miRNA-524、IL-33、ST2在成釉細胞瘤中表達及意義
發(fā)布時間:2020-08-17 21:24
【摘要】:目的:成釉細胞瘤(ameloblastoma,AB)是一種牙源性腫瘤,發(fā)生于頜骨,其具有侵襲性生長和術(shù)后易復發(fā)的特點。AB的臨床表現(xiàn)為生長緩慢的無痛性腫脹,鑒于疾病早期癥狀不明顯且缺乏有效治療措施,嚴重影響患者生存質(zhì)量。近年來研究表明,微小RNA(microRNA,miRNA)與腫瘤密切相關(guān),是腫瘤診斷、治療及預后判斷的潛在靶標。應用生物信息學分析,篩選出在AB中差異性表達的miRNA-524及其相關(guān)靶點白細胞介素-33(interleukin,IL-33)。IL-33是白細胞介素-1(interleukin-1,IL-1)家族的成員,在多種類型的細胞中表達。細胞損傷或壞死時釋放出具有活性的成熟IL-33,激活免疫系統(tǒng)并提供了損傷信號。IL-33及其受體ST2和IL-1受體輔助蛋白(IL-1 receptor accessory protein,IL-1RAcP)形成IL-33/ST2信號通路。近年來研究表明,IL-33/ST2利用免疫調(diào)節(jié)、血管生成、腫瘤侵襲和轉(zhuǎn)移等機制,在腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程中發(fā)揮著重要的作用。因此,探討miRNA-524、IL-33和ST2在AB中的表達及臨床意義,為尋找AB的新治療靶點提供科學依據(jù)。研究方法:1、應用Human miRNA表達譜芯片技術(shù),篩選與AB相關(guān)的差異性表達的miRNA-524,采用莖環(huán)法實時定量PCR檢測在14例AB及正常口腔黏膜組織(NOM)中的表達情況。2、應用生物信息學方法尋找mi RNA-524的靶點IL-33,采用qRT-PCR檢測IL-33的mRNA和統(tǒng)計學分析初步驗證其兩者相關(guān)性。3、應用qRT-PCR和Western Blot在AB及正常口腔黏膜組織中檢測IL-33和ST2的表達。4、應用免疫組織化學染色實驗方法,在90例AB蠟塊和20例NOM組織蠟塊中檢測IL-33和ST2的表達水平。結(jié)果:1、miRNA芯片分析發(fā)現(xiàn),實驗組(AB)miRNA表達量與對照組(NOM)比較后,其中變化在2.0倍以上,并且差異有統(tǒng)計學意義(P0.05)的miRNA確定為差異表達的miRNA。miRNA-524在AB組織中比正常組織平均低8.96倍(P0.001),差異最明顯。綜合生物信息學分析等多重篩選條件,最終確定miRNA-524為下一步研究的miRNA分子,應用莖環(huán)法實時定量PCR檢測miRNA-524在AB中的表達比NOM低8.19倍(P0.05)。2、應用Spearman相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn)miRNA-524與IL-33在AB中的表達具有負相關(guān)性(r=-0.886,P0.05)。3、應用qRT-PCR檢測IL-33表達高于NOM1.39倍(P0.05),ST2在AB中的表達是在NOM的1.76倍(P0.05);Western Blot檢測IL-33在AB中的表達高于NOM2.75倍(P0.05),ST2在AB中的表達是NOM的2.16倍(P0.05)。4、應用免疫組織化學染色檢測IL-33在AB中的表達強度高于NOM,IL-33分布于腫瘤性上皮細胞的細胞核中,間質(zhì)中炎性淋巴細胞、漿細胞陽性表達,偶見單核細胞陽性染色,內(nèi)皮細胞、成纖維細胞和骨周邊破骨細胞也見表達;ST2在AB中的表達強度也是高于NOM的,ST2分布于腫瘤性上皮細胞的胞質(zhì)中,間質(zhì)中炎性淋巴細胞、漿細胞陽性、單核細胞表達,胞核偶見陽性染色,內(nèi)皮細胞、成纖維細胞和骨周邊破骨細胞也見表達。結(jié)論:1、miRNA-524在AB中低表達,IL-33可能是與miRNA-524關(guān)系密切的潛在靶點。2、與NOM相比,AB中IL-33和ST2的表達增強。
【學位授予單位】:中國醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:R739.81
【圖文】:
中國醫(yī)科大學碩士學位論文3. 實驗結(jié)果3.1 miRNA 芯片結(jié)果分析3.1.1 芯片信號分析我們選用的 miRNA 芯片是探針經(jīng)過 Tm 值均一化后的 LNA 增強探針,數(shù)據(jù)的可重復性達到 99%并且可探測到信號高達 10E+05 級,覆蓋所有在 miRBase18.0 中有注釋的的人,小鼠和大鼠的 miRNA,同時也包括和這些物種相關(guān)的病毒的 miRNA(圖 3.1)。miRNA 芯片信號結(jié)果如圖 3.2,證明芯片的可信度非常高。
2 miRNA 芯片結(jié)果分析圖。圖 A 為箱圖,通過背景消減及探針信號標準化后,組織樣本芯片的熒光信號強度一致,排除因信號不一致而導致的錯誤結(jié)果;圖 ,可以直觀地看到顯著性差異的 miRNAs,其中橫坐標代表差異倍數(shù),縱坐標代表標記點代表有統(tǒng)計學意義的篩選出的 miRNAs,其中左邊紅色標記點表示表達下As,右邊紅色標記點代表上調(diào)的 miRNAs;圖 C 為散點圖,反應了芯片間的重性越好越靠近對角線;圖 D 為聚類分析圖,x 軸為 12 個組織樣本(A1-A6 為 A6 為 NOM 組),y 軸為差異表達的 miRNAs,最上方為系統(tǒng)聚類分析,同一組別離較近,而不同組別之間差異最大。2 篩選差異表達的 miRNA我們將實驗組(AB)miRNA 表達量與對照組(NOM)比較后,其中在 2.0 倍以上,并且差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)的 miRNA 確定為差 miRNA。結(jié)果發(fā)現(xiàn) miRNA-524 在 AB 中比 NOM 低約 10 倍,差異最
圖 3.3 TargetScanHuman7.1 預測 miRNA-524 與 IL-33 結(jié)合序列3.2 莖環(huán)實時定量 PCR 和實時熒光定量 PCR(qRT-PCR)檢測結(jié)果3.2.1 miRNA-524 的表達情況14 例 AB 標本、14 例 NOM 標本的 cDNA 經(jīng) Realtime PCR 擴增獲得了miRNA-524 實時熒光 PCR 擴增曲線(圖 3.4A)和溶解曲線(圖 3.4B)。通過軟件7500 Software v2.0.5分析出miRNA-524的CT值,為了校正不同標本之間RNA的質(zhì)量和逆轉(zhuǎn)錄效率的差異,以 2- CT法表示相對定量結(jié)果,以 U6 作為內(nèi)參,2- CT表示實驗組目的基因相對于對照組原始拷貝數(shù)的倍數(shù)差異,即表示目的基因在 AB 和 NOM 之間的表達相對變化。結(jié)果如表 3.2 顯示:miRNA-524 在 AB中的表達相對于 NOM 低了 8.19 倍,具有統(tǒng)計學意義(P<0.05)(圖 3.4C)。表 3.2 miRNA-524mRNA 在不同組織中的相對表達量差異倍數(shù)( X ±SD)組織名稱 樣本數(shù)(個) 相對表達量差異倍數(shù) P 值
本文編號:2795854
【學位授予單位】:中國醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2018
【分類號】:R739.81
【圖文】:
中國醫(yī)科大學碩士學位論文3. 實驗結(jié)果3.1 miRNA 芯片結(jié)果分析3.1.1 芯片信號分析我們選用的 miRNA 芯片是探針經(jīng)過 Tm 值均一化后的 LNA 增強探針,數(shù)據(jù)的可重復性達到 99%并且可探測到信號高達 10E+05 級,覆蓋所有在 miRBase18.0 中有注釋的的人,小鼠和大鼠的 miRNA,同時也包括和這些物種相關(guān)的病毒的 miRNA(圖 3.1)。miRNA 芯片信號結(jié)果如圖 3.2,證明芯片的可信度非常高。
2 miRNA 芯片結(jié)果分析圖。圖 A 為箱圖,通過背景消減及探針信號標準化后,組織樣本芯片的熒光信號強度一致,排除因信號不一致而導致的錯誤結(jié)果;圖 ,可以直觀地看到顯著性差異的 miRNAs,其中橫坐標代表差異倍數(shù),縱坐標代表標記點代表有統(tǒng)計學意義的篩選出的 miRNAs,其中左邊紅色標記點表示表達下As,右邊紅色標記點代表上調(diào)的 miRNAs;圖 C 為散點圖,反應了芯片間的重性越好越靠近對角線;圖 D 為聚類分析圖,x 軸為 12 個組織樣本(A1-A6 為 A6 為 NOM 組),y 軸為差異表達的 miRNAs,最上方為系統(tǒng)聚類分析,同一組別離較近,而不同組別之間差異最大。2 篩選差異表達的 miRNA我們將實驗組(AB)miRNA 表達量與對照組(NOM)比較后,其中在 2.0 倍以上,并且差異有統(tǒng)計學意義(P<0.05)的 miRNA 確定為差 miRNA。結(jié)果發(fā)現(xiàn) miRNA-524 在 AB 中比 NOM 低約 10 倍,差異最
圖 3.3 TargetScanHuman7.1 預測 miRNA-524 與 IL-33 結(jié)合序列3.2 莖環(huán)實時定量 PCR 和實時熒光定量 PCR(qRT-PCR)檢測結(jié)果3.2.1 miRNA-524 的表達情況14 例 AB 標本、14 例 NOM 標本的 cDNA 經(jīng) Realtime PCR 擴增獲得了miRNA-524 實時熒光 PCR 擴增曲線(圖 3.4A)和溶解曲線(圖 3.4B)。通過軟件7500 Software v2.0.5分析出miRNA-524的CT值,為了校正不同標本之間RNA的質(zhì)量和逆轉(zhuǎn)錄效率的差異,以 2- CT法表示相對定量結(jié)果,以 U6 作為內(nèi)參,2- CT表示實驗組目的基因相對于對照組原始拷貝數(shù)的倍數(shù)差異,即表示目的基因在 AB 和 NOM 之間的表達相對變化。結(jié)果如表 3.2 顯示:miRNA-524 在 AB中的表達相對于 NOM 低了 8.19 倍,具有統(tǒng)計學意義(P<0.05)(圖 3.4C)。表 3.2 miRNA-524mRNA 在不同組織中的相對表達量差異倍數(shù)( X ±SD)組織名稱 樣本數(shù)(個) 相對表達量差異倍數(shù) P 值
【參考文獻】
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1 張成文;NF-κBp65及Phospho-NF-κBp65在人成釉細胞瘤中的表達及意義[D];中國醫(yī)科大學;2009年
本文編號:2795854
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/kouq/2795854.html
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