變形鏈球菌耐酸相關(guān)基因luxS編碼蛋白的晶體學(xué)初步研究
發(fā)布時(shí)間:2020-04-22 09:35
【摘要】:目的: 齲病是牙體硬組織的細(xì)菌感染性疾病,是人類最常見的疾病之一,尤其多發(fā)于兒童。細(xì)菌學(xué)研究和動(dòng)物模型實(shí)驗(yàn)研究均證實(shí)變形鏈球菌是最主要的致齲菌。其致齲作用的發(fā)揮與其耐酸性息息相關(guān),變形鏈球菌耐酸相關(guān)基因luxS編碼的核糖基高半胱氨酸酶,通過(guò)一系列酶促反應(yīng)合成自體誘導(dǎo)物信號(hào)分子AI-2,AI-2作為種屬間的通用信號(hào)分子,參與群體感應(yīng)系統(tǒng)監(jiān)測(cè)菌群密度,調(diào)控細(xì)菌的生物功能進(jìn)而影響生物膜的形成,增強(qiáng)菌群的耐酸能力和抗藥能力,可見核糖基高半胱氨酸酶在變形鏈球菌的耐酸作用中發(fā)揮關(guān)鍵的作用。迄今為止,變形鏈球菌的耐酸機(jī)制仍不清晰,我們希望通過(guò)對(duì)變形鏈球菌耐酸相關(guān)基因luxS編碼的核糖基高半胱氨酸酶的晶體結(jié)構(gòu)研究,更深刻的揭示變形鏈球菌的耐酸機(jī)制,也為齲病的防治提供新的思路和理論指導(dǎo)。 方法: 重組質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定根據(jù)GenBank中l(wèi)uxS基因序列,設(shè)計(jì)特異性PCR引物,擴(kuò)增luxS基因序列,將其克隆至pGEX-6p-1載體中,構(gòu)建GST標(biāo)簽融合的重組質(zhì)粒。 目標(biāo)蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)與純化將鑒定正確的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化入大腸桿菌BL21(DE3)中, IPTG誘導(dǎo)表達(dá),用SDS-PAGE和質(zhì)譜分析表達(dá)的目標(biāo)蛋白。利用GST親和層析、陰離子交換層析和凝膠過(guò)濾層析純化目標(biāo)蛋白。 目標(biāo)蛋白的結(jié)晶與結(jié)構(gòu)解析使用Hampton Research公司的晶體生長(zhǎng)試劑盒對(duì)純度達(dá)95%以上的目標(biāo)蛋白進(jìn)行晶體生長(zhǎng)條件篩選,對(duì)初篩的生長(zhǎng)條件進(jìn)行優(yōu)化,以期得到適于X射線衍射的單晶,,通過(guò)同步輻射加速器收集晶體衍射數(shù)據(jù),借助于CCP4等一系列蛋白結(jié)構(gòu)解析軟件進(jìn)行結(jié)構(gòu)解析。 結(jié)果: 核糖基高半胱氨酸酶在大腸桿菌中高效、可溶性表達(dá),經(jīng)SDS-PAGE及質(zhì)譜鑒定分析,證實(shí)所表達(dá)的蛋白為核糖基高半胱氨酸酶。 對(duì)核糖基高半胱氨酸酶的表達(dá)及純化條件進(jìn)行優(yōu)化,確立了目標(biāo)蛋白的純化工藝,經(jīng)SDS-PAGE分析,最終得到純度高達(dá)95%以上的目標(biāo)蛋白。 使用Hampton Research公司的晶體生長(zhǎng)試劑盒對(duì)晶體生長(zhǎng)條件進(jìn)行篩選,得到目標(biāo)蛋白的晶體生長(zhǎng)條件,進(jìn)一步對(duì)晶體生長(zhǎng)條件進(jìn)行優(yōu)化,得到適于X射線衍射數(shù)據(jù)收集的單晶。 在北京同步輻射光源收集核糖基高半胱氨酸酶晶體的X射線衍射數(shù)據(jù),晶體衍射分辨率達(dá)到2.4A,屬于C2221空間群。 結(jié)論: 成功的在大腸桿菌中高效表達(dá)了變形鏈球菌耐酸相關(guān)基因luxS編碼的核糖基高半胱氨酸酶蛋白,建立完善的蛋白純化工藝,并成功得到核糖基高半胱氨酸酶的晶體,分析晶體X射線衍射數(shù)據(jù)。
【圖文】:
菌株 coli XL-1 blue 首都醫(yī)科大學(xué)分子生物學(xué)與生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)室 coli BL21(DE3) 首都醫(yī)科大學(xué)分子生物學(xué)與生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)室reptococcus mutans UA159 首都醫(yī)科大學(xué)分子生物學(xué)與生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)粒載體EX-6p-1 用于構(gòu)建原核表達(dá)載體(Novagen)(圖 1)。pGEX 載體系統(tǒng)是隆表達(dá)重組蛋白的功能最強(qiáng)大的系統(tǒng)之一。在 pGEX 載體上構(gòu)建有重組Schistosoma japonicum)GST 蛋白(分子量 26kd)的結(jié)構(gòu),GST 天然存物體內(nèi),帶有全長(zhǎng) GST 標(biāo)簽的蛋白被證實(shí)具有 GST 酶的活性,能夠二EX 載體上多克隆位點(diǎn)上游包含有蛋白酶的識(shí)別序列(圖 2),可根據(jù)需的蛋白酶切除[18]。
圖 2 pGEX-6p-1 多克隆位點(diǎn)及酶切位點(diǎn)ig.2 Multiple cloning site and protease cleavage site map of pGEX-6p-1.3 工具酶及 DNA、蛋白質(zhì)分子量 MarkerBamH I 限制性內(nèi)切酶 New England BiolabsXhol I 限制性內(nèi)切酶 New England BiolabsT4 DNA 連接酶 New England Biolabspfu Polymerase 首都醫(yī)科大學(xué)分子生物學(xué)與生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)室提供DNA Marker 首都醫(yī)科大學(xué)分子生物學(xué)與生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)室提供蛋白質(zhì)分子量 Marker TaKaRa 公司.4 試劑盒細(xì)菌基因組 DNA 提取試劑盒 北京天為時(shí)代公司DNA 凝膠回收試劑盒 Omega 公司
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2012
【分類號(hào)】:R781.1
【圖文】:
菌株 coli XL-1 blue 首都醫(yī)科大學(xué)分子生物學(xué)與生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)室 coli BL21(DE3) 首都醫(yī)科大學(xué)分子生物學(xué)與生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)室reptococcus mutans UA159 首都醫(yī)科大學(xué)分子生物學(xué)與生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)室質(zhì)粒載體EX-6p-1 用于構(gòu)建原核表達(dá)載體(Novagen)(圖 1)。pGEX 載體系統(tǒng)是隆表達(dá)重組蛋白的功能最強(qiáng)大的系統(tǒng)之一。在 pGEX 載體上構(gòu)建有重組Schistosoma japonicum)GST 蛋白(分子量 26kd)的結(jié)構(gòu),GST 天然存物體內(nèi),帶有全長(zhǎng) GST 標(biāo)簽的蛋白被證實(shí)具有 GST 酶的活性,能夠二EX 載體上多克隆位點(diǎn)上游包含有蛋白酶的識(shí)別序列(圖 2),可根據(jù)需的蛋白酶切除[18]。
圖 2 pGEX-6p-1 多克隆位點(diǎn)及酶切位點(diǎn)ig.2 Multiple cloning site and protease cleavage site map of pGEX-6p-1.3 工具酶及 DNA、蛋白質(zhì)分子量 MarkerBamH I 限制性內(nèi)切酶 New England BiolabsXhol I 限制性內(nèi)切酶 New England BiolabsT4 DNA 連接酶 New England Biolabspfu Polymerase 首都醫(yī)科大學(xué)分子生物學(xué)與生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)室提供DNA Marker 首都醫(yī)科大學(xué)分子生物學(xué)與生物化學(xué)實(shí)驗(yàn)室提供蛋白質(zhì)分子量 Marker TaKaRa 公司.4 試劑盒細(xì)菌基因組 DNA 提取試劑盒 北京天為時(shí)代公司DNA 凝膠回收試劑盒 Omega 公司
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2012
【分類號(hào)】:R781.1
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4 莊Y
本文編號(hào):2636380
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