基于隨機(jī)森林的精神分裂癥血清代謝組學(xué)研究
本文關(guān)鍵詞:基于隨機(jī)森林的精神分裂癥血清代謝組學(xué)研究
更多相關(guān)文章: 精神分裂癥 代謝組學(xué) 隨機(jī)森林 分類 變量篩選
【摘要】:目的探討隨機(jī)森林對精神分裂癥患者和健康對照的血清代謝組學(xué)數(shù)據(jù)的分類能力,并篩選出差異代謝物。方法病例組為50例精神分裂癥患者,對照組為62例健康個體,收集他們的血清進(jìn)行代謝組學(xué)檢測,然后用隨機(jī)森林對數(shù)據(jù)進(jìn)行分類,用OOB誤差率估計(jì)、五折交叉驗(yàn)證評價分類效果,借助隨機(jī)森林中變量重要性評分(VIM)獲得重要的差異代謝物。結(jié)果隨機(jī)森林對病例組和對照組的血清代謝組學(xué)數(shù)據(jù)分類效果較好。病例組錯分率為4.0%,對照組錯分率為1.6%。OOB誤差率估計(jì)為2.68%,五折交叉驗(yàn)證ROC曲線下面積為0.99,并根據(jù)VIM篩選出15個重要的差異代謝物。結(jié)論將液相色譜-質(zhì)譜代謝組學(xué)技術(shù)與隨機(jī)森林相結(jié)合,能夠篩選出有潛在臨床應(yīng)用價值的代謝物,可用于代謝組學(xué)研究。
【作者單位】: 山東大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院流行病與衛(wèi)生統(tǒng)計(jì)學(xué)系;山東省精神衛(wèi)生中心;
【關(guān)鍵詞】: 精神分裂癥 代謝組學(xué) 隨機(jī)森林 分類 變量篩選
【基金】:國家自然科學(xué)基金(81273177) 山東省自然科學(xué)基金(ZR2013HQ056)
【分類號】:R749.3
【正文快照】: 網(wǎng)絡(luò)出版地址:http://www.cnki.net/kcms/detail/37.1390.R.20141224.0838.008.html精神分裂癥是一種嚴(yán)重的精神疾病,困擾著世界上0.5%~1%的人口[1]。一般人群總患病率約為5.18‰~8.18‰,年發(fā)病率為0.1‰[2]。精神分裂癥是受多基因調(diào)控并受眾多環(huán)境因素影響、與早期神經(jīng)發(fā)育異
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本文編號:770608
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