基于PCA的模糊C均值聚類算法識(shí)別AD候選致病基因
發(fā)布時(shí)間:2017-09-15 09:18
本文關(guān)鍵詞:基于PCA的模糊C均值聚類算法識(shí)別AD候選致病基因
更多相關(guān)文章: 基因表達(dá)數(shù)據(jù) AD候選致病基因 模糊C均值算法 主成分分析
【摘要】:研究表明阿爾茨海默病(AD)的致病機(jī)理可能與基因有關(guān).利用計(jì)算方法對(duì)AD基因表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行挖掘,以獲得AD候選致病基因,尋找治愈AD方法.結(jié)合生物信息理論應(yīng)用基于主成分分析(PCA)方法的模糊C均值算法處理基因表達(dá)數(shù)據(jù):觀察到AD基因表達(dá)數(shù)據(jù)具有線性相關(guān)性后,先用PCA對(duì)數(shù)據(jù)降維,再利用一維分類方法對(duì)降維后的數(shù)據(jù)聚類,然后將結(jié)果提供給模糊C均值算法作為其初始聚類數(shù)目和聚類中心.通過算法,最終識(shí)別出9個(gè)AD候選致病基因.
【作者單位】: 四川師范大學(xué)數(shù)學(xué)與軟件科學(xué)學(xué)院;四川師范大學(xué)計(jì)算機(jī)科學(xué)學(xué)院;東華軟件股份公司;成都理工大學(xué)管理科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 基因表達(dá)數(shù)據(jù) AD候選致病基因 模糊C均值算法 主成分分析
【基金】:中國航空科學(xué)基金(2012ZD11)
【分類號(hào)】:R749.16;TP311.13
【正文快照】: AD是一種危害性極大的癡呆癥.目前為止,科研工作者已成功識(shí)別出3種不同的早發(fā)性AD致病基因:APP基因、PSEN1基因、PSEN2基因及一種晚發(fā)性AD致病風(fēng)險(xiǎn)因子APOE基因[1-3].對(duì)致病基因進(jìn)行研究后研發(fā)的相關(guān)藥物,對(duì)治療AD有一定的效果.研究表明AD可能為多基因遺傳病,為徹底根治AD,擴(kuò)
【相似文獻(xiàn)】
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1 陳曉紅,王蔭華;輕度認(rèn)知功能損害——AD的極早期階段?[J];中華神經(jīng)科雜志;2002年06期
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3 別曼;;巨噬細(xì)胞遷移抑制因子在AD中的作用[J];中國病理生理雜志;2010年05期
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5 王瑞婷;張建新;董雅潔;;黃芩莖葉總黃酮對(duì)AD大鼠模型海馬神經(jīng)元超微結(jié)構(gòu)的影響及抗氧化作用[J];中國老年學(xué)雜志;2010年07期
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本文編號(hào):855633
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