發(fā)布時間：2018-04-29 14:31

  本文選題：透明細胞肉瘤 + 外顯子組檢測�。� 參考：《中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院》2017年碩士論文

【摘要】：第一部分 研究唾液腺透明細胞肉瘤存在NBN基因體細胞錯義突變目的尋找唾液腺透明細胞肉瘤(CCS)基因組變異,篩選致癌基因,為CCS發(fā)病機制奠定基礎(chǔ)。方法應(yīng)用全外顯子組測序分析CCS患者的腫瘤標本中可能存在的基因突變。利用Sanger測序驗證患者外周血液及瘤旁組織中是否存在可疑基因突變。結(jié)果全外顯子組測序以及Sanger測序驗證結(jié)果顯示在本例CCS中存在體細胞錯義突變c.1061CT(p.P354L),其突變位點為NBN基因的第9個外顯子。結(jié)論:本例CCS存在NBN上c.1061CT(p.P354L)體細胞錯義突變。該突變的結(jié)果是脯氨酸轉(zhuǎn)化為亮氨酸(p.P354L)導(dǎo)致NBN的有害突變。第二部分 高通量測序研究黏液表皮樣癌伴肺肌上皮癌轉(zhuǎn)移的遺傳機制目的尋找黏液表皮樣癌伴肺性肌上皮癌轉(zhuǎn)移的致癌基因,結(jié)合免疫組庫為精準靶向治療提供位點。方法選取患者腫瘤標本,①通過外顯子測序找到癌變的致癌突變,并且進行-驗證、注釋和突變的功能預(yù)測。②通過全轉(zhuǎn)錄組測序找到差異表達的基因集,并進行基因功能預(yù)測和通路注釋。③通過免疫組庫找到患者異常的免疫細胞分子標記,并進行免疫組庫與基因突變的關(guān)聯(lián)分析。④通過多系統(tǒng)生物信息分析,深入研究該病的發(fā)病及轉(zhuǎn)移機制,并結(jié)合免疫組庫,尋找藥物靶標。結(jié)果①外顯子測序診斷結(jié)果,患者的Driver mutation gene (驅(qū)動突變基因)按照致癌的可能性從大到小排序分別為:WNT3, LNC, CCNE1, LC5A4等。②CCNE1基因的表達由癌旁的0.449353809上調(diào)到癌組織的1.411029095。該基因具有一個特異性靶向藥物:ALISERTIB。結(jié)論CCNE1基因突變極可能是此病例的致癌原因,CCNE1基因有一個特異性靶向藥物:ALISERTIB。
[Abstract]:The first part studies the existence of NBN gene somatic missense mutation in salivary gland clear cell sarcoma. Objective to search for the mutation of CCS genome in salivary gland clear cell sarcoma and to screen the oncogene to lay a foundation for the pathogenesis of CCS. Methods A total exon sequence was used to analyze the possible gene mutations in tumor specimens from patients with CCS. Sanger sequencing was used to verify the presence of suspicious gene mutations in peripheral blood and adjacent tissues. Results the results of total exon sequencing and Sanger sequencing showed that there was a somatic missense mutation c.1061CTP 354L, and the mutation site was the 9th exon of NBN gene. Conclusion: there is a missense mutation of somatic cell on NBN in CCS of c. 1061 CTP 354L. The result of this mutation is that proline is transformed into leucine p. 354L) which leads to the harmful mutation of NBN. The second part is high-throughput sequencing to study the genetic mechanism of mucoepidermoid carcinoma with metastasis of pulmonary myoepithelial carcinoma. Objective to search for the oncogene of mucoepidermoid carcinoma with metastasis of pulmonary myoepithelial carcinoma. Methods the oncogenic mutation of cancer was detected by exon sequencing in patient's tumor sample, and the function of annotation and mutation prediction .2 was used to find the differentially expressed gene set through full transcriptional sequencing. Gene function prediction and pathway annotation .3 were used to find abnormal immune cell molecular markers in patients by immune group library, and the association between immune group library and gene mutation was analyzed. 4. Multisystem bioinformatics analysis was used to analyze the relationship between immune group library and gene mutation. To study the pathogenesis and metastasis of the disease, and to search for drug target combined with immune library. Results (1) according to the possibility of carcinogenesis, the sequence of Driver mutation gene (driven mutation gene was: WNT3, LNC, CCNE1, LC5A4 and so on. The expression of CCNE1 gene was up-regulated from 0.449353809 to 1.411029095. The gene has a specific target drug: ALISERTIBB. Conclusion the mutation of CCNE1 gene may be the cause of carcinogenesis in this case.
【學(xué)位授予單位】：中國人民解放軍醫(yī)學(xué)院
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2017
【分類號】：R739.87

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本文編號：1820334