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博州地區(qū)三民族不同齲敏感3-5歲兒童口腔微生物群落的宏基因組學(xué)研究

發(fā)布時(shí)間:2020-05-11 13:59
【摘要】:目的:對(duì)比研究蒙古族、維吾爾族和漢族低齡兒童齲病患病情況及相關(guān)危險(xiǎn)因素,通過(guò)高通量測(cè)序?qū)θ齻(gè)民族兒童牙菌斑菌群結(jié)構(gòu)差異進(jìn)行分析,檢測(cè)唾液中四種常見(jiàn)致齲菌DNA水平并評(píng)價(jià)與低齡兒童齲病的關(guān)系。方法:采用多階段、隨機(jī)、分層、整群抽樣的方法對(duì)博州地區(qū)3~5歲蒙古族,維族和漢族兒童進(jìn)行口腔檢查和危險(xiǎn)因素分析;采集重度低齡兒童齲病和口腔健康兒童牙菌斑,運(yùn)用高通量測(cè)序?qū)ξ⑸锞航Y(jié)構(gòu)和多樣性進(jìn)行分析;同時(shí)采集口腔健康兒童和重度低齡兒童齲病兒童唾液,熒光定量檢測(cè)變形鏈球菌、血鏈球菌、乳酸桿菌和內(nèi)氏放線菌的DNA水平。結(jié)果:1)1089名3-5歲兒童中低齡兒童齲病患病率為72.2%,齲均(dmfs)為4.4±5.34顆,其中重度低齡兒童齲病患病率為36.2%。隨著年齡的增加乳牙的患齲率和患重齲率均升高(c2=26.834,P0.001),其中5歲兒童乳牙的患齲率最高為82.9%;2)隨著年齡的增長(zhǎng)乳牙的齲均升高(F=8.330,P0.001),尤其是5歲兒童的齲均處于較高水平為5.53±5.88;3)乳牙齲齒的充填率為1.35%,城市兒童的乳牙齲齒充填情況優(yōu)于鄉(xiāng)鎮(zhèn)兒童乳牙齲齒的充填情況(F=8.861,P=0.003);4)社會(huì)經(jīng)濟(jì)背景因子是兒童齲病的保護(hù)因素;睡前不良飲食習(xí)慣、喝含糖飲料、吃零食、夜間喂食是兒童齲病的危險(xiǎn)因素;5)研究共獲得9215515條有效序列,按照97%的相似性聚類歸屬三個(gè)民族120例樣本中共檢出13個(gè)菌門,23個(gè)菌綱,40個(gè)菌目,78個(gè)菌科和129個(gè)菌屬;6)多樣性分析的結(jié)果顯示,三個(gè)民族兒童的牙菌斑菌群構(gòu)成和多樣性不同,口腔健康組的兒童菌群結(jié)構(gòu)多樣性高于重度低齡兒童齲病組兒童;7)厚壁菌,芽孢桿菌,乳桿菌,鏈球菌,梭桿菌,毛螺旋菌,Shuttleworthia菌,韋榮球菌,放線菌,紅蝽菌,奇異菌,雙歧桿菌,變形菌,交替單胞菌,希瓦氏菌是SEC組兒童中起主要作用的核心菌群;變形菌,紅環(huán)菌,Propionivibrio菌,伯克氏菌,草酸桿菌,貪銅菌,腸桿菌,心桿菌,黃單胞菌,華桿菌,擬桿菌,紫單胞菌,福賽斯坦納菌,Paludibacter菌,厚壁菌,芽孢桿菌,葡萄球菌是CF組兒童中起主要作用的核心菌群;8)放線菌是漢族兒童的核心菌群。變形菌,柄桿菌,短波單胞菌屬,假單胞菌,黃單胞菌,伯克氏菌,叢毛單胞菌是維族族兒童的核心菌群;Thermi菌,異常球菌,變形菌,伯克氏菌,草酸桿菌,貪銅菌,腸桿菌是蒙古族族兒童的核心菌群;9)S.mutans和L.acidophilus在重度低齡兒童齲病患兒唾液中的檢出率高于無(wú)齲兒童;L.acidophilus在蒙古族兒童唾液中檢出高于漢族和維族;10)唾液中S.mutans和L.acidophilus的DNA水平與dmft呈正相關(guān)關(guān)系。結(jié)論:1)新疆博州地區(qū)蒙古族、維族和漢族兒童低齡兒童齲病患病率高,充填率低,且發(fā)病年齡早;2)良好的社會(huì)經(jīng)濟(jì)背景因子是兒童齲病的保護(hù)因素;睡前不良飲食習(xí)慣、喝含糖飲料、吃零食、夜間喂食是兒童齲病的危險(xiǎn)因素;3)健康兒童口腔的菌斑微生物多樣性高于重度低齡兒童齲病兒童;漢族兒童菌群多樣性大于維族和蒙族;蒙古族和維族兒童牙菌斑菌群結(jié)構(gòu)較為相似;4)厚壁菌,芽孢桿菌,乳桿菌,鏈球菌,梭桿菌,毛螺旋菌,Shuttleworthia菌,韋榮球菌,放線菌,紅蝽菌,奇異菌,雙歧桿菌,變形菌,交替單胞菌,希瓦氏菌是潛在的致齲細(xì)菌;5)三個(gè)民族核心菌屬各不相同,梭桿菌屬,棒狀桿菌屬,卟啉單胞菌屬是三民族兒童口腔中共有的的核心菌屬;6)唾液中S.mutans和L.acidophilus含量可以作為低齡兒童齲病風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估篩查的生物標(biāo)記物。
【圖文】:

序列,長(zhǎng)度分布圖,測(cè)序,質(zhì)量評(píng)估


得到的原始測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行整理、過(guò)濾及質(zhì)量評(píng)估,在剔除疑問(wèn)序列后120個(gè)樣本一共獲得9215515條有效序列,,同時(shí)序列長(zhǎng)度主要分布在420-450bp之間,滿足測(cè)序質(zhì)量要求,如圖2-1。圖2-1 有效序列長(zhǎng)度分布圖Fig. 2-1 The distribution of valid sequences length

統(tǒng)計(jì)圖,鑒定結(jié)果,統(tǒng)計(jì)圖,地位


圖2-2 OTU劃分和分類地位鑒定結(jié)果統(tǒng)計(jì)圖Fig. 2-2 Statistical Chart of the Results of Classification of OTU2.3 Alpha多樣性分析2.3.1 Rarefaction稀疏曲線圖2-3是本研究測(cè)序結(jié)果經(jīng)97%相似度水平劃分繪制成的稀疏曲線,每個(gè)樣本對(duì)應(yīng)一條曲線,用不同顏色進(jìn)行顯示。從各樣本中抽取的序列總數(shù)在橫坐標(biāo)中反映;對(duì)應(yīng)深度下檢測(cè)到的OTU數(shù)在縱坐標(biāo)上反映。OUT總數(shù)伴隨測(cè)序深度的增加而增多。在圖2-3中每條曲線走向平緩,提示本研究的菌斑微生物菌群多樣性在當(dāng)前測(cè)序深度水平,趨向達(dá)到飽和,該測(cè)序結(jié)果已足夠反映當(dāng)前研究對(duì)象所包含的微生物多樣性。
【學(xué)位授予單位】:新疆醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【學(xué)位授予年份】:2019
【分類號(hào)】:R788.1

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本文編號(hào):2658559


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