的缺點(diǎn),這對(duì)微生物群落的分析具有一定的影響。第三代測(cè)序平臺(tái)如PacBio Sequel彌補(bǔ)了該不足,它能讀取全長的16S rRNA基因序列,在鑒定微生物方面具有更精確的“分辨率”,能更好地分析微生物。目的1.評(píng)估唾液樣本能否代替齦上菌斑樣本來研究齲病相關(guān)微生物;2.比較7—9歲患齲兒童和健康兒童的微生物群落差異;3.比較7—9歲不同患齲狀態(tài)兒童的健康第一恒磨牙齦上菌斑微生物群落差異。方法樣本取自30名7—9歲兒童的齦上菌斑和非刺激性唾液。15名兒童乳磨牙有齲（齲病組/Caries組/C組）,15名兒童無齲（健康組Healthy/H組）,所有兒童的第一恒磨牙均無齲。從... 

【文章來源】：南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】：121 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖２?ＯＴＵ分布情況??每個(gè)圓圈內(nèi)的數(shù)字表示每個(gè)組或每個(gè)亞組內(nèi)的ＯＴＵ數(shù)目，重疊部分的數(shù)字表示兩個(gè)組或兩??個(gè)亞組之間共有的ＯＴＵ數(shù)目

?７—９歲患齲兒童齦上菌斑及唾液微生物群落研究???２．５測(cè)序深度和樣本量大小的評(píng)估??稀疏曲線的平緩程度反映了測(cè)序深度對(duì)于微生物群落多樣性的影響大校??稀疏曲線如果呈現(xiàn)出平緩的形狀，說明當(dāng)前的測(cè)序深度已足以反映微生物群落??多樣性；稀疏曲線若呈現(xiàn)出相對(duì)陡峭的形狀，表明增加測(cè)序深度還可以檢測(cè)到??相對(duì)大量的新ＯＴＵ。在圖３Ａ和３Ｂ中，稀疏曲線呈現(xiàn)出一個(gè)平緩的形狀，表明??６個(gè)亞組的測(cè)序深度足以反映該群落樣本所包含的微生物豐富度和均勻度。??５００．?．?．?．?１￣??■?ＣＯ?ｓｕｂｇｒｏｕｐ??■■?ＣＰ?ｓｕｂｇｒｏｕｐ??■■?ＣＳ?ｓｕｂｇｒｏｕｐ??４〇〇?■?．?（＝１?ＨＯ?ｓｕｂｇｒｏｕｐ??＾?■?ｈｆｆｓｕｆｔｇｆｏｕｐ??〇?Ｔ?＾?■?ＨＳ?ｓｕｂｇｒｏｕｐ??ｊ：＾？：??１００?Ｉ??°〇?５００?１０００?１５００?２０００??Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ?Ｐｅｒ?Ｓａｍｐｌｅ??Ａ??＾?ＣＯ?ｓｕｂｇｒｏｕｐ??ｇ?＾?ＣＰｓｕｂｇｉｏｕｐ??ＨＩ?ＣＳ?ｓｕｂｇｒｏｕｐ??一卞?口?ＨＤ?ｓｕｂｇｒｏｕｐ??ｌ?ｉｌ＇??ｆ！??ｔｃ??２??〇〇?５００?１０００?１５００?２０００??Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ?Ｐｅｒ?Ｓａｍｐｌｅ??Ｂ??圖３?６個(gè)亞組的稀疏曲線圖??橫坐標(biāo)代表每個(gè)樣本中隨機(jī)抽取的序列總數(shù)，縱坐標(biāo)代表在相應(yīng)測(cè)序深度下觀測(cè)到的ＯＴＵ??數(shù)目。（Ａ）?Ｃｈａｏ?１?指數(shù)；（Ｂ）?Ｓｈａｎｎｏｎ?指數(shù)??Ｆｉｇｕｒｅ?３．?Ｒａｒｅｆａｃｔｉｏｎ?ｃｕｒｖｅｓ?ｆｏｒ?ｓｉｘ?ｓｕｂｇｒｏｕｐｓ

?項(xiàng)士學(xué)位論文???使用物種累積曲線評(píng)估本研究的樣本量大小是否足夠。在圖４中，橫坐標(biāo)??代表樣本量，縱坐標(biāo)代表被檢測(cè)的ＯＴＵ數(shù)目，曲線中的藍(lán)色陰影表示置信區(qū)間，??黃色長方形的上下線條表示四分位數(shù)。從圖中，我們可以看出，隨著樣本量的??增大，藍(lán)色陰影的面積和黃色長方形的高度先增加，后逐漸減校樣本量為９０??個(gè)的時(shí)候，藍(lán)色陰影的面積和黃色長方形的高度幾乎重疊在一起，說明上下四??分位數(shù)十分接近，置信區(qū)間很窄。表明本研宄收集的９０個(gè)樣本已經(jīng)足夠反映樣??本總體的群落豐富度。稀疏曲線和物種累積曲線的結(jié)果說明本研究中的樣本量??大小和測(cè)序深度均足以進(jìn)行下一步分析。??４＞?Ｉ??Ｉ??〇?－?｜??￣￣Ｉ?Ｉ?Ｉ?１?Ｉ?Ｉ?１??０?２０?４０?６０?８０?９０??ｎｕｍｂｅｒ?ｏｌ?ｓａｍｐｌｅｓ??圖４物種累積曲線圖??Ｆｉｇｕｒｅ?４．?Ｓｐｅｃｉｅｓ?ａｃｃｕｍｕｌａｔｉｏｎ?ｃｕｒｖｅ?ｆｏｒ?ａｌｌ?ｓａｍｐｌｅｓ．??２．６?ａｌｐｈａ多樣性分析??基于ＯＴＵ?ｔａｂｌｅ，計(jì)算每個(gè)樣本的ａｌｐｈａ多樣性指數(shù)，包括Ｓｉｍｐｓｏｎ、Ｃｈａｏｌ、??ＡＣＥ?和?Ｓｈａｎｎｏｎ?指數(shù)（表?９－１１）?〇??２７??

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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