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金黃地鼠口腔頰粘膜癌前病變向鱗癌轉(zhuǎn)變相關(guān)致病基因和通路的篩選及分析

發(fā)布時(shí)間:2020-04-20 21:25
【摘要】: 目的:利用全基因表達(dá)芯片和相關(guān)生物信息學(xué)分析方法篩選金黃地鼠口腔頰粘膜癌前病變向鱗癌轉(zhuǎn)變相關(guān)重要致病基因和通路。 方法:用DMBA誘導(dǎo)建立金黃地鼠頰粘膜癌前病變和鱗癌模型,提取癌前病變及鱗癌組織的總RNA,合成單標(biāo)Cy3熒光標(biāo)記的cRNA,然后與含有41000個(gè)基因/ESTs序列的Agilent大鼠全基因表達(dá)譜芯片雜交,以Ratio≥2和Ratio≤0.5為閾值來篩選差異表達(dá)基因;對差異表達(dá)基因行GO(Gene Ontology)功能分類和pathway通路分析;用RT-PCR對部分差異表達(dá)基因進(jìn)行驗(yàn)證。 結(jié)果:金黃地鼠頰粘膜從癌前病變發(fā)展到鱗癌的過程中,共篩選到1981條差異表達(dá)基因,其中上調(diào)基因1037條,下調(diào)基因944條,已知基因1861條,未知基因120條,在已知基因中上調(diào)898條,下調(diào)963條;GO分析發(fā)現(xiàn)這些差異表達(dá)基因主要涉及代謝、細(xì)胞結(jié)構(gòu)等14類功能基因;pathway通路分析共得到9條有顯著性改變的通路,在1861條已知差異表達(dá)基因中,有14條基因在以上9條通路上發(fā)生富集;對上調(diào)基因Sparc和下調(diào)基因Casp3行RT-PCR驗(yàn)證結(jié)果與芯片結(jié)果相符。 結(jié)論:金黃地鼠頰粘膜癌前病變發(fā)展到鱗癌主要由Casp3、Cc15、CXCL12、Cc124、Dhfr、Tyms、Vcam1、Vtn、Fn1、Apoe、Alb、Serping1、Sparc和Cyp2b13基因的異常表達(dá)導(dǎo)致Caspase-3激活通路、趨化因子受體粘附活性通路、E2F轉(zhuǎn)錄因子對DNA復(fù)制調(diào)節(jié)通路、G1/S期過渡相關(guān)調(diào)控通路、細(xì)胞表面整聯(lián)蛋白相互作用通路、脂蛋白代謝通路、血小板細(xì)胞溶質(zhì)鈣升高相關(guān)反應(yīng)通路、花生四烯酸代謝通路和細(xì)胞色素P450代謝通路的改變,最終導(dǎo)致口腔頰粘膜從癌前病變向鱗癌轉(zhuǎn)變。因此,針對以上14個(gè)基因的靶向調(diào)控和針對以上9條通路的深入研究將為治療和預(yù)防口腔癌前病變向鱗癌轉(zhuǎn)變提供有效的方法。
【圖文】:

金黃地鼠頰囊,癌前病變,肉眼,粘膜


圖1.肉眼下金黃地鼠頰囊癌前病變(6周) 圖2.光鏡下金黃地鼠頰囊粘膜粘膜癌前Fig. 1 Grossly, the hamster cheek pouch 病的改變(HE×200)premalignant lesions (6 weeks) Fig.2 1light microscope,hamster cheekpouch mucosa precancerous diseasechanges(HEx200)圖3.肉眼下金黃地鼠頰囊粘膜鱗癌(12周) 圖4.光鏡下金黃地鼠頰囊粘膜鱗(HEX200)Fig. 3 Grossly,the hamster cheek pouch Fig. 4 Light microscope,hamster cheek

金黃地鼠頰囊,粘膜,光鏡,肉眼


圖1.肉眼下金黃地鼠頰囊癌前病變(6周) 圖2.光鏡下金黃地鼠頰囊粘膜粘膜癌前Fig. 1 Grossly, the hamster cheek pouch 病的改變(HE×200)premalignant lesions (6 weeks) Fig.2 1light microscope,hamster cheekpouch mucosa precancerous diseasechanges(HEx200)圖3.肉眼下金黃地鼠頰囊粘膜鱗癌(12周) 圖4.光鏡下金黃地鼠頰囊粘膜鱗(HEX200)Fig. 3 Grossly,the hamster cheek pouch Fig. 4 Light microscope,hamster cheek
【學(xué)位授予單位】:重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2010
【分類號】:R739.8

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7 孫e,

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